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Schistosoma mansoni
cluster # 9708 cluster # 9708       Sequences # 11       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9708#0 length = 430 sequences # 11  
consensusID : consensus_9708#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 430
fasta sequence 
                              [TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAAA]

[+] EMBL CD070995             [TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAA ]
[+] EMBL CD070985             [TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTGTGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCTGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGnta ]
[+] EMBL CD070938             [TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAA ]
[+] EMBL CD070976             [TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCT AAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAA ]
[+] EMBL CD071020             [TGCAAACTTGCCACAGCATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAA ]
[+] EMBL CD070953             [TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGGTTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAA ]
[+] EMBL CD070992             [TGCAAACTTGCCACAGTATGTGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCT AAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAA ]
[-] EMBL CD071000             [ GCAAACTTGCCACAGCATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGTTTCTGAGGAGAAGATAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAAA]
[-] EMBL CD070956             [ GCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAAA]
[-] EMBL CD070989             [ GCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAAA]
[-] EMBL CD070971             [                                                         TTTTAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTGTCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGCAGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGAGTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGATCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAAAAGTGATTCTGAGGAGGAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCATATACGTAAA]




>consensus_9708#0
TGCAAACTTGCCACAGTATATGTCATTATATAAAACTCTTAAAACTGCATATAAATCTTT
TAAAATATCGGCTGATTTAACTGGTTCTCATGATCGATTAATGGGCTTACTACAAACTTG
TCTATATTCCTTCGGTCGATTATTAGAAAATCTTCATTTTGATGAAATCGCTCCGTATGC
AGACGAATTATTAGTTTATTTAACTTCATTTTACAATTGGCAGCCTGGTCCATGCTTAGA
GTTATCAACCCAGTTACTTCGAGCTTTTGTTGGTACAAACCTTTGTAATCAATGGGACGA
TCAACTATGTCAGTTATATTCAGATGCACTAAACTCTAGTGTTTCCGATCAAGACATGAA
AAGTGATTCTGAGGAGAAGAAAAATTCTAAAATTAATTTAGAAAATACTCTTGATTTCCA
TATACGTAAA

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)