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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9781#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1578 fasta sequence
[GAAAATCAACAGGCTCCGAGTCAGATGTACGTAATGACTCTAAGAAATCCAAAGGATCTACGCCAGACATAAGGTTGAAAGATGGCGAAGGCGAGAAAAAGAAGAAGGGTTTACATTTAAAAAATCCTTTTAAACGTTCGAAAACTAAAGACCAAACACCTTCGATAGCATCAGATATTACTATTGCTAGGAGCACTAAAAATCCGGTAATTAATGTAGCTGTCACTGAACGATTACCAAAAGAGATGTCTAAAAAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAAGACTTGAGTTTAAGACCT]
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[-] EMBL CD062143 [ AAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTTTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATCCACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGTTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTTTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGG ]
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[+] EMBL CD169379 [ TTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCTATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATTAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAA ]
[+] EMBL AI977633 [ ACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATNTATTAAAAGATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATNTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGT ]
[+] EMBL CD117588 [ GAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAAGACTTGAGTTTAAGACCT]
[-] EMBL CD066474 [ GTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCGAGTACAATTCAGCT ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||