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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9755#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 826 fasta sequence
[ACAATTCAATCATTATATAGAATGCTACTTATTTATTTTTACAATAACACACACACATATGAGGAATAGTATTAATAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAAAGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGACCTT]
[-] EMBL CD066960 [ACAATTCAATCATTATATAGAATGCTACTTATTTATTTTTACAATAACACACACACATATGAGGAATAGTATTAATAATAACAATCGTGATATTTACACTTGGATAGACAAC AAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTAGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGCAGAATTCGTTATAATCAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCATAGTATGGTTTGATGTAATAATAAAGTAATTTTGTTTATTAATT ]
[+] EMBL CD198823 [ ATAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAGAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTANACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAAATAAGTAATTTTC ]
[-] EMBL CD143319 [ TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAAAAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT ]
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[-] EMBL CD143404 [ TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT ]
[-] EMBL CD143324 [ TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCGAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT ]
[-] EMBL CD143307 [ TAATAACAATCGTGATATTTACACTTCGATAGAAAACAAAAAAAAAGGGATCAAAATAAGTCAGTAAGGTTATGATCATGTCGAAATTGTTTTGTATATGATTTTTCCTTCTTTTCACGTAATCTTTCCTCGTTGGCTTTCATTTTTCGACGTTGAATTGCTTCCAAAGTTTCAGGACTTGGTTCGGGTTTATTTAATGAATCAACACATTCCCTGATTATACGACGAATTCGTTCTAAACAATCAGCTTGATTTAATATTTGTTTCCTAGTATGATCTGATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATT ]
[+] EMBL CD189459 [ ATGTAATAATAAAGTAATTTTCTTTATTAATTCGATTAGCCTCCTTTTCCATAAATAGTTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTCGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAAAGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGA ]
[-] EMBL CD191590 [ TTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATATTGTCTta ]
[-] EMBL CD191603 [ TTGTTTAACTTGATCTGGTATCCATGACGCTGATGGAACATGGAAACGTATCTCCACTTTTGTTTTATTTTTATTCACATGTTGTCCTCCTGGACCACTCGAATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAGGTTACCGTCTAATAT GTCTA ]
[+] EMBL CD190155 [ ATATGCATAAGATATTTGAAGTTCATCGATAGGGATATATCCGCTGAAAACATTTTGACTAATACTTGGTTCTGTAGGTTTCTTAAAAACAGCATTAGAATCAGAATTTGGATAAAGATTGACTGGATTTTGTGCACTTTCAAAAGAACTCAAACATCGTATTGATGGGCGGGAGATGTAAAATGATAGAAATTTTCCAACACGAATCATTAGCTACGAAACCACCCAAGTTACCGTCTAATATCGTCTACGCACGGTAAAAAAAAGTCGGGGCCTTTCAAAGCCACCCGCCGCTTCGTTTTAACGACCTT]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||