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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9644#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 994 fasta sequence
[TGCGGCACGAGGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTACAT-TGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT-GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG-TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATTAATTTTATCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CD081384 [TGCGGCACGAGGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGTGAACTATGTACGTACATCTGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGAT ]
[+] EMBL CD097891 [ attgtttGCGTACAATTTCAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTACAT TGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAG ]
[+] EMBL CD121042 [ CAAGCAACCCGATACGATGCTCGGGAACTATGTACGTACAT TGTTGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCA ]
[-] EMBL CD142777 [ TGTACGTACAT TGTGGGGACGAGGATGTCCTATCGGGGTGAATTTAGAGAGTGTGAGGAATGTCAACACCTGTTTGCCTTATTCAGAATATTATCCAAATATCTATCCTCAAGTGACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGA ]
[+] EMBL CD171368 [ GACAGGAGAACTTAGTGACCTGGAGTTTCCTCCTGATAGAAGGCGTTTATCTGCTGTCAATCGACAGCCTCAGCTAACAACTGGTACTAAGCCACCTAAATATACAAGACAAAAAATTGACTGGCGTGGTCCGGAAACCTTGTTTAACAAATTAAACTATCGTCAGTACGGAGTACAAGCAATGGAGGGTGGTGAACTTGAGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTTGGGAGG TATCTGAACT GAGAGA ]
[-] EMBL CD075218 [ AGTTTGGTCATTTCGAAATGATGAGGATATCTATCAACAAACATATAGATGAAAAGCGAATGTTCGCGGTATGGGGTGTCGAGGCTCCCTGGAAACCAGTTACCCGTCGCTCTCAGGGGAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATT ]
[-] EMBL CD144197 [ GTTACCCGTCGCTCTCAGGGAAAGAGAAAAGGTGGTGGAAAAGCTAACATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACA ]
[-] EMBL AI977627 [ ATACATCACTATTCTACTCCAGTAAAAGCTGAAAGAATAATTCTCGAACTT GGAGGTTATCTGAACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATT ]
[+] EMBL AI014237 [ AACTGGAGAGAAGCCTATCGTATATTGAGTCGTGCTGCTGATAAGTTGCCATTCCGGGCTAGATTTATTTCCCAAGAGCTTTTAGATACAGAGTCTCAAATAGAGGCTTACATTAAAGAAAAAAATGTAAATCCGTTTTATGAACCAGGTTATGCACTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAG TTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAGTTTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATAT ]
[-] EMBL AI395005 [ AAGGAAAAAAATTTAACCCCGTCTTTTAACCCAGGTTATCCCCTAGCGCACAACTATGCAGGCTGTCGAAGTTTCATTAGTCCGTATTATTTAGATTGGGGTACAAATAGATATCACTGATTCACCCATATACATATAACATTTGTTGAATATATTTATAAATGCTGATGCTGTTTAATTTAAACATCATTGAATGACGAAG TTTTTAGTTACTATTCATCCAAATTTGTATATGAACTAATCTCTAACAATATTTATTTTATAATAAAATTAATTTTATCAAAAGAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||