|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9638#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 577 fasta sequence
[TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG-AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATCTGTACAAC]
[+] EMBL CD116218 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCGGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATCTGTACAAC]
[+] EMBL CD154514 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTNTCTCAATTTATCTGT ]
[+] EMBL CD154512 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACTAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGCTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGTTCATTTAAATTTTCTCAATTTATC ]
[+] EMBL CD116195 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATATCCAGTACCATGTCCAAATAAATGTGAAAAAACCAAAATTCCAAGAAGTTTGATTTCAGAACATTTAAAGAACGAATGTTCTAGACAAAATATACGTTGTCCTTTCAATGTTCATGGTTGTGAATTTCGTGGTCACAAAAATAAAATTGATACACATTTAGAGAGGTCACTTATGGNTCATTT AATTTTCTCAATTat ]
[+] EMBL CD116069 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCGGAATCTCAGAGAAAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT ]
[+] EMBL CD116101 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGGG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT ]
[+] EMBL CD154382 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAgt ]
[+] EMBL CD154720 [TCTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT ]
[+] EMBL CD154447 [TCTGGATGTGTACTGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGTGGTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAAT ]
[-] EMBL CD116196 [ CTGGATGTGTACCGGATATATTAAGAGGAACTTCAAAATGTCCAGTAGACAAGCAAAATCTGAAAAAAGATCGTGTTCATTTGGACAAAGCATTTCAAGAACACATGGATGGATTGAATGTGCGATGTTCTTATCACACTGAAGGATGCCCATGGATAGGAATTCTCAGTGAATTAGGATATCATCTCAGTCAGTGTGAATATAGAATTGTCCTATGCCCAAATGGGTGT GTGCAGAATCTCAGAG AAAATCTATTGAGAATCATATTAAAAACGATTGTCCAAAGCGTATCAAACGATGCAAATTTTGCAATGTCAAATATATTGCTGAAAAAGAAATTGAACATACAAATAATTGTCGAGAATA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||