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Schistosoma mansoni
cluster # 9753 cluster # 9753       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9753#0 length = 784 sequences # 11  

consensusID : consensus_9753#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 784
fasta sequence
                              [ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA-TT-ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT-TATCACGTAAA-TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT-CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTGACTGAAGACAATGAAAATCCATCACCTCCTCCGGCACTAGACGATAATCCCTGCTGACTGCGAACAGGTGATGCACGTNCACTGGATAATACGCTAACTTCATCATCATTAATATCAGTA]

[+] EMBL CD196042             [ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGTACGTTTACGTAAGCCCCGAAATTCCAACCTAGCTTCA TTNAT AAGCGNTAGACACTCATCATATT TATCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD196046             [ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCNACCTAGCTTCATTT AT AAGCGTTAGACACTCATCATATTNTATCACGTAAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD114308             [                             cAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTGATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGACGCAAATGATCATGATCTGACTGTGGTGTTAAAGCGGCCCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CD158541             [                                                                                                                                            AGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCAACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATC                                                                                                                                                                                                                            ]
[-] EMBL CD190591             [                                                                                                                                                AGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCTAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[-] EMBL CD178945             [                                                                                                                                                        GTTAGTGTAGTATTGCAGTGGTCACTACAGAACTGCTGGATATGAGTGAACTAGGTCGATAATATCCGCGACGAGAACGTTTACGTAAGCCACGAATCTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAAGTTTTTTAATTCACATGTCAGTAATGAATGCGATATGTGCGTTTCTATCAGCCGCCCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTTGCTTAGCCAACTCATCGGATAAACTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAAATGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCA                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD178585             [                                                                                                                                                             GGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACG TTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCCTTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAA                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD178416             [                                                                                                                                                             GGTAGTATTGCAGTGTTCACTACAGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAAGCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTG                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD115621             [                                                                                                                                                                                                                                                  CCCGAATTTCCAACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGGTGGTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTGACTGAAGACAATGAAAATCCATCACCTCCTCCGGCACTAGACGATAATCCCTGCTGACTGCGAACAGGTGATGCACGTNCACTGGATAATACGCTAACTTCATCATCATTAATATCAGTA]
[-] EMBL CD144258             [                                                                                                                                                                                                                                                             AACCTAGCTTCA TT ATAAAGCGTTAGACACTCATCATATT TATCACGTAAA TTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACCAATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATCGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGAT                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD196230             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CAATTATCATTTCATTTTCTGCTGTCAGCTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCTTGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTT CTTAGCCAACTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCGAACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCAATTACGCTCTTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAAGTTGAC                                                                                                                      ]


>consensus_9753#0 ACTTGGATTTTGTGTAGTCAACATGTCCAGAGAAGATGTACTGCCATCACTGACTAGCTG ATGAGCGGATAATGACGAATGATGACAGTGATACAAATGATCCTGATCTGACTGTGGTGT TAAAGCGGCTCCATTTAAATAGGAAGGTGGCAGTGAGGGTAGTATTGCAGTGTTCACTAC AGAACTACTGGATATAAGTGAATTAGGACGATAATAACCACGACGAGAACGTTTACGTAA GCCCCGAATTTCCAACCTAGCTTCATTATAAAGCGTTAGACACTCATCATATTTATCACG TAAATTTTTTAATTCACTTGTCAGTAATGATTGCGATATTTGCGTTTCTTTCAGCCGACC AATTAACATTTCATTTTCTGCTGTCAACTGCTTAACACGATTCTCTAAATCTAAGCCTCT TGTAAGTAGGCGAGTAATTTCAGATTGTTGATTCATGAAAGCATCAGACTTCTTAGCCAA CTCATCGGATAAATTACGTATATGCATATTAGCAGTAATTAATTGACGTGCACAATCTCG AACTAATGCAGTTTCATGTTCATCCAATTGATCAGCCGCAGTAGACAATCGATTACGCTC TTGACGCAGTAGGTTATTTTCTTCTTCTAGATCTCCAAGTTTTTTATGCAACTGTGCGAA GTTGACTGAAGACAATGAAAATCCATCACCTCCTCCGGCACTAGACGATAATCCCTGCTG ACTGCGAACAGGTGATGCACGTNCACTGGATAATACGCTAACTTCATCATCATTAATATC AGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)