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Schistosoma mansoni
cluster # 9746 cluster # 9746       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9746#0 length = 1100 sequences # 11  

consensusID : consensus_9746#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1100
fasta sequence
                              [GACATAGAGTCACGTTATTTTGGTATCTATAAACATTATTAAAAAAATTTGAATCATCCTCAAATACTTTACATTTTATTGAGATAAATTATAATCTATATATAACACAATTTATTGATTTATTGAATTACATAACATAGCAACAACGAAGTTGTGCCTTATCGATCTCTATAGCTCCCAATGCATCTAATTTAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACAAGTTGTAATATTCAACAATATTATTGGATAGAAATTGGATCCTCTTGTTACCATTATCAATTAATTTGTAAATAAATAAATATAATTGATAAATTGAATCCTGAAAGTCTATTAACAAATTCCTGAAAGATTAATTACAATTGATAAAGTCGATACCTTACCCTTGCTGTTGTCATCGTCACTGTCACTGTCATTGTTGCCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC-TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAAGAGATGAAAATGAATGTAAATTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGATTCAATCAAAGGTAAATGCCA]

[+] EMBL AI975067             [GACATAGAGTCACGTTATTTTGGTATCTATAAACATTATTAAAAAAATTTGAATCATCCTCAAATACTTTACATTTTATTGAGATAAATTATAATCTATATATAACACAATTTATTGATTTATTGAATTACATAACATAGCAACAACGAAGTTGTGCCTTATCGATCTCTATAGCTCCCAATGCATCTAATTTAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACAAGTTGTAATATTCAACAATATTATTGGATAGAAATTGGATCCTCTTGTTACCATTATCAATTAATTTGTAAATAAATAAATATAATTGATAAATTGAATCCTGAAAGTCTATTAACAAATTCCTGAAAGATTAATTACAATTGATAAAGTCGATACCTTACCCTTGCTGTTGTCATCGTCACTGTCACTGTCATTGTTGCCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTNTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAA TTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD199693             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               CACTGTCACTGTCATTGTTGCCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTCATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD199649             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD199664             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CCGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTATTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAACGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL CD070541             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                CCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTCGTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTANAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGNTAATTCTATCATGCTTTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTtat                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD199648             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAACCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAACATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTTAATTCTATCATGC TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI067790             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAAGAGATGAAAATGAATGTAAATTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGATTCAATCAAAGGTAAATGCCA]
[+] EMBL AI067316             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAGTATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAG                                                                                                                                     ]
[+] EMBL AI067279             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAAGAGATGAAAATGAATGTAAATTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGATTCAATCAAA           ]
[+] EMBL AI067479             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCAGCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACACTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAGGAGATGAAAATGAATGTAAATTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGATTCAATCAAAGGTAAATGCCA]
[+] EMBL AI067038             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        GTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTTTATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAATTCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAATAATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACTGCCGCTGCAGCTGCTTCAGCT                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_9746#0 GACATAGAGTCACGTTATTTTGGTATCTATAAACATTATTAAAAAAATTTGAATCATCCT CAAATACTTTACATTTTATTGAGATAAATTATAATCTATATATAACACAATTTATTGATT TATTGAATTACATAACATAGCAACAACGAAGTTGTGCCTTATCGATCTCTATAGCTCCCA ATGCATCTAATTTAAAAACAAAAACAAACAAACAAAAACAAGTTGTAATATTCAACAATA TTATTGGATAGAAATTGGATCCTCTTGTTACCATTATCAATTAATTTGTAAATAAATAAA TATAATTGATAAATTGAATCCTGAAAGTCTATTAACAAATTCCTGAAAGATTAATTACAA TTGATAAAGTCGATACCTTACCCTTGCTGTTGTCATCGTCACTGTCACTGTCATTGTTGC CGTATTCTTCTTCCAGTGTTGACAGTTTCCTAGTGAATAATCTCTTTTTCACGTTTATTC GTCATTCATTTTGTTTACTGGTTGGAAATTATTTATTAAAACAAGATCAAGAAGAATTAA CCGGATCAATCAATTTTATACGTGTGCATGCGTTCTTGTGTAAATAAATAAATAAATAAA CATTCACGTAATTGATTGGCTGTGTGCACACACATATACATACTTGTTTACCACTCAGTT AATTCTATCATGCTTCATAGTGTTGGTCTTAGTGATCCAACTGGAGCAGCGACAGTGGTT TATCCACATTTTACACCATTCCCACCACCCAATTCATCAACATTAAATTCCAATGAAAAT TCTAGTCAGTTTCCAATTAATACAACTAATAACAGTAATGGTAATAATAATACTAACAAT AATGGTATGTACACATCGAGTACAGCTGCGGCAGCAGCAGCAGCGGTTGCTGCATTGACT GCCGCTGCAGCTGCTTCAGCTGGTCTACCGTCGAATATTAAAGATTCCAGATGGTTAACA CTTGAAGTATGCCGACAATATCAACGAAATCAATGTTCAAGAGATGAAAATGAATGTAAA TTCGCTCATCCACCAACACATGTCGATGTACAAAGTGGACGTGTTATTTGCTGCTATGAT TCAATCAAAGGTAAATGCCA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)