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Schistosoma mansoni
cluster # 9781 cluster # 9781       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9781#0 length = 1578 sequences # 11  

consensusID : consensus_9781#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1578
fasta sequence
                              [GAAAATCAACAGGCTCCGAGTCAGATGTACGTAATGACTCTAAGAAATCCAAAGGATCTACGCCAGACATAAGGTTGAAAGATGGCGAAGGCGAGAAAAAGAAGAAGGGTTTACATTTAAAAAATCCTTTTAAACGTTCGAAAACTAAAGACCAAACACCTTCGATAGCATCAGATATTACTATTGCTAGGAGCACTAAAAATCCGGTAATTAATGTAGCTGTCACTGAACGATTACCAAAAGAGATGTCTAAAAAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAAGACTTGAGTTTAAGACCT]

[-] EMBL CD165465             [GAAAATCAACAGGCTCCGAGTCAGATGTACGTAATGACTCTAAGAAATCCAAAGGATCTACGCCAGACATAAGGTTGAAAGATGGCGAAGGCGAGAAAAAGAAGAAGGGTTTACATTTAAAAAATCCTTTTAAACGTTCGAAAACTAAAGACCAAACACCTTCGATAGCATCAGATATTACTATTGCTAGGAGCACTAAAAATCCGGTAATTAATGTAGCTGTCACTGAACGATTACCAAAAGAGATGTCTAAAAAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD097445             [                                                                                                                                                                                                                                                              gAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD062143             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         AAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTTTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATCCACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGTTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTTTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD169678             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD065152             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CCA CAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACA TGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD065173             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTATACCAACTGATCGTATAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGa                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[-] EMBL CD168851             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAA                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD169379             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             TTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCTATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATTAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAA                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI977633             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATNTATTAAAAGATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATNTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGT                                                             ]
[+] EMBL CD117588             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     GAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAAGACTTGAGTTTAAGACCT]
[-] EMBL CD066474             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      GTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCGAGTACAATTCAGCT                                        ]


>consensus_9781#0 GAAAATCAACAGGCTCCGAGTCAGATGTACGTAATGACTCTAAGAAATCCAAAGGATCTA CGCCAGACATAAGGTTGAAAGATGGCGAAGGCGAGAAAAAGAAGAAGGGTTTACATTTAA AAAATCCTTTTAAACGTTCGAAAACTAAAGACCAAACACCTTCGATAGCATCAGATATTA CTATTGCTAGGAGCACTAAAAATCCGGTAATTAATGTAGCTGTCACTGAACGATTACCAA AAGAGATGTCTAAAAAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCAT CAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATT TTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATA CATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTG ATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACT CGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATA TAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTT CCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATAC ACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAA GCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAA GTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATG CAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAA AAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTG ATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAG GTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGAT CAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAG ACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAAT ATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATT CACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTT ATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTA TTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAA GTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAA GACTTGAGTTTAAGACCT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)