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Schistosoma mansoni
cluster # 963 cluster # 963       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_963#0 length = 793 sequences # 2  

consensusID : consensus_963#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 793
fasta sequence
                              [GAGGAGTTGAAAGAAATCAACCGTTACGTGAGCCACCGATTAAGCGTAATAAACTATTTACTAAGAAGAGATGCTTACGCTTTACTTTAGTGACTTGTTCTCGTTTCATACCGTCACTGTTAGTTTGTTTATTCTGCGAAATGGGTCATTTTTTATGGGCTCAACAGCTTGAAGATTGTCACCAATCATTTTACAATATTTATACAAATAAGTTTAATGAAGCTAATCCCCTAATTAACGATTCTGAGGCATATACTAAAACACTATCATCATCTTATGCCCGTCAAGTATCATGTCTATCTAAATTGTCTATATTAATATGCAGTCTAAAGGATTTAATTTTCTACCAGTTAATCATGTACCTGATTATTATATCATTTTCTTATGCCAATTATGGTCAAAGAGTATGGAAATTCCGATATTCTACAAATCCTTCTTGGTGCATTGTCTCTAGTCTAATATTCATTCTTCATTCAGTTTATATGATCATTCGCTTGTGCATCGTTGATTCTTCTTTAAGATTAACAAGTTGGCACATCCTATCTCCAATCATTTCGGCATTTGGTTNTATCTGGTGCATTTTGCTATTGTTTATTAATGACTTAATATCATGGAGAGAAAAGCGAGCTATTCTGACAGAGCATCGCTTGTCCAGACTTTACTTCNATACANAGNTGGGGTATGTATTCACCCGTTTGAATTTACCANATTCTCTTCATCTCTGGAATAAANGG-AAC-TNTNNCATGGNNNTTC-TTTGCTNTNCTGTTTTATAANTGNNGCT-ATAACTNNNAGA]

[+] EMBL CD082034             [GAGGAGTTGAAAGAAATCAACCGTTACGTGAGCCACCGATTAAGCGTAATAAACTATTTACTAAGAAGAGATGCTTACGCTTTACTTTAGTGACTTGTTCTCGTTTCATACCGTCACTGTTAGTTTGTTTATTCTGCGAAATGGGTCATTTTTTATGGGCTCAACAGCTTGAAGATTGTCACCAATCATTTTACAATATTTATACAAATAAGTTTAATGAAGCTAATCCCCTAATTAACGATTCTGAGGCATATACTAAAACACTATCATCATCTTATGCCCGTCAAGTATCATGTCTATCTAAATTGTCTATATTAATATGCAGTCTAAAGGATTTAATTTTCTACCAGTTAATCATGTACCTGATTATTATATCATTTTCTTATGCCAATTATGGTCAAAGAGTATGGAAATTCCGATATTCTACAAATCCTTCTTGGTGCATTGTCTCTAGTCTAATATTCATTCTTCATTCAGTTTATATGATCATTCGCTTGTGCATCGTTGATTCTTCTTTAAGATTAACAAGTTGGCACATCCTATCTCCAATCATTTCGGCATTTGGTTNTATCTGGTGCATTTTGCTATTGTTTATTAATGACTTAATATCATGGAGAGAAAAGCGAGCTATTCTGACAGAGCATCGCTTGTCCAGACTTTACTTCNATACANAGNTGGGGTATGTATTCACCCGTTTGAATTTACCANATTCTCTTCATCTCTGGAATAAANGG AAC TNTNNCATGGNNNTTC TTTGCTNTNCTGTTTTATAANTGNNGCT ATAACTNNNA  ]
[-] EMBL CD075648             [                                                                                                                                                                                                                          GAAGCTAATCCCCTAATTAACGATTCTGAGGCATATACTAAAACACTATCATCATCTTATGCCCGTCAAGTATCATGTCTATCTAAATTGTCTATATTAATATGCAGTCTAAAGGATTTAATTTTCTACCAGTTAATCATGTACCTGATTATTATATCATTTTCTTATGCCAATTATGGTCAAAGAGTATGGAAATTCCGATATTCTACAAATCCTTCTTGGTGCATTGTCTCTAGTCTAATATTCATTCTTCATTCAGTTTATATGATCATTCGCTTGTGCATCGTTGATTCTTCTTTAAGATTAACAAGTTGGCACATCCTATCTCCAATCATTTCGGCATTTGGTTTTATCTGGTGCATTTTGCTATTGTTTATTAATGACTTAATATCATGGAGAGAAAAGCGAGCTATTCTGACAGAGCATCGCTTGTCCAGACTTTACTTCAATACAAAG TTGGGTATGTATTCACCCGTTTGAATTTACCAAATTCTCTTCATCTCTGGAATAAAAGGAAACTTTTCCCATGG TTTTCTTTTGCTTTTCTGTTTTATAATTG TGCTAATAAacttatga]


>consensus_963#0 GAGGAGTTGAAAGAAATCAACCGTTACGTGAGCCACCGATTAAGCGTAATAAACTATTTA CTAAGAAGAGATGCTTACGCTTTACTTTAGTGACTTGTTCTCGTTTCATACCGTCACTGT TAGTTTGTTTATTCTGCGAAATGGGTCATTTTTTATGGGCTCAACAGCTTGAAGATTGTC ACCAATCATTTTACAATATTTATACAAATAAGTTTAATGAAGCTAATCCCCTAATTAACG ATTCTGAGGCATATACTAAAACACTATCATCATCTTATGCCCGTCAAGTATCATGTCTAT CTAAATTGTCTATATTAATATGCAGTCTAAAGGATTTAATTTTCTACCAGTTAATCATGT ACCTGATTATTATATCATTTTCTTATGCCAATTATGGTCAAAGAGTATGGAAATTCCGAT ATTCTACAAATCCTTCTTGGTGCATTGTCTCTAGTCTAATATTCATTCTTCATTCAGTTT ATATGATCATTCGCTTGTGCATCGTTGATTCTTCTTTAAGATTAACAAGTTGGCACATCC TATCTCCAATCATTTCGGCATTTGGTTNTATCTGGTGCATTTTGCTATTGTTTATTAATG ACTTAATATCATGGAGAGAAAAGCGAGCTATTCTGACAGAGCATCGCTTGTCCAGACTTT ACTTCNATACANAGNTGGGGTATGTATTCACCCGTTTGAATTTACCANATTCTCTTCATC TCTGGAATAAANGGAACTNTNNCATGGNNNTTCTTTGCTNTNCTGTTTTATAANTGNNGC TATAACTNNNAGA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)