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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9619#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 727 fasta sequence
[AATATCTTTCCTGGTCTTATTAGTGTTGTGATAAAATTATAACTGACTGCTTTATTT-AATGGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC-AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG-TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC-TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT-CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA-GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTA-TTAAGACTTAAA]
[+] EMBL CD165344 [AATATCTTTCCTGGTCTTATTAGTGTTGTGATAAAATTATAACTGACTGCTTTATTTCAATGGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAG ]
[+] EMBL CD120266 [ TTTATTT AATGGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGg ]
[+] EMBL CD165335 [ TAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAGGGTTCGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGCTTTAC AAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGNTCAGCATCGT ]
[-] EMBL CD094674 [ AATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAA ]
[+] EMBL CD118013 [ TCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTANAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAGTGGTAGTAAATCACGGC AATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTATTTAAAACTAAA ]
[-] EMBL CD118166 [ TCGGGTCAAGATCAGGAAGGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTG AATTGAAAAAGCATGGC ACAAATAAGATCTATCAGACAATCACCTCTTTTGGTTTTGAAGAATAAAT AATTTATTCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTGGGAACCTTTTATTCTGNAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTCGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTA TTAAGACTTAAA]
[-] EMBL CD096805 [ ATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGAGTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTT AAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCAT ]
[-] EMBL CD096804 [ TTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGAGTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTT AAAGGTTTAAAACGCTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTTCCACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCAT ]
[+] EMBL CD118124 [ AATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTACGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTA TAAGACTTAA ]
[-] EMBL CD117942 [ CATCGTGAAGTCGATGGATGGAAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTTTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATCCA TTAAGACTTAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||