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Schistosoma mansoni
cluster # 9677 cluster # 9677       Sequences # 10       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9677#0 length = 1104 sequences # 10  

consensusID : consensus_9677#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 1104
fasta sequence
                              [CCAATTTANATTCGCAACGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGTGTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAACGAACCTTTGCGAAA-C-ACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAA-TTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAGAAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC]

[-] EMBL CD150667             [CCAATTTANATTCGCAACGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGTGTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD163438             [       aaATTCGCAATGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGTGTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD116737             [                                                                                            CCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTCATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAGTTGGAAAACTATGCAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD117147             [                                                                                                              ACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACANAGTGAATTGGAAAACTATGCAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD181281             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          GTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAACGAACCTTTGCGAAA CAACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATNGATGTGGATTTACTAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD112409             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TCAGCGTCTTTCGCGAGCATTTAATATATCAATCCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGCTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAACGAACCTTTGCGAAACC ACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAGCTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTT                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD127912             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gtcAAATA GTAGGTTGTTGGGTACCTTTACGAACCTTTGCGAAA C ACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGGGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAGCGAGAGCATTCGATATGAATTTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAG                        ]
[-] EMBL CD181760             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              nCTATGCAGG TGTTGGGTACCTAAACGACCCTTTGCGAAA CAACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCT                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD121528             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAA TTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAGAAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC]
[-] EMBL CD121563             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAA TTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAGAAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC]


>consensus_9677#0 CCAATTTANATTCGCAACGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGT GTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTT ATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACT CTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGA CCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGG TCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGC CTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTC AAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCG AGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGT CCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAA CGAACCTTTGCGAAACACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAA CGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATT GATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGC AATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGC ATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGA GTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATG TTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTT TTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAATTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAG AAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)