|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9751#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 875 fasta sequence
[GATGAGATAGAGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG-CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC-CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTTGGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT]
[+] EMBL CD094022 [GATGAGATAGAGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAGCCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGT AAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAAC TCTAATTAGT ]
[-] EMBL CD065711 [ AGTTTTTAAAAACACTAACTCGACCTGGTGCCAACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCATGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCAC AGAAATGTCTGTGAGACTTGGATCTGAAGT GGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTAC TCAGAACA ]
[+] EMBL CD183411 [ AACATTGAACAAGAAGTCAGTGCAGACGAAGAGCAAAAACGAAAAGCTACTGACAGACGTGAAGCCCTCCAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTAAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGNGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTG ]
[+] EMBL CD155007 [ CAGGAAGCGAAACGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAGGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTCCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAANAATTTGCTACATTTTTTGATGAT ]
[+] EMBL CD181138 [ CGCTCTCTCCCGATCTATAAATTTCGGGATGCTCTTTTACAAGCTATTGCTGATCATCAGGTTTTAATCATAGAAGGTGAAACAGGTTCTGGTAAAACAACTCAAATTCCTCAGTATTTGTACGAAGCGGGTTATTGTAATGGAGGAAAACGTATTGGGTGTACACAACCACGTCGTGTTGCTG CCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTC AATACATGTAACTCAACCCCNCA GTGATATTCT ]
[-] EMBL CD155046 [ CACGTCGTG TGCTGCCCATGTCAGTAGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT ]
[+] EMBL CD188381 [ AGCTGCTCGAGTTTCACAAGAAATGTCTGTTAGACTTGGATCTGAAGTGGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGTTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATG ]
[-] EMBL CD154899 [ GGGATATAGTATTCGTTTTGAAGATTGTACTTCAGAACATACAGTAATAAAGTACATGACAGATGGTATGCTTTTGCGTGAATTTCTCACAGAACCAGATTTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT ]
[-] EMBL CD154981 [ AGAT GTATGC TTTGCGTG ATTTCTCACAGAACCAGATNTGGGCAGTTATTCAGTAATGATTATAGACGAAGCACATGAACGTACACTACATACGGATATACTATTCGGTTTAGTAAAGAATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTAAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCCGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGT ]
[+] EMBL CD120675 [ TATACTATTCGGTTTAGTAAAGGATGTAGCTCGTTTTCGATCCGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCCAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTG ]
[-] EMBL CD179135 [ CGATTTGAAACTTCTAATTAGTTCTGCTACTTTAGATGCAGAAAAATTTGCTACATTTTTTGATGATGCTCCTGTATTCCGAATCCTAGGTCGTCGTTATCCAGTTGATATCTACTATACAAAAGCTCCAGAAGCTGATTATATTGAAGCTGCTATCATATCTATTCTTCAAATACATGTAACTCAACCCC CAGGTGATATTCTAGTCTTTTTAACTGGTCAAGAAGAAATTGAAACCGCTAATGAATTATTAATGGAGCGTACAAGAAAACTTGGGAGTAAAATTCGTGAATTAATAATTCTACCTAT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||