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 consensusID : consensus_9748#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 4 consensus length = 936 fasta sequence 
                              [CTCGAGGGCCAAAATTCGGCACGAGGTGAACCTGACT-ACAGGGTCATTTGACTGGACCTGATTCTATTGAAATTTATAATGTTATCGAGAAGTTAAATGATGATATCGGGTACTTACTATCCTTAATTGATACTAGGCCGTCTTTAAAGTCATCACTTAACATTATTTTAACAAGCGATCATGGGATGTCTGGAGTGGATACTAAGAGAATAATTATTCTGCATGATTATATAAACGAGAGCATGTATTATAGTCCGGGGTCAGAGGATCGTATTTTTTGGTCATTATGGCCAAAAGATGGTAGCTCATCTATTGATCTCTACAAGAAGCTGGTCGGAAAACATCCAAAAATGAATGTTTTTCTGAAGGATAATATACCTATTCATTTGCACTACTCGAACAGTCGACGAATCGGCCCGGTAGTTGTGTATTCGGAGCCTGGATGGACAATCGTTAGATCACAAAAATCAGTTGCAAAATTTACTAAACGTGGAGATCATGGCTATGATCCGGACCATGATGAAATGTCTCCATTCTTTCTAGCTACGGGACCAGGTTTTAGAAGTGCGATTGTTGGGTGGTGGTCAAATAATTAATTCTATTTATCTGATTGATATTTATCCACTGATGTGTGCCTTACTCAATTTAAATAAACCAGCTCCAAACAATGGCAGTTTATCACGTGTGATGTCACTCCTTCGTCATAGTAGTGGTATTAATGTCTACTTCTCAGA-TTTCTCGATATGTTCACTGAAGTTTGAATTTCTCGTTCTCGCGCCAAAACGCCCTTTTTACCTTCAGATTGATTTTCCACTGGGAAGACCCTACTGTAATTAGTCGTTACCCATTAATACGTATCTTGTGACTTTCCAAGGCCTTCTAGATAAATATATCCTCAATTAGGGCTTGGTTTTCCGCCT-TGCCGGTATAAAATAC]
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[+] EMBL CD194885             [                                                                                                                                                                                                              GAGAATAATTATTCTGCATGATTATATAAACGAGAGCATGTATTATAGTCCGGGGTCAGAGGATCGTATTTTTTGGTCATTATGGCCAAAAGATGGTAGCTCATCTATTGATCTCTACAAGAAGCTGGTCGGAAAACATCCAAAAATGAATGTTTTTCTGAAGGATAATATACCTATTCATTTGCACTACTCGAACAGTCGACGAATCGGCCCGGTAGTTGTGTATTCGGAGCCTGGATGGACAATCGTTAGATCACAAAAATCAGTTGCAAAATTTACTAAACGTGGAGATCATGGCTATGATCCGGACCATGATGAAATGTCTCCATTCTTTCTAGCTACGGGACCAGGTTTTAGAAGTGCGATTGTT GGTGGTGGTCAAATAATTAATTCTATTTATCTGATTGATATTTATCCACTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
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consensusID : consensus_9748#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 7 consensus length = 602 fasta sequence 
                              [GGAGTACGTGTTATGAAAGTACATAATGAGTTTATTACTCGAACAGGACCAAATCACTTATCACTGGTAACTGGGATGCATGAAGAGAGTCATGGTATTGTTGATAACATGTTTTATGATCCTAAGCTTAATGATACTTTTGACTTGAGTAATACAAGGCATTTATCACAGTCAAAGTGGTTTGATGTTGGGTCAGAACCAATTTGGGTTACAAATCAACGTCATGGTCATAAAAGTGCTGTTACATTTTGGCCAGGGAGTAATACACCATTCAAAGGACAATTACCTAGTTATTATTATTCACAATACAACCATCAACTTCCTTTAGTTGATCGAATTAATCAAACTATTAAGTTGTTAGATTTAGATAGAGTGACACTCGGTCTAATATATTTTCATGAACCTGACTCACAGGGTCATTTGACTGGACCTGATTCTATTGAAATTTATAATGTTA-TCGAGAAGTTAAATGATGATATCGGGTACTTACTATCCTTAATTGATACTAGGCCGTCTTTA-AAGTCATCACTTAACATTATTTTAACAAGCGATCATGGGATGTCTGGAGTGGATACTAAGAGAATAATTATTCTGCATGATTA]
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[+] EMBL CD166274             [          TTATTAAAGTACATAATGAGTTTATTACTCGAACAGGACCAAATCACTTATCACTGGTAACTGGGATGCATGAAGAGAGTCATGGTATTGTTGATAACATGTTTTATGATCCTAAGCTTAATGATACTTTTGACTTGAGTAATACAAGGCATTTATCACAGTCAAAGTGGTTTGATGTTGGGTCAGAACCAATTTGGGTTACAAATCAACGTCATGGTCATAAAAGTGCTGTTACATTTTGGCCAGGGAGTAATACACCATTCAAAGGACAATTACCTAGTTATTATTATTCACAATACAACCATCAACTTCCTTTAGTTGATCGAATTAATCAAACTATTAAGTTGTTAGATTTAGATAGAGTGACACTCGGTCTAATATATTTTCATGAACCTGACTCACAGGGTCATTTGACTGGACCTGATTCTATTGAAATTTATAATGTTA TCGAGAAGTTAAATGATGATATCGGGTACTTACTATCCTTAATTGACACTAGGCCGTCTTTA A                                                                                  ]
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[-] EMBL CD166763             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           TATTAAGTTGTTAGATTTAGATAGAGTGACACTCGGTCTAATATATTTTCATGAACCTGACTCACAGGGTCATTTGACTGGACCTGATTCTATTGGAATTTATAATGTTAGTCGAGAAGTTAAATGATGATATCGGGTACTTACTATCCTTAATTGATACTAGGCCGTCTTTATAAGTCATCACTTTACATTATT                                                              ]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_9748#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
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consensus_9748#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
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consensus_9748#1      ---------------------------------------------------------GGA 3
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consensus_9748#0      GCATGTATTATAGTCCGGGGTCAGAGGATCGTATTTTTTGGTCATTATGGCCAAAAGATG 300
consensus_9748#1      GTACGTGTTATGA--AAGTACATAATGAGTTTATTACTCGAACAG---GACCAAA----- 53
                      * * ** ****      *      * **   ****  * *  **    * *****     
consensus_9748#0      GTAGCTCATCTATTGATCTCTACAAGAAGCTGGTCGGAAAACATCCAAAAATGAATGTTT 360
consensus_9748#1      -TCACTTATC-ACTGGTAACTG--GGATGCATGAAGAGAGTCATGGTATTGTTGATAACA 109
                       *  ** *** * ** *  **    ** **  *  *  *  ***   *   *  **    
consensus_9748#0      TTCTGAAGGATAATATACCTATTCATTTGCACTACTCGAACAGT-CGACGAATCGGCC-C 418
consensus_9748#1      TGTTTTATGATCCTAAGCTTAATGATACTTTTGACTTGAGTAATACAAGGCATTTATCAC 169
                      *  *  * ***  **  * ** * **       *** **  * * * * * **    * *
consensus_9748#0      GGTAGTTGTGTATTCGGAGCCTGGATGGACAATCGTTAGATCACAAAAATCAGTTGCAAA 478
consensus_9748#1      AGTCAAAGTG-GTTTGATGTTGGGTCAGAACCAATTTGGGTTACAA--ATCAACGTCATG 226
                       **    ***  ** *  *   **   **      ** * * ****  ****    **  
consensus_9748#0      ATTTACTAAACGTGGAGATCATGGCTATGATCCGGACCATGATGAAATGTCTCCATTCTT 538
consensus_9748#1      GTCA--TAAAAGTG-------CTGTTAC-ATTTTGGCCAGGGAGTAATA-CACCATTC-- 273
                       *    **** ***         * **  **   * *** *  * ***  * ******  
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consensus_9748#1      -------AAAGGAC--AATTACCTAGTTATTATTATTCA----CAATACAACCATCAACT 320
                             *  ****    **    *  *   *** **         *  **  ** ** *
consensus_9748#0      CTATTTATCTGATTGATATTTATCCACTGATGTGTGCCTTACTCAATTTAAATAAACCAG 658
consensus_9748#1      TCCTTTAGTTGATCGA-ATTAATCAAACTAT---TAAGTTGTTAGATTTAGATAGAGTGA 376
                         ****  **** ** *** *** *   **   *   **  *  ***** *** *    
consensus_9748#0      CTCCAAACAATGGCAGTTTATCACGTGTGATGTCACTC-CTTCGTCATAGTAGTGGTATT 717
consensus_9748#1      CACTCGGTC-TAATATATTTTCATG---AACCTGACTCACAGGGTCATTTGACTGGACCT 432
                      * *       *   *  ** *** *    *  * **** *   *****   * ***   *
consensus_9748#0      AATGTCTACTTCTCAGATTTCTCGATATGTTCACTGAAGTTTGAATTTCTCGTTCTCGCG 777
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                       ** **** *    * **** *    *****  *   *  ** ***             *
consensus_9748#0      CCAAAACGCCCTTTTTACCTTCAGATTGATTTTCCACTGGGAAGACCCTACTGTAATTAG 837
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                        *    *  ***  ** * * * ******     *** **  * *  **  ** ** * 
consensus_9748#0      TCGTTACC-CATTAATACGT-ATCTTGTGACTTTCCAAG-GCCTTCTAGATAAATA--TA 892
consensus_9748#1      TTAACATTATTTTAACAAGCGATCATGGGATGTCTGGAGTGGATACTAAGAGAATAATTA 589
                      *    *     **** * *  *** ** **  *    ** *  * ***    ****  **
consensus_9748#0      TCCTCAATTAGGGCTTGGTTTTCCGCCTTGCCGGTATAAAATAC 936
consensus_9748#1      TTCTGCATGATTA------------------------------- 602
                      * **  ** *                                  
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||