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consensusID : consensus_9762#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 10 consensus length = 1428 fasta sequence
[CAGTAAAAGGACTAGACAAACATGAGATTGGTGACTATTCGTGAGTGAGTGAGTGGTGGGTCAATAGTATGGAGATCGTTTGTTTGTCGCGAGGGAATTGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGGTAAGTGAGTAGTAAGTGAGCAGTTTGTGTTTTATCTGTATGTGTGGGTTCTGAATGTGTTTGTGTGTG----TGTGTGTGTG-------GG-TTATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAGAATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTGTTTGTGGTGGTGATGACAATGACGATGATATTGTTATTGATGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAGCGGGGTAGGTGTTGGATGTACAGGAATGTGGGGTAATGTTGTTAGCCCTTTTTGTTCTAACCGAACGTGTTGTTACGTTTGTGTTAAGTAAGTGAGGGCAATATTATTATTGTGTGGCTGGGTGCAGGTAGACAGTTGTTTGTGAACCAACTGTTTTGTGATCAGCGAACAGAATTGTTGTAGTGCGTGTTGGTCATTGGAATTGTTGAAGATGAAGGAATATTTTGCCGATGTTGGCGAAGATGATTGGTGTTGTTGTGTAGAGTTGGGAGTTGTGGGGTCCATATCCTGTTTATAATGATGTTTTGTCGTTTGTGCTGTGATGTGACGTGATGTGTTGTGTGGTGTAGTGTTGTGTGATGTATTGTGATGAATAGTAGTGAATTGTGGTTATCTATGTAATTGTGAATGATGATATTGAGGTCCGTGTTTCTGAGTGATCAGTGACGCAGTATCCTTAATATATCTGATTTGGATGTAGTGTAGGAATTGTGTTGTATTGTGATGTTGTTGATAATGATATTTGTCGGATTGCCACGATATACTATGGTTTTGTTTATTGTGTTTTTCAGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGATGCATGTAGTTGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAAGTGGTTTGTATGTGAATTATCCTGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTATTATAGTGGTCTAATTCTGAAATCCAGGTAA]
[-] EMBL CD146894 [CAGTAAAAGGACTAGACAAACATGAGATTGGTGACTATTCGTGAGTGAGTGAGTGGTGGGTCAATAGTATGGAGATCGTTTGTTTGTCGCGAGGGAATTGATGTATTGACTTGTTGTTGGTGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGGTAAGTGAGTAGTAAGTGAGCAGTTTGTGTTTTATCTGTATGTGTGGGTTCTGAATGTGTTTGTGTGTGTGTATGTGTGTGTGTATGTGTGGATTATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAGAATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTATTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGT ]
[-] EMBL CD071878 [ GGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGGTAAGTGAGTAGTAAGTGAGCGGTTTGTGTTTTATCTGTATGTGTGGGTTCTGAATGTGTTTGTGTGTG TGTGTGTGTG GG TTATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAGAATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTGTTTGTGGTGGTGATGACAATGACGATGATATTGTTATTGATGGTATATGTGTGTGTGTGTGTAGCGGGGT ]
[-] EMBL CD189135 [ GCGAGAATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTGTTTGTGGTGGTGATGACAATGACGATGATATTGTTATTGATGGTATGTGTGTGTG ]
[+] EMBL CD155454 [ TGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTGTTTGTGGTGGTGATGACAATGACGATGATATTGTTATTGATGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAGCGGGGTAGGTGTTGGATGTACAGGAATGTGGGGTAATGTTGTTAGCCCTTTTTGTTCTAACCGAACGTGTTGTTACGTTTGTGTTAAGTAAGTGAGGGCAATATTATTATTGTGTGGCTGGGTGCAGGTAGACAGTTGTTTG ]
[+] EMBL CD113680 [ GAATGTGGGGTAATGTTGTTAGCCCTTTTTGTTCTAACCGAACGTGTTGTTACGTTTGTGTTAAGTAAGTGAGGGCGATATTATTATTGTGTGGCTGGGTGCAGGTAGACAGTTGTTTGTGAACCAACTGTTTTGTGATCAGCGAACAGAATTGTTGTAGTGCGTGTTGGTCATTGGAATTGTTGAAGATGAAGGAATATTTTGCCGATGTTGGCGAAGATGATTGGTGTTATTGTGTAGAGTTGGGAGTTGTGGGGTCCATATCCTGTTTATAATGATGTTTT ]
[+] EMBL CD135034 [ GGGGTTATGTTGTTAGCCCTTTTTGTTCTAACCGAACGTGTTGTTACGTTTGTGTTAAGTAAGTGAGGGCAATATTATTATTGTGCGGCTGGGTGCAGGTAGACAGTTGTTTGTGAACCAACTGTTTTGTGATCAGCGAACAGAATTGTTGTAGTGCGTGTTTGTCATTGGAATTGTTGAAGATGAAGGAATATTTTGCCGATGTTGGCGAAGATGATTGGTGTTGTTGTGTAGAGTTGGGAGTTGTGGGGTCCATATCCTGTTTATAATGATGTTTTGTCGTTTGTGTTGT ]
[+] EMBL CD084828 [ TTTTGCCGATGTTGGCGAAGATGATTGGTGTTGTTGTGTAGAGTTGGGAGTTGTGGGGTCCATATCCTGTTTATAATGATGTTTTGTCGTTTGTGCTGTAATGTGACGTGATGTGTTGTGTGGTGTAGTGTTGTGTGATGTATTGTGATGAATAGTAGTGAATTGTGGTTATCTATGTAATTGTGAATGATGATATTGAGGTCCGTGTTTCTGAGTGATCAGTGACGCAGTATCCTTAATATATCTGATTTGGATGTAGTGTAGGAATTGTGTTGTATTGTGATGTTGTTGATAATGATATTTGTCGGATTGCCACGATATACTATGGTTTTGTTTATTGTGTTTTTCAGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGATGCATGTAGTTGTGTAGNGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTCGT ]
[+] EMBL CD084984 [ TTTTGCCGATGTTGGTGAAGATGATTGGTGTTGTTGTGTAGAGTTGGGAGTTGTGGGGTCCATATCCTGTTTATAATGATGTTTTGTCGTTTGTGCTGTGATGTGACGTGATGTGTTGTGTGGTGTAGTGTTGTGTGATGTATTGTGATGAATAGTAGTGAATTGTGGTTATCTATGTAATTGTGAATGATGATATTGAGGTCCGTGTTTCTGAGTGATCAGTGACGCAGTATCCTTAATATATCTGATTTGGATGTAGTGTAGGAATTGTGTTGTATTGTGATGTTGTTGTTAATGATATTTGTCGGATTGCCACGATATACTATGGTTTTGTTTATTGTGTTTTTCAGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGATGCATGTAGTTGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAAGTGGTTTGTGTGTGAATTATCCTGGATCGAC ]
[+] EMBL CD084870 [ TTTTGCCGATGTTGGCGAAGATGATTGGTGTTGTTGTGTAGAGTTGGGAGTTGTGGGGTCCATATCCTGTTTATAATGATGTTTTGTCGTTTGTGCTGTGATGTGACGTGATGTGTTGTGTGGTGTAGTGTTGTGTGATGTATTGTGATGAATAGTAGTGAATTGTGGTTATCTATGTAATTGTGAATGATGATATTGAGGTCCGTGTTTCTGAGTGATCAGTGACGCAGTATCCTTAATATATCTGATTTGGATGTAGTGTAGGAATTGTGTTGTATTGTGATGTTGTTGATAATGATATTTGTCGGATTGCCACGATATACTATGGTTTTGTTTATTGTGTTTTTCAGATGTAAATGAAGAATGAGTGAACCGTCGATATGTGGAGTTGCAATCGATGGAATGGTTTTGGTGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGATGCATGTAGTTGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAAGTGGTTTGTATGTGAATTATCCTGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTATTATAGTGGTCTAATTCTGAAATCCAGGTAA]
[+] EMBL CD146080 [ ATGGTTTTAATGATTTGTTGACGAGTTAGAATCGGTGAGTGTCACAATTGTATGTGTGTTTGGGAGTATTTGTGATATGAAGACGTATGTAGATGTGTAGTGAGGTGTTGGTTTTGTTGAGTGAGTTGTTGTTAGGTGGTTTGTATGTGAATTATCCTGGATCGACTGTTAGCCACATTGTGTATTATAGTGGTTTAATTCTGAAATCCAGG ]
consensusID : consensus_9762#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 315 fasta sequence
[TGTGATATTTGTTTATGGCTTATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAGAATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTTCGACGATGAT]
[-] EMBL CD060124 [TGTGATATTTGTTTATGGCTTATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAGAATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTATTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATTGTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCATGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTTCGACGATGAT]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9762#0 TGTATTTGGCGAAGTGGTGTTGTGCGCTATAGTTAAGGGTAAGTGAGTAGTAAGTGAGCA 180
consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9762#0 GTTTGTGTTTTATCTGTATGTGTGGGTTCTGAATGTGTTTGTGTGTGTGTGTGTGTGGGT 240
consensus_9762#1 ---------------------------------------TGTG-ATATTTGTTTATGGCT 20
**** * * *** * *** *
consensus_9762#0 TATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAG 300
consensus_9762#1 TATTTGTGTATGAGTAAACATTTGAACGAGTGTATTATGTCCTGAATTGACGGCTGCGAG 80
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consensus_9762#1 AATCGACTGATCTCGTTAGTTGTAAATGTCAGGTATATTGAAGGCATTGTCTGAAGATTA 140
************************************************************
consensus_9762#0 TTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATT 420
consensus_9762#1 TTCTCTTGTGAGAGTATAATTTCAAGCAATGTGAACATGTATTCAGTAATGTTGTTAATT 200
************************************************************
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consensus_9762#1 GTGTTAGTAGGGATTTGTTGATCGAGTGAGTGTGGGGTGATGTAGTGATGCGAGGCTGCA 260
************************************************************
consensus_9762#0 TGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGTGTTTGTGGTGGTGATG 540
consensus_9762#1 TGGATTGATGAGTGTAATCGATGTTTTTTGTTATGAGTGATGGT-TCGACGATGAT---- 315
******************************************** * * ** *
consensus_9762#0 ACAATGACGATGATATTGTTATTGATGGTATGTGTGTGTGTGTGTGTAGCGGGGTAGGTG 600
consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
consensus_9762#0 TTGGATGTACAGGAATGTGGGGTAATGTTGTTAGCCCTTTTTGTTCTAACCGAACGTGTT 660
consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9762#1 ------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||