cluster # 9670

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9670 cluster # 9670 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9670#0 length = 1967 sequences # 10
consensusID : consensus_9670#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1967
fasta sequence
                              [CGGAGCCTGNATTCGGCACGAGGTGTATTTTTAACTATGTGTACACGTGCCTATTTATTGTGACACANGTTGGATTATAAAAGTTAAAATTAAAAAACAAACAAACAACTTTACAATAAGAATAGTACAAGTTTTAGACAATGTCTGGACAATGTGTTATTAAAAACAAACAAACAGCATTAGTAATAATAACAATAGTAATTGTTATTTAATAATGATATCTAATTATTGTTGTTCGTATACAATTTATACATATATATTTGTATATGCATAAACAATTATGAAAGATGAAAGGCATTTTGACCCTCATTAATTGCATATAATAATTTAGAAAGCATCAATTCTTTAGATGAATAATCTGGAAGTTTTAAATAATTTTGACATGTCATAACAGAAGGTAAATGATGATCAACATTTTCACCTGTCTCTCGTTTCATGACAATTTTTAATGGAGGTTTTAATGCACGAAAACCGCCAACTGGTAAACGAGGACTGCCAGTCACAAACTGTACAAATAATCTTCGTTGTTCTGGAGTGAATTCAGACATAATTTCAAACAGAAGACGAATAGCACGTGATTGTGGAGTATAGCCATGATCACAACAACATGA-TTGAGTTAAGCTTTGTACATCCCAACCTTCTTCATCTGTCAATGAATAATTTTTATCTGATAATTGCATAGATTTTATTTCACCA-GTTTGATTAATTGATAAGGAATTAAATCTAGGTGATGATTCACCACAGAATAAATTCTCCATTTCATCTGGTTGAAATAATGTAGTT--AACCGCGAACGAACATTAGGTAGAACCGAGTCGAAACCTT-TT-AAAACTGCTTCCATTTGACGACTTGCACCTTCAATAACTAACCAATGAGCAACTAAACGAAGGTAACAGCTTAAATTAGCGCCTGTAACATTAGTATGTGCACCATTTTTAATTAACTCAACCTCGTAACCTGGAAGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGAC-CTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTTCCGGATAGAATCACTTGCTGTAGGTGCTAAGAACCATTTGAAAAATGCTGGTGAAAAAGGCAAATCTAACCGTCGCCAATCTAACAATGCTCTAGCTAATAAACGGCCCAGAAAATTGAATTTCCCACAAACCTCCCGTATAACTGAAGAT-TTAGTTTGTCATTGAAAATGGACGAGGACTAAAGTCCCGGCGCTGGAGCAATCAAATATCCATCCGAAGTAGATTCACAACCATGCCAAAGACTTAAATTAGATTTCATTAACAAACGACTTATCAATGTGTAAAATTCAAGTGTTGGACCAAGACCAAATCCAACTTCACCCTCAAAAGCAATTTCTAATACTGCACGTGAATCACCCATTTCATTTAATGTCATTTCAGCTTGTTTCAGTAGACGTTTTTCATCTCGATTAACAGTAACTTTATGCCGACGAAAGTTTGGTGACAAGGCCAGGCGTAAATGGTATCTTCCACGTGTTCCTAAATTATTTCTTCCATTATCTTGTCTGTTATGTTCTTGAGAAGACGTAGATGATAGTCCAGAACTGTGATCAAACAATTGTGTGTTGAATGAAGACTGAGAGAATGCGTTAAGTTGAGCTAGCAGAGATGTAGAGTTTGATGATGAACTAGTCATACCACCTCCTCCACCTTGTAAACCAGCAATAAATGTAGGCTGATTATCATGAATACCATGAGATAACAATGGCATA]

[+] EMBL CD081555             [CGGAGCCTGNATTCGGCACGAGGTGTATTTTTAACTATGTGTACACGTGCCTATTTATTGTGACACANGTTGGATTATAAAAGTTAAAATTAAAAAACAAACAAACAACTTTACAATAAGAATAGTACAAGTTTTAGACAATGTCTGGACAATGTGTTATTAAAAACAAACAAACAGCATTAGTAATAATAACAATAGTAATTGTTATTTAATAATGATATCTAATTATTGTTGTTCGTATACAATTTATACATATATATTTGTATATGCATAAACAATTATGAAAGATGAAAGGCATTTTGACCCTCATTAATTGCATATAATAATTTAGAAAGCATCAATTCTTTAGATGAATAATCTGGAAGTTTTAAATAATTTTGACATGTCATAACAGAAGGTAAATGATGATCAACATTTTCACCTGTCTCTCGTTTCATGACAATTTTTAATGGAGGTTTTAATGCACGAAAACCGCCAACTGGTAAACGAGGACTGCCAGTCACAAACTGTACAAATAATCTTCGTTGTTCTGGAGTGAATTCAGACATAATTTCAAACAGAAGACGAATAGCACGTGATTGTGGAGTATAGCCATGATCACAACAACATGA TTGAGTTAAGCTTTGTACATCCCAACCTTCTTCATCTGTCAATGAATAATTTTTATCTGATAATTGCATAGATTTTATTTCACCA GTTTGATTAATTGATAAGGAATTAAATCTAGGTGATGATTCACCACAGAATAAATTCTCCATTTCATCTGGTTGAAATAATGTAGTT  AACCGCGAACGAACATTAGGTAGAACCGAGTCGAAACCTT TT AAAACTGCTTCCATTTGACGACTTGCACCTTCAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD075380             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ATGATCACANC ACATGATTTGAGTTAAGCTTTGTACATCCCAACCTTCTTCATCTGTCAATGAATAATTTTTATCTGATAATTGCATAGATTTTATTTCACCA GTTTGATTAATTGATAAGGAATTAAATCTAGGTGATGATTCACCACAGAATAAATTCTCCATTTCATCTGGTTGAAATAATGTAGTT  AACCGCGAACGAACATTAGGTAGAACCGAGTCGAAACCTT TT AAAACTGCTTCCATTTGACGACTTGCACCTTCAATAACTAACCAATGAGCAACTAAACGAAGGTAACAGCTTAAATTAGCGCCTGTAACATTAGTATGTGCACCATTTTTAATTAACTCAACCTCGTAACCTGGAAGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGACACT  GT TGGAgcggcgtg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD072013             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AGATTTTATTTCACCANGTTTGATTAATTGATAAGGAATTAAATCTAGGTGATGATTCACCACAGAATAAATTCTCCATTTCGTCTGGTTGAAATAATGTAGTT  AACCGCGAACGAACATTAGGTAGAACCGAGTCGAAACCTT TT AAAACTGCTTCCATTTGACGACTTGCACCTTCAATAACTAACCAATGAGCAACTAAACGAAGGTAACAGCTTAAATTAGCGCCTGTAACATTAGTATGTGCACCATTTTTAATTAACTCAACCTCGTAACCTGGAAGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCNACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD068945             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gtcagcAGTTTCAGCCCCGAACGAACATTAGGTAGAACCGAGTCGAAACCTT TT AAAACTGCTTCCATTTGACGACTTGCACCTTCAATAACTAACCAATGAGCAACTAAACGAAGGTAACAGCTTAAATTAGCGCCTGTAACATTAGTATGTGCACCATTTTTAATTAACTCAACCTCGTAACCTGGAAGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGAC CTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTTCCGGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD068965             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TAGAACCGAGTCGAAACCTTGTTGAAAACTGCTTCCATTTGACGACTTGCACCTTCAATAACTAACCAATGAGCAACTAAACGAAGGTAACAGCTTAAATTAGCGCCTGTAACATTAGTACGTGCACCATTTTTAATTAACTCAACCTCGTAACCTGGAAGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGAC CTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD194563             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        CCTCGTAACCTGGAAGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGAC CTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD068964             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGAC CTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTTCCGGATAGAATCACTTGCTGTAGGTGCTAAGAACCATTTGAAAAATGCTGGTGAAAAAGGCAAATCTAACCGTCGCCAATCTAACAATGCTCTAGCTAATAAACGGCCCAGAAAATTGAATTTCCCACAAACCTCCCGTATAACTGAAGATCTTAGTTTGTCATTGAAAATGGACGAGGACTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD068953             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AACATGCTTAAAGAAGCTTTAATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCATTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTTGATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGTCGAC CTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTTCCGGATAGAATCACTTGCTGTAGGTGCTAAGAACCATTTGAAAAATGCTGGTGAAAAAGGCAAATCTAACCGTCGCCAATCTAACAATGCTCTAGCTAATAAACGGCCCAGAAAATTGAATTTCCCACAAACCTCCCGTATAACTGAAGAT TTAGTTTGTCATTG AAATGGACGAGGACTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD118487             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTAGCTAATAAACGGCCCAGAAAATTGAATTTCCCACAAACCTCCCGTATAACTGAAGAT TTAGTTTGTC TTGAAAATGGACGAGGA TAAAGTCCCGGCGCTGGAGCAATCAAATATCCATCCGAAGTAGATTCACAACCATGCCAAAGACTTAAATTAGATTTCATTAACAAACGACTTATCAATGTGTAAAATTCAAGTGTTGGACCAAGACCAAATCCAACTTCACCCTCAAAAGCAATTTCTAATACTGCACGTGAATCACCCATTTCATTTAATGTCATTTCAGCTTGTTTCAGTAGACGTTTTTCATCTCGATTAACAGTAACTTTATGCCGACGAAAGTTTGGTGACAAGGCCAGGCGTAAATGGTATCTTCCACGTGTTCCTAAATTATTTCTTCCATTATCTTGTCTGTTATGTTCTTGAGAAGACGTAGATGATAGTCCAGAACTGTGATCAAACAATTGTGTGTTGAATGAAGACTGAGAGAATGCGTTAAGTTGAGCTAGCAGAGATGTAGAGTTTGATGATGAACTAGTCATACCACCTCCTCCACCTTGTAAACCAGCAATAAATGTAGGCTGATTATCATGAATACCATGAGATAACAATGGCATA]
[+] EMBL CD146946             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GGCGCTGGAGCAATCAAATATCCATCCGAAGTAGATTCACAACCATGCCAAAGACTTAAATTAAATTTCATTAACAAACGACTTATCAATGTGTAAAATTCAAGTGTTGGACCAAGACCAAATCCAACTTCACCCTCAAAAGCAATTTCTAATACTGCACGTGAATCACCCATTTCATTTAATGTCATTTCAGCTTGTTTCAGTAGACGTTTTTCATCTCGATTAACAGTAACTTTATGCCGACGAAAGTTTGGTGACAAGGCCAGGCGTAAATGGTATCTTCCACGTGTTCCTAAATTATTTCTTCCATTATCTTGTCTGTTATGTTCTTGAGAAGACGTAGATGATAGTCCAGAACTGTGATCAAACAATTGTGTGTTGAATGAAGACTGAGAGAATGCGTTAAGTTGAGCTAGCAGAGATGTAGAGTTTGATGATGAACTAG                                                                                ]




>consensus_9670#0
CGGAGCCTGNATTCGGCACGAGGTGTATTTTTAACTATGTGTACACGTGCCTATTTATTG
TGACACANGTTGGATTATAAAAGTTAAAATTAAAAAACAAACAAACAACTTTACAATAAG
AATAGTACAAGTTTTAGACAATGTCTGGACAATGTGTTATTAAAAACAAACAAACAGCAT
TAGTAATAATAACAATAGTAATTGTTATTTAATAATGATATCTAATTATTGTTGTTCGTA
TACAATTTATACATATATATTTGTATATGCATAAACAATTATGAAAGATGAAAGGCATTT
TGACCCTCATTAATTGCATATAATAATTTAGAAAGCATCAATTCTTTAGATGAATAATCT
GGAAGTTTTAAATAATTTTGACATGTCATAACAGAAGGTAAATGATGATCAACATTTTCA
CCTGTCTCTCGTTTCATGACAATTTTTAATGGAGGTTTTAATGCACGAAAACCGCCAACT
GGTAAACGAGGACTGCCAGTCACAAACTGTACAAATAATCTTCGTTGTTCTGGAGTGAAT
TCAGACATAATTTCAAACAGAAGACGAATAGCACGTGATTGTGGAGTATAGCCATGATCA
CAACAACATGATTGAGTTAAGCTTTGTACATCCCAACCTTCTTCATCTGTCAATGAATAA
TTTTTATCTGATAATTGCATAGATTTTATTTCACCAGTTTGATTAATTGATAAGGAATTA
AATCTAGGTGATGATTCACCACAGAATAAATTCTCCATTTCATCTGGTTGAAATAATGTA
GTTAACCGCGAACGAACATTAGGTAGAACCGAGTCGAAACCTTTTAAAACTGCTTCCATT
TGACGACTTGCACCTTCAATAACTAACCAATGAGCAACTAAACGAAGGTAACAGCTTAAA
TTAGCGCCTGTAACATTAGTATGTGCACCATTTTTAATTAACTCAACCTCGTAACCTGGA
AGTGTGAAATTTAGGCACAAATCATCAACCTCATTGTCTAACATGGCTAAAGAAGCTTTA
ATTGAATCCAACTTTTGTGTTTGATGATGATGGTGATGTACGCTTTTAATATTAATTGCA
TTGTTTAAATAAACTCCGCCCAAGGAAACAGATGATGGAAGATTTGAAGCATCTAAATTT
GATAATTGATGACATAAAGCTTGACGACGATTAACCAATTCTGTTAACTGTCTTATGTGT
CGACCTAAGTCTGGATCTATTAATGATAAATCACTTGGTAAAATATGACCTTTCCGGATA
GAATCACTTGCTGTAGGTGCTAAGAACCATTTGAAAAATGCTGGTGAAAAAGGCAAATCT
AACCGTCGCCAATCTAACAATGCTCTAGCTAATAAACGGCCCAGAAAATTGAATTTCCCA
CAAACCTCCCGTATAACTGAAGATTTAGTTTGTCATTGAAAATGGACGAGGACTAAAGTC
CCGGCGCTGGAGCAATCAAATATCCATCCGAAGTAGATTCACAACCATGCCAAAGACTTA
AATTAGATTTCATTAACAAACGACTTATCAATGTGTAAAATTCAAGTGTTGGACCAAGAC
CAAATCCAACTTCACCCTCAAAAGCAATTTCTAATACTGCACGTGAATCACCCATTTCAT
TTAATGTCATTTCAGCTTGTTTCAGTAGACGTTTTTCATCTCGATTAACAGTAACTTTAT
GCCGACGAAAGTTTGGTGACAAGGCCAGGCGTAAATGGTATCTTCCACGTGTTCCTAAAT
TATTTCTTCCATTATCTTGTCTGTTATGTTCTTGAGAAGACGTAGATGATAGTCCAGAAC
TGTGATCAAACAATTGTGTGTTGAATGAAGACTGAGAGAATGCGTTAAGTTGAGCTAGCA
GAGATGTAGAGTTTGATGATGAACTAGTCATACCACCTCCTCCACCTTGTAAACCAGCAA
TAAATGTAGGCTGATTATCATGAATACCATGAGATAACAATGGCATA
clustalw multiple alignements is not computed in this case