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Schistosoma mansoni
cluster # 9644 cluster # 9644       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9644#0 length = 994 sequences # 10  

consensusID : consensus_9644#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 994
fasta sequence
                              [TGCGGCACGAGGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTACAT-TGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT-GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG-TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATTAATTTTATCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CD081384             [TGCGGCACGAGGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGTGAACTATGTACGTACATCTGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD097891             [    attgtttGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTACAT TGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD121042             [                      CAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTACAT TGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD142777             [                                                    TGTACGTACAT TGTGGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD171368             [                                                                                                                                                                       GACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTTGGGAGG TATCTGAACT GAGAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD075218             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATT                                 ]
[-] EMBL CD144197             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 GTTACCCGTCGCTCTCAGGGAAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACA                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL AI977627             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATT                                 ]
[+] EMBL AI014237             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAG TTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAGTTTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATAT                                                                       ]
[-] EMBL AI395005             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   AAGGAAAAAAATTTAACCCCGTCTTTTAACCCAGGTTATCCCCTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATTAATTTTATCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_9644#0 TGCGGCACGAGGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTA CATTGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACA CCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTA GTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGC TAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGG AAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTG AACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAA AGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTC AGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAG CTGAAAGAATAATTCTCGAACTTGGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATAT TGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAG ATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAAC CAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATT TAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAAT ATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAGTTTTTAGTT ACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAAT TAATTTTATCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)