cluster # 9772

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9772 cluster # 9772 Sequences # 11 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9772#0 length = 697 sequences # 11
consensusID : consensus_9772#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 697
fasta sequence
                              [TTACGATGGCGGAAAGAAGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCCCAGGTCTTAATATACAATCCAGCTCCAGTGATAGTCAAGCAGTAATGGCAACTATTCACGCGATTCTAAATTTTAATGTTCAGGCCGTCCCATACATATTCCCTCCAAAAATCACTCCAGGTTAACAGTCATTATTTATATTTTCGTACTTAATTTATAACTGATTCTTTTTGCTGTTTAATAATTTTTTCGCTTGCTAAATATAATTGTTAAAATGAGAGCTATGCTTGACCTCACTTAAGTATTTCTATGCTTCCCCCTTAAAGATATGTTTCAGAAGTTTTTAACTGAGGTTTG]

[+] EMBL CD068139             [TTACGATGGCGGAAAGAAGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTGTGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD200477             [                 AGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGGGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCCCAGGTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD186144             [                 AGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD185758             [                 AGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD185685             [                 AGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGGAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGAGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD200826             [                  GCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTTATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGAAGTAGAGGCCATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCTCAGGTTTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD161098             [                  GCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAGGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCCCAGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD159358             [                  GCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGATTGGAGGAGGGAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGAGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTATGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCCCAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD068181             [                  GCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD119763             [                  GCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATCGTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGATGAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGTTCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAAATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATAGCTCGCTTGTTGTTACATAATAAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD178545             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     AATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTGACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCCCAGGTCTTAATATACAATCCAGCTCCAGTGATAGTCAAGCAGTAATGGCAACTATTCACGCGATTCTAAATTTTAATGTTCAGGCCGTCCCATACATATTCCCTCCAAAAATCACTCCAGGTTAACAGTCATTATTTATATTTTCGTACTTAATTTATAACTGATTCTTTTTGCTGTTTAATAATTTTTTCGCTTGCTAAATATAATTGTTAAAATGAGAGCTATGCTTGACCTCACTTAAGTATTTCTATGCTTCCCCCTTAAAGATATGTTTCAGAAGTTTTTAACTGAGGTTTG]




>consensus_9772#0
TTACGATGGCGGAAAGAAGCGGTTCTGTTTAAAATCTAGGTCGAAATGGTAGTCCTCATC
GTCTAATGCTCTGTCCTCAGAATGGAGGAGGAAAACAATGACCAGTCATATGATTCAGAT
GAGTCAGACGATTACAATTATATGGAGCCGGAATATGATGTAGAGGGGGAAAGGTTTTGT
TCCGACAGACTTCATCCTGAATCTTTTCTGTACAAATCCTTTGAAAGGAATGAGGTTGAA
ATTTTCCTGAACAGCACAGTTGATACTCTGTGTAACTTAATCAGTGTACCACCAGCCATA
GCTCGCTTGTTGTTACATAATAATAAATGGGATGTAGAGGCAATCAAGAAAAGGTTTTTG
ACCAATCCTTTGGCCACGTTAATTAATCACAATATACTCCCAGGTCTTAATATACAATCC
AGCTCCAGTGATAGTCAAGCAGTAATGGCAACTATTCACGCGATTCTAAATTTTAATGTT
CAGGCCGTCCCATACATATTCCCTCCAAAAATCACTCCAGGTTAACAGTCATTATTTATA
TTTTCGTACTTAATTTATAACTGATTCTTTTTGCTGTTTAATAATTTTTTCGCTTGCTAA
ATATAATTGTTAAAATGAGAGCTATGCTTGACCTCACTTAAGTATTTCTATGCTTCCCCC
TTAAAGATATGTTTCAGAAGTTTTTAACTGAGGTTTG
clustalw multiple alignements is not computed in this case