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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9752#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 800 fasta sequence
[AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATATCAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA-GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAA-GCTCTTTTGAACGCGTCAGACGACCTACTATTTGC]
[-] EMBL CD062328 [AGTCTTTTGATACACCTGTATTTCCTGAAGAATCTTCGGAACTTTTTACAGCAGAAATATCAACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTGATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAG ]
[-] EMBL BF937038 [ ACCTCATGATTTTCACTTGGTAGCGTATGGTTGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATctcgtgc ]
[+] EMBL CD137642 [ TGTCATTTTGAGATACTGAATTTTTACTGATAATAGGTTTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAANATAAGACCTANACTCTCTAGCCTCANAAACATGCTGAAAGAACTGTNTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGT AAAAAGTGAAGGGGAT ATCTTGAGTGG ]
[+] EMBL CD098009 [ TTTTTCCTTTGATGTTCAAAATTTAAAAGGCTTCTCTTATTTGCTGATGCTACAACAACATCATTCAGCAAAAAATCGATATGAAAAGGGTTATAATACACGACTGCCTTGTGTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTCGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTAACGACCACGAG ]
[-] EMBL CD165085 [ GTCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACAT ]
[-] EMBL CD165147 [ TCCAGACTGTCCATCCAACACTAAACTATCCTCAGCAAATACAGACCTGACAGGGGCCTTTTGAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACAT ]
[-] EMBL CD120529 [ GAACGCTTAGCAAAACGTCTCCTGTAGGTACGCGAAACCTTCTATACTCATCTGTCAATTCATTAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTC AAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGc ]
[-] EMBL CD098086 [ cgGTCAATTCATAAATGAGTACATGGAAGATGGAGTGTTGATAATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGACATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAATGCTCTTTTGAACGCGTCAGACGA ]
[+] EMBL CD179022 [ GATTATAGGTAATATCCAGTGACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTAGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTGCAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAATGCTCTTTTGAACGCGTCAGACG ]
[-] EMBL CD127544 [ GACAGAGAATGGTTTAGATCTCCAGTGTAAATAACTGCAGTCATTCCATATGGGTTTATCTTGACAGAACTTGGTTCTAACCAGTGCGCAAGTTCCCCGGGTTTTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGATCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGAGTGGGATTCCAGTCTGCCAGGTCAAACGGCGCAACAAAGAGTCTGAGATAAGCAAA GCTCTTTTGAACGCGTCAGACGACCTACTATTTGC]
[+] EMBL CD194965 [ TTATTTGTCGTTGTCGAGTACAGAACGAGCTTTGATCACATGTTTTAAAATTAGCACGACCTACCGACCACGAGATATTGAGTATCAAGAAAATAAGACCTAAACTCTCTAGCCTCAAAAACATGCTGAAAGAACTGTTTCAACAGGTTAACGAGTTTTGCTTGGTAAAAAAGTGAA GGGATAATCTTGA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||