Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 975 cluster # 975       Sequences # 2       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_975#0 length = 841 sequences # 2  

consensusID : consensus_975#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 841
fasta sequence
                              [TAAAATATACATAAAATAATATACAATTAACATATGTTTCACAATAAATGGTCATAATTACTATGACTTCATGTTGACAGGTTACTGTTCAATTGTTTTTGTATTATTCTTTCTAAACGATTATGCATTACTTGTATAAATAATCGTTGATTTTGTTTTAAATAAGCCGCCTTAGTTAACTGGTTAAGCATTTCCATTATTTCATCTTGTACTAAATGTTCACAATGATTACGTAACCAAGACATATTCATTTGAAGTATACTATTATTTTCTTGGCTAAATGCTGTATTCATTAATGTATTACGTTTAGTTGGAGTTAACAATGGTTTTAAAGAAGATTTCATCATTGGAGAAGTAATACAATTAGTGGTAGAAAGATTACGAACACCATGTGAAGATTGTAAAGATTGATGATGTAATGGAGTTTCTTTATTGTTTTCACCAATTATAATATTAGGATTGTTTATAAGACTGTTTAAATGTTTCCATAATAAAAATGTTGACTGTTCAATTATGCCAATAAGTCCACGTAGTTGAACACGTAGACAACTGACACCAAGTTGAGTTAACCGTTGCATCATTTGAATTTCAGCATTTTGATTNTCCTTACCAGCAGTAATTCGGTCAACAGAATTTAATAATTGTAAGGGGCATTTGAATATGATGGATGATGCTTGTTTTAATTCATTGATTGGCAGATTTTCACTGAATGATTCACAATTCAGTAATTGAACAATCGATTGTCCAAATTGTTGTTGTTGTTGATTCCTTTGTTCACCAATTATTTTACTTTTTGTTGGTTCTTTTGTGCGACTATTACTACTACTATTGAGAAATTGAA]

[+] EMBL CD075665             [TAAAATATACATAAAATAATATACAATTAACATATGTTTCACAATAAATGGTCATAATTACTATGACTTCATGTTGACAGGTTACTGTTCAATTGTTTTTGTATTATTCTTTCTAAACGATTATGCATTACTTGTATAAATAATCGTTGATTTTGTTTTAAATAAGCCGCCTTAGTTAACTGGTTAAGCATTTCCATTATTTCATCTTGTACTAAATGTTCACAATGATTACGTAACCAAGACATATTCATTTGAAGTATACTATTATTTTCTTGGCTAAATGCTGTATTCATTAATGTATTACGTTTAGTTGGAGTTAACAATGGTTTTAAAGAAGATTTCATCATTGGAGAAGTAATACAATTAGTGGTAGAAAGATTACGAACACCATGTGAAGATTGTAAAGATTGATGATGTAATGGAGTTTCTTTATTGTTTTCACCAATTATAATATTAGGATTGTTTATAAGACTGTTTAAATGTTTCCATAATAAAAATGTTGACTGTTCAATTATGCCAATAAGTCCACGTAGTTGAACACGTAGACAACTGACACCAAGTTGAGTTAACCGTTGCATCATTTGAATTTCAGCATTTTGATTNTCCTTACCAGCAGTAATTCGGTCAACAGAA                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD163743             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  TAGAAAGATTACGAACACCATGTGAAGATTGTAAAGATTGATGATGTAATGGAGTTTCTTTATTGTTTTCACCAATTAT ATATTAGGATTGTTTATAAGACTGTTTAAATGTTTCCATAATAAAAATGTTGACTGTTCAATTATGCCAATAAGTCCACGTAGTTGAACACGTAGACAACTGACACCAAGTTGAGTTAACCGTTGCATCATTTGAATTTCAGCATTTTGATTTTCCTTACCAGCAGTAATTCGGTCAACAGAATTTAATAATTGTAAGGGGCATTTGAATATGATGGATGATGCTTGTTTTAATTCATTGATTGGCAGATTTTCACTGAATGATTCACAATTCAGTAATTGAACAATCGATTGTCCAAATTGTTGTTGTTGTTGATTCCTTTGTTCACCAATTATTTTACTTTTTGTTGGTTCTTTTGTGCGACTATTACTACTACTATTGAGAAATTGAA]


>consensus_975#0 TAAAATATACATAAAATAATATACAATTAACATATGTTTCACAATAAATGGTCATAATTA CTATGACTTCATGTTGACAGGTTACTGTTCAATTGTTTTTGTATTATTCTTTCTAAACGA TTATGCATTACTTGTATAAATAATCGTTGATTTTGTTTTAAATAAGCCGCCTTAGTTAAC TGGTTAAGCATTTCCATTATTTCATCTTGTACTAAATGTTCACAATGATTACGTAACCAA GACATATTCATTTGAAGTATACTATTATTTTCTTGGCTAAATGCTGTATTCATTAATGTA TTACGTTTAGTTGGAGTTAACAATGGTTTTAAAGAAGATTTCATCATTGGAGAAGTAATA CAATTAGTGGTAGAAAGATTACGAACACCATGTGAAGATTGTAAAGATTGATGATGTAAT GGAGTTTCTTTATTGTTTTCACCAATTATAATATTAGGATTGTTTATAAGACTGTTTAAA TGTTTCCATAATAAAAATGTTGACTGTTCAATTATGCCAATAAGTCCACGTAGTTGAACA CGTAGACAACTGACACCAAGTTGAGTTAACCGTTGCATCATTTGAATTTCAGCATTTTGA TTNTCCTTACCAGCAGTAATTCGGTCAACAGAATTTAATAATTGTAAGGGGCATTTGAAT ATGATGGATGATGCTTGTTTTAATTCATTGATTGGCAGATTTTCACTGAATGATTCACAA TTCAGTAATTGAACAATCGATTGTCCAAATTGTTGTTGTTGTTGATTCCTTTGTTCACCA ATTATTTTACTTTTTGTTGGTTCTTTTGTGCGACTATTACTACTACTATTGAGAAATTGA A



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)