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Schistosoma mansoni
cluster # 9778 cluster # 9778       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9778#0 length = 555 sequences # 11  

consensusID : consensus_9778#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 555
fasta sequence
                              [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT-GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA-GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTTA]

[+] EMBL CD200089             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCGCGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTANNGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTTA]
[+] EMBL CD200055             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTANNGTG TCGTCCACAGGGTCAAATGTTTT ]
[+] EMBL CD200061             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAANACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTANGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTT ]
[+] EMBL CD200059             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTT ]
[+] EMBL CD200090             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACGTCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGANAAAGATACACAACGAAAACCATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGGTAGGGTG TCGTCCACAGGGTCAAATGTTTT ]
[+] EMBL CD200047             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACGTACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGACAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTT AAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTT ]
[+] EMBL CD200024             [GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGGCCCTGNTATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATTGGCT AGTGGTTTAAAGG TA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAAGGTTTa ]
[-] EMBL CD200027             [ AATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGGGTATACTAAAACTAATTATACAT AAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATACATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCTGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATCGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTTA]
[-] EMBL CD200072             [                                                                                                                                       AGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTTA]
[-] EMBL CD200042             [                                                                                                                                                                TACTTAGTGATTAGATAATCGTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAACAGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCAACTATGGGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTTA]
[-] EMBL CD200025             [                                                                                                                                                                                                                                                        CAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCAAAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGCGGCTCCTCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGTGAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAAGCTAGAGTTATACACCATTAGGTATT GCTAAGTGGTTTAAAGGTTA GGTGTTCGTCCACAGGGTCAAATGTTTTA]


>consensus_9778#0 GAATAATCAAATCAGTGGTACTATAGAATAAATGTAAAATACTTTCACATACCTCAGTGG GTATACTAAAACTAATTATACATAAAATTCGGAAACACTAGTGACCTTACGTTACCAATA CATCTGATAACTCTAAGGAGAAGATTCTATTAAGTATCTATACTTAGTGATTAGATAATC GTAGATATAGTCTGTGTAGTTGGCAATTGATGATATTAGATTGTAAGTTTCAAGAAAAAC AGAATTGTCAGTATGGGGTTGCGGAGGTTGTCAGATTTCATTAAGATCACGAATCCCCCA AAGATAATCATTAAAAACCTGGAAGCACTGCGCAGCCGTTTCTTCCTACTATGGGGCTCC TCGACAGTGTGCATCCACGACCCTGTAATAGAGAAGAGAACCCAGAACCGTTTCGAGTGT GAAAAAGATACACAACGAAAACAATGAAAGATGGTTGGACAATATCATGGATTGATTGAA GCTAGAGTTATACACCATTAGGTATTGCTAAGTGGTTTAAAGGTTAGGTGTTCGTCCACA GGGTCAAATGTTTTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)