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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9677#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1104 fasta sequence
[CCAATTTANATTCGCAACGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGTGTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAACGAACCTTTGCGAAA-C-ACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAA-TTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAGAAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC]
[-] EMBL CD150667 [CCAATTTANATTCGCAACGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGTGTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCC ]
[+] EMBL CD163438 [ aaATTCGCAATGTCGGTTAGGAGGTATACTGATCCTGTATATCTCCAGTTTGTGTGGAATGCAATTGAAGCATGCTCAAGAGATTCCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACC ]
[-] EMBL CD116737 [ CCATCGAGTCTTCTTTCCACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTCATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAGTTGGAAAACTATGCAGG ]
[+] EMBL CD117147 [ ACGAGTTGTTATCCTTTATTCAAAGAGAATGTGATTCTAGATGCACTGCAGGGAAACTGCAAAATGAACTCTCAAATGCCATAAGCGATGGTTGTATAGAGTGTAACCAACGCTGTTATGTGAAACGCGACCCAATGCCCAAAACGAAGGATAAACATGACTGGTATTGCTTTGAATGTCACGGACCAGGTCTTGTTGTATCTTGTCCAACTTGTTTCAGAGTATACCATCCCGATTGCTTACCAGTTGCCTTATCATCACAATTGTCCCGTGTTATACCGTGTGAATCTGGTGAATCCGAAGCCGATTCAAATATGTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACANAGTGAATTGGAAAACTATGCAG ]
[+] EMBL CD181281 [ GTCCAGTGGATTCCCACCGATTAGCCCGTGTCCTGTTTGTCAGCGGCTGTCGCGAGCATCTAATATATCAAATCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGGTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAACGAACCTTTGCGAAA CAACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATNGATGTGGATTTACTAAT ]
[-] EMBL CD112409 [ TCAGCGTCTTTCGCGAGCATTTAATATATCAATCCCTAGCACCCCATCAGAGTTGCATAAGATCTTCCAGCTTGTCCTTGATCGAATCCGCAACAAAGTGAATTGGAAAACTATGCAGGTTGTTGGGTACCTAAACGAACCTTTGCGAAACC ACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAGCTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTT ]
[+] EMBL CD127912 [ gtcAAATA GTAGGTTGTTGGGTACCTTTACGAACCTTTGCGAAA C ACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGGGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAGCGAGAGCATTCGATATGAATTTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAG ]
[-] EMBL CD181760 [ nCTATGCAGG TGTTGGGTACCTAAACGACCCTTTGCGAAA CAACTACCTCGTATTACGGCAAATTAATACTCGTCTTATGACCGAACGTATGCGAGCAGATCCATCATCTAAAGATTGTTATCCTAATCGAACTTCCCTTCTGATTGATGTGGATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCT ]
[-] EMBL CD121528 [ ATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAA TTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAGAAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC]
[-] EMBL CD121563 [ ATTTACTAATTCATAACACCGCCATTTTTTACGGTTCTAAAAACGATATGAGCAATATGGCTCGACAGATACGATCTCAGCTAGAACGAGAATTGCGAGAATCTTCTTTTTGCATAGATTGTTACTTGCGTCTTCACTCAGCATCAGTAAATAAATTAACAGCACCTTGTCGAGTTGCTCATCGTCTCCTTTGGTTCCAACACAATGGGTGGTCCTTTCGCCCTTGTAAAATGTTATATCAGAGTACAGAGGGCTACGAAGTAGTTTGCTTTGGTGGACGACATGAGAGAGTTTTTGTCCCACTAACGAGAGCATTCGATATGAA TTTACAGCAGACGAACTTGGTTTACGAGAAACACCACCTTTGAAAAAAGCAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||