cluster # 9678

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9678 cluster # 9678 Sequences # 10 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9678#0 length = 478 sequences # 10
consensusID : consensus_9678#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 10
consensus length = 478
fasta sequence
                              [AATTTATTTTTGGAAAAAAAAGAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGAATCTTCACATTATTTTATTGG-TTTTTTTTTAAAATTAATTATTATAGTCATTATTTTTATCTATCACACTGATTAATGTCAGTTTACAATAAGA]

[+] EMBL AW017046             [AATTTATTTTTGGAAAAAAAAGAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATTCAGAAAAGTTCAATTGAAAAAAATATACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGGTGTTAGATTTCTTCTGAGAAAAAACGGAATCTTCACATTATTTTATTGG TTTTTTTTTAAAGTTAATTATTATAGGCATTATTTTTATCTATCACACTGATTAATGTCAGc           ]
[+] EMBL AI977255             [AATTTATTTTTGGAAAAAAAAGAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGGTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGAATCTTCACATTATTTTATTGG TTTTTTTTTAAAATTAATTATTATAGTCATTATTTTTATCTATCACACTGATTAATGc               ]
[+] EMBL SMAA43822            [AATTTATTTTTGG AAAAAAAGAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATAGGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAANTNAACAAATTTTCTAAA                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD186936             [   cttTTTTTGGAAAAAAAAGAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAAT AAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAAa                                                                                                  ]
[-] EMBL CD133792             [                     GAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCACGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGAATCTTCACATTATTTTATTGG TTTTTTTTTAAAATTAATTATTATAGTCATTATTTTTATCTATCACACTGATTAATGTCAGTTTACAATAAGA]
[-] EMBL CD185102             [                     GAATTGATCGATGAAGTAGATTTCACAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGA                                                                                               ]
[-] EMBL CD185248             [                     GAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGCAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGA                                                                                               ]
[-] EMBL CD185446             [                     GAACTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAAT AAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTT                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD185587             [                     GAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATCACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATGGACAATTTACTACAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGAGAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGAATCTTCACATTATTTTATTGGTTTTTTTTTTAAAATTAATTATTATAGTCATTATTTTTATCTATCACACTGATTAATGTCAGTTTACAATAAaa]
[+] EMBL CD185094             [                                                                                                                                                                              ATTTGAGAAAT AAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAATAAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCAGAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTTAGTT                                                                                                                   ]




>consensus_9678#0
AATTTATTTTTGGAAAAAAAAGAATTGATCGATGAAATAGATTTCTCAAAGGATAAAATC
ACATCAAAGTAATATGATGATGACGATGTAATAATAGCTCGATAAATTGACAATTTACTA
CAACCACTAATAGTAAAATAATTTCAAAATCAATAACTTTTGACAGACGACAAAATTTGA
GAAATAAAAAAAAGTCGTCATTCATATGGTTAGATACAGAAAAGTACAATTGAAAAAAAT
AAACAAAATTTCTAAAATATAATAAGCGTACACATCATTATTATCGTCATCATCTTTGCA
GAGTTGTACCCATGCTTCATAAAAAATAATGGATCGTTTTAAGCTTTTTTTGTTGTTGTT
AGTTTTCTTCTGAGAAAAAACGGAATCTTCACATTATTTTATTGGTTTTTTTTTAAAATT
AATTATTATAGTCATTATTTTTATCTATCACACTGATTAATGTCAGTTTACAATAAGA
clustalw multiple alignements is not computed in this case