cluster # 9656

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9656 cluster # 9656 Sequences # 10 consensus # 2

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :

consensus_9656#0 length = 1119 sequences # 9

consensus_9656#1 length = 495 sequences # 1

consensusID : consensus_9656#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 9
consensus length = 1119
fasta sequence

                              [AANATTTGGCACGAGGTCCTTTTGAATTTCAGGCTGCTGTACCCAAATCTTGTCAGTTACAGACTTTTCCCACCATCGTCTAGTTCTATTTCATGTGGCCCTAACTCTACTCCGCTAACACAAGTGCTGAAGCTTAGCGTTCCACCGAAGGTACGTCCACGGATGAAGATTCGTCTGCAGTTTGTCAAAAACGGTGAGACAAAAACTGACGAGTTTCAACTCGATGACTTTCCACAAGTATTGTGGCAGTAATATTTGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCTGTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCATTATTAATATTTTGAATTCTCCGTATTATAGTTTTATTTTTTCTGTGATGCAATTATTCTGTTCATTATTTGACAACTAATTGGTTTAAAAAGGTATACTATTGTAAAACGTAAAGTTAAATATAGGTGTTCATTCAGTTGTGGCAGTTATACTGTTTGNCAGT-ATTACACCCT]

[+] EMBL CD079696             [AANATTTGGCACGAGGTCCTTTTGAATTTCAGGCTGCTGTACCCAAATCTTGTCAGTTACAGACTTTTCCCACCATCGTCTAGTTCTATTTCATGTGGCCCTAACTCTACTCCGCTAACACAAGTGCTGAAGCTTAGCGTTCCACCGAAGGTACGTCCACGGATGAAGATTCGTCTGCAGTTTGTCAAAAACGGTGAGACAAAAACTGACGAGTTTCAACTCGATGACTTTCCACAAGTATTGTGGCAGTAATATTTGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD134419             [                                                                 tccttCACCATCGTCTAGTTCTATTTCATGTGGCCCTAACTCTACTCCGCTAACACAAGTGCTGAAGCTTAGCGTTCCACCGAAGGTACGTCCACGGATGAAGATTCGTCTGCAGTTTGTCAAAAACGGTGAGACAAAAACTGACGAGTTTCAACTCGATGACTTTCCACAAGTATTGTGGCAGTAATATTTGAAGAATCTTCTATAAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTGTCGGCAATATTAACANATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGAATAATTTAATTTCCTTTATCCTTGATACACTTGTTTTTTTGGTTATGGCAAAATCTTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD148010             [                                                                                                                                                         CGTCCACGGATGAAGATTCGTCTGCAGTTTGTCAAAAACGGTGAGACAAAAACTGACGAGTTTCGACTCGATGACTTTCCACAAGTATTGTGGCAGTAATATTTGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAAACATTAATATGCTGTTTCTTGTTTGTATAAAGTGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD081935             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCTGTGTTTACTGCTAAAACTNTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCACTATTAATATTTTGAATTCTCCGTATTATAGTTNTATTTTTTCTGTGATGCAATNATTCTNGTCATTATTTGACAACTAATTGGNTTTAAAAGGTATACTATTGTAAAACGT AAGTCAATTATAG                                                 ]
[-] EMBL CD073955             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   GCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCTGTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCATTATTAATATTTTGAATTCTCCGTATTATAGTTTTATTTTTTCTGTGATGCAATTATTCTGTTCATTATTTGACAACTAATTGGTTTAAAAAGGTATACTAGTGTAAAACGTAAAGTTAAAAATAGG                                                ]
[+] EMBL CD083051             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             CACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCTGTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCATTATTAATATTTTGAATTCTCCGTATTATAGTTTTATTTTTTCTGTGATGCAATTATTCTGTTCATTATTTGACAACTAATTGGTTTAAAAAGGTATACTATTGTAAAACGTAAAGTTCAATATAGGTGTTCATTCAGTTGTGGCAGTTATACTGTTTGNCAGT ATTACACCC ]
[+] EMBL CD201808             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCCTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTA                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD076626             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              TGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCTGTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCATTATTAATATTTTGAATTCTCCGTATTATAGTTTTATTTTTTCTGTGATGCAATTATTCTGTTCATTATTTGACAACTAATTGGTTTAAAAAGGTATACTATTGTAAAACGTAAAGTTCAATATAGGTGTTCATTCAGTTGTGGCAGTTATACTGTTTGCAAGTAATTACACCtt]
[+] EMBL CD136444             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         GTATTTTATTTGAGCTGACAATTACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACAGACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAGTTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCTGTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCACTATTAATATT                                                                                                                                                                    ]




>consensus_9656#0
AANATTTGGCACGAGGTCCTTTTGAATTTCAGGCTGCTGTACCCAAATCTTGTCAGTTAC
AGACTTTTCCCACCATCGTCTAGTTCTATTTCATGTGGCCCTAACTCTACTCCGCTAACA
CAAGTGCTGAAGCTTAGCGTTCCACCGAAGGTACGTCCACGGATGAAGATTCGTCTGCAG
TTTGTCAAAAACGGTGAGACAAAAACTGACGAGTTTCAACTCGATGACTTTCCACAAGTA
TTGTGGCAGTAATATTTGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTC
AAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATT
TATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGA
CTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAAT
TTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCA
ATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGA
TAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTC
TGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATT
ACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACA
GACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAG
TTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCT
GTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCATTATTAATATTTTGA
ATTCTCCGTATTATAGTTTTATTTTTTCTGTGATGCAATTATTCTGTTCATTATTTGACA
ACTAATTGGTTTAAAAAGGTATACTATTGTAAAACGTAAAGTTAAATATAGGTGTTCATT
CAGTTGTGGCAGTTATACTGTTTGNCAGTATTACACCCT

consensusID : consensus_9656#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 495
fasta sequence

                              [GGAATTGGCCTCGAGGCCANGAATCGGCACGAGGGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATCTTATTTGAGCTGACAA]

[+] EMBL CD083731             [GGAATTGGCCTCGAGGCCANGAATCGGCACGAGGGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATCTTATTTGAGCTGACAA]




>consensus_9656#1
GGAATTGGCCTCGAGGCCANGAATCGGCACGAGGGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAA
ACCATTCATCAACTCTCAAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCT
GTGCTTAATCGTGTATTTATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGT
GTTATGTGTACCCAAGACTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTA
ATTGGCTTGTTATTAATTTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTT
TGCATATCGTTTCGGCAATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGC
TACTACTGATCTTGGGATAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTT
TATGTCAAAATCTTGTCTGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATCT
TATTTGAGCTGACAA

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9656#0      AANATTTGGCACGAGGTCCTTTTGAATTTCAGGCTGCTGTACCCAAATCTTGTCAGTTAC 60
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      AGACTTTTCCCACCATCGTCTAGTTCTATTTCATGTGGCCCTAACTCTACTCCGCTAACA 120
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      CAAGTGCTGAAGCTTAGCGTTCCACCGAAGGTACGTCCACGGATGAAGATTCGTCTGCAG 180
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      TTTGTCAAAAACGGTGAGACAAAAACTGACGAGTTTCAACTCGATGACTTTCCACAAGTA 240
consensus_9656#1      -------------------------------------------GGAATTGGCCTCGAGGC 17
                                                                    * *  ** * **  

consensus_9656#0      TTGTGGCAGTAATATTTGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTC 300
consensus_9656#1      CANGAATCGGCACGAGGGAAGAATCTTCTATGAACTAAACAAAACCATTCATCAACTCTC 77
                              *  *     *******************************************

consensus_9656#0      AAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATT 360
consensus_9656#1      AAGTCTAACCCAGAGTAAATCTGGAGTTATTTTTATTCTGGCTGTGCTTAATCGTGTATT 137
                      ************************************************************

consensus_9656#0      TATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGA 420
consensus_9656#1      TATGCGAAAATCATTAATATGCTGTTTTTTGTTTGTATAAAGTGTTATGTGTACCCAAGA 197
                      ************************************************************

consensus_9656#0      CTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAAT 480
consensus_9656#1      CTGTTTATTGAAATTGCCACAGTGCCTCCATTGTTTCTTGTTAATTGGCTTGTTATTAAT 257
                      ************************************************************

consensus_9656#0      TTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCA 540
consensus_9656#1      TTTCAACCAGCTCCACATTCTAATATCATGTGATTCTAATTTTTGCATATCGTTTCGGCA 317
                      ************************************************************

consensus_9656#0      ATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGA 600
consensus_9656#1      ATATTAACAAATAAACCCGACATGCAAATTTTCACTTTGTTGCTACTACTGATCTTGGGA 377
                      ************************************************************

consensus_9656#0      TAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTC 660
consensus_9656#1      TAAATTTAATTTCTTTTATCTTTGATACACTTGTTTTTTTGTTTATGTCAAAATCTTGTC 437
                      ************************************************************

consensus_9656#0      TGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATTTTATTTGAGCTGACAATT 720
consensus_9656#1      TGTTTCGTGATGTTTAATGGTCTATTTTATATCAGAAGTATCTTATTTGAGCTGACAA-- 495
                      ***************************************** ****************  

consensus_9656#0      ACAGGTATGCGTACAATTGATATTTCAACATTCCGACTGTCTTCATGATCACATGTAACA 780
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      GACTGGTCCTCTGGATTAATTAATGGTTGACCGATCGATTGCTTTTCTCAAACTTGTCAG 840
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      TTTGAATTAAAATCCTAATAGAATTTCGTTCATTGTCAGTCAGTTACTCCCATGAACTCT 900
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      GTGTTTACTGCTAAAACTTTCCATGTGAAATCAAACTTTTATGCATTATTAATATTTTGA 960
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      ATTCTCCGTATTATAGTTTTATTTTTTCTGTGATGCAATTATTCTGTTCATTATTTGACA 1020
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      ACTAATTGGTTTAAAAAGGTATACTATTGTAAAACGTAAAGTTAAATATAGGTGTTCATT 1080
consensus_9656#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9656#0      CAGTTGTGGCAGTTATACTGTTTGNCAGTATTACACCCT 1119
consensus_9656#1      ---------------------------------------