These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9692#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 776 fasta sequence [ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATTTCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAGATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAGAGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGCACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG-AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCACATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGATGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA] [+] EMBL CD153338 [ACTAACTAGTTGCGGAGGATCGACCAATGTTAATCGGCCAAGACATTCTGAGACTAGATTTCGTGTACCTTCTTCCGATAAACCAGAACATGCTAATAAAAGGGACCACATTGAATCTAGATGATGTTTCAAAGATTGATTAGGATCCAGACCAGCAAGATTAACAAGAACCTCTCTAAGAGCTTGAATTAAATAATATAATTGATGTTGACTTGTGTTATTTTTACTACCTATGCCAGCACCGCCACTGCCACTACTGCTGCTGCTAGTAAGAGATCCTGAGGTGTTTGTCAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGncacagcga ] [+] EMBL CD069744 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ] [+] EMBL CD069748 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ] [+] EMBL CD069719 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGTGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ] [+] EMBL CD069740 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AGATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ] [+] EMBL CD069785 [ CAGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGAGCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGAT ] [-] EMBL CD069751 [ AGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTGAAAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG ] [-] EMBL CD069734 [ AGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAACGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG ] [-] EMBL CD069752 [ AGTTGCATATGTTGTTTTACAGCTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG ] [-] EMBL CD069743 [ AGTTGCATATGTTGTTTTACAACTTGTG AAATGCTTTCGATTAATGGTGGTAAAAGAATTTCTGGTTTACCAACGACCAATCGACCTAAACTTAACGCTGCTGCTGGTTTGACTTCTTCACTGACCATGAGTCCATTGGATGATATCGTGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGATGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCACCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATG ] [+] EMBL CD148158 [ TGGAATGAGATAAACCAGTTGAAGTATGCGGTGTTGGTTGCTGATAATGATAAGGTGAATTGTTGGTTGACGACAGGCAAGAAATTAATAGATCGCGAAGATCTGTACGTGAACTCAAATCAACTTTACGACCTAGTTCGCCCAAAATAAGCAAATTTAGATATAATTGTGTTGGAGATGTAGAAGGATCCTTGACAGATATTAACAACTGATCAACCACATTGTTTACACTACTCAGTAAACTGTCGGCATGAGGTGATAATAATGACGGTGAATTCGATGAAGTCATTGGTAGTTCAGCTAATAGAGCAGCTATACATTGAGCTAAACTAGGCA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||