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Schistosoma mansoni
cluster # 9619 cluster # 9619       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9619#0 length = 727 sequences # 10  

consensusID : consensus_9619#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 727
fasta sequence
                              [AATATCTTTCCTGGTCTTATTAGTGTTGTGATAAAATTATAACTGACTGCTTTATTT-AATGGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC-AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG-TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC-TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT-CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA-GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTA-TTAAGACTTAAA]

[+] EMBL CD165344             [AATATCTTTCCTGGTCTTATTAGTGTTGTGATAAAATTATAACTGACTGCTTTATTTCAATGGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD120266             [                                                  TTTATTT AATGGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD165335             [                                                                      TAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAGGGTTCGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGCTTTAC AAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGNTCAGCATCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD094674             [                                                                       AATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD118013             [                                                                                                   TCGGTTC AGATCAAGAAAGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACAATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTANAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAGTGGTAGTAAATCACGGC AATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTATTTAAAACTAAA ]
[-] EMBL CD118166             [                                                                                                   TCGGGTCAAGATCAGGAAGGGTTTGTCAAAAAGGAAAGTGCTG AATTGAAAAAGCATGGC ACAAATAAGATCTATCAGACAATCACCTCTTTTGGTTTTGAAGAATAAAT AATTTATTCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTGGGAACCTTTTATTCTGNAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTCGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTA TTAAGACTTAAA]
[-] EMBL CD096805             [                                                                                                                                                                                      ATCAACTCTTTTGG TTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGAGTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTT AAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCAT                                                                                                ]
[-] EMBL CD096804             [                                                                                                                                                                                                      TTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGAGTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTT AAAGGTTTAAAACGCTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTTCCACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCAT                                                                                                ]
[+] EMBL CD118124             [                                                                                                                                                                                                            AATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGATTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAATGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGTGACTGCAGC TTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCATCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTCTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTACGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTA  TAAGACTTAA ]
[-] EMBL CD117942             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      CATCGTGAAGTCGATGGATGGAAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAACACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAGACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTT CACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTTTAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCAATGGAATGGTAGTAAATCA GGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATCCA TTAAGACTTAAA]


>consensus_9619#0 AATATCTTTCCTGGTCTTATTAGTGTTGTGATAAAATTATAACTGACTGCTTTATTTAAT GGAGGAATATAATTGGAAAGATACTAATATGGCTTTATTCGGTTCAGATCAAGAAAGGTT TGTCAAAAAGGAAAGTGCTGAAACTGAAAAAGCATGGCAACAAATAAGATCTATCAGACA ATCAACTCTTTTGGTTTGGAGAATAAATAAATTTAATCTAGAAGTCGTAAAACCAGATGA TTTTGGAACCTTTTATTCTGGAGATTCATATATTATCTTGAATATAGAGAAAGTTGGCAA TGATTATGACTATGATGTTCATTTCTGGATAGGAAAGAAAAGTACTCAAGATGAATATGT GACTGCAGCTTACAAAACTGTAGAGTTGGATACATTTCTAGACGACAGAGCTGTTCAGCA TCGTGAAGTCGATGGATTGGAGTCGAACCAGTTTAAAATGTATTTTAAAAGGTTTAAAAC ACTTGAAGGTGGTTATGAAAGTGGATTTAATCGTGCAAAATCGAATGAATTTAAAACAAG ACTTTTACACTTTCGAGATATTGATTCTTCACATGTTGTATTACGAGAAGTCCCTTGTTC TAAAAAATCTTTAAATTCGGATGATGTTTTCATATTGGATTTAGGATCATTAGTATACCA ATGGAATGGTAGTAAATCAGGCAAATATGAACGATTTAAAAGTGGAGAATATTTATTAAG ACTTAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)