These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9781#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1578 fasta sequence [GAAAATCAACAGGCTCCGAGTCAGATGTACGTAATGACTCTAAGAAATCCAAAGGATCTACGCCAGACATAAGGTTGAAAGATGGCGAAGGCGAGAAAAAGAAGAAGGGTTTACATTTAAAAAATCCTTTTAAACGTTCGAAAACTAAAGACCAAACACCTTCGATAGCATCAGATATTACTATTGCTAGGAGCACTAAAAATCCGGTAATTAATGTAGCTGTCACTGAACGATTACCAAAAGAGATGTCTAAAAAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAAGACTTGAGTTTAAGACCT] [-] EMBL CD165465 [GAAAATCAACAGGCTCCGAGTCAGATGTACGTAATGACTCTAAGAAATCCAAAGGATCTACGCCAGACATAAGGTTGAAAGATGGCGAAGGCGAGAAAAAGAAGAAGGGTTTACATTTAAAAAATCCTTTTAAACGTTCGAAAACTAAAGACCAAACACCTTCGATAGCATCAGATATTACTATTGCTAGGAGCACTAAAAATCCGGTAATTAATGTAGCTGTCACTGAACGATTACCAAAAGAGATGTCTAAAAAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATG ] [-] EMBL CD097445 [ gAACCAGCACCTGAAATTGCAGCTTATCTTCATAAATCCAATCCATCAACTGAATTTGATGCACTTAATTTAACTGGTCGTGAAACACTGTCTGAAGATACTCATTTTCCACCTTTTGACAGAAAATATTATGATGGATATGAAAATATTGGTAGTCCTTATGATACATTTAAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCA ] [-] EMBL CD062143 [ AAACGCAAGACGTTGGATGACTCAAGAAAATCTATCGAGATTTCATCTTTAAGTGATTTGCACTCACATGGTAAACTTAAAGGACCAGCTCCAGAATTAGCAGCTTTAATTCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTTTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATCCACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGTTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTTTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGG ] [+] EMBL CD169678 [ TCACTCGAAACATCCTACTTCAAATCTAGAAGATATAACCATTGCTCAAGGTTCAGACTCACATATAAGACCATTCACACCAGCTGATCAATCACCTAGGCCACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTA ] [+] EMBL CD065152 [ CCA CAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACA TGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTA ] [+] EMBL CD065173 [ ACCAAGATATACTAGAGAACCTTCCTCTGACATTGCAAATTTAAAATTAAAAGGTACAGCTCCTGAAATAGCGGCGATAATACACTCAAGAACTAAAAGTCCTAACCATGAAGATATAACGCTTACTCAGAGCTGTGATCCAAGCTTCGGTCCGTATTCTACAGTGGATACGTCAGGAAAAAAACCCTTGAAGCCAAGTGGAAGTGCATCAGAGATAGCTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTATACCAACTGATCGTATAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGa ] [-] EMBL CD168851 [ CTGCGGATATACACAAAAACAATTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAA ] [+] EMBL CD169379 [ TTTAGCAGACCATCTACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCTATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATTAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAA ] [+] EMBL AI977633 [ ACCCTATGCAGATTATACCTTAACTGGTACTAATAACAATGACATACAAGGAATAAAGCATGGACTAAAAGAAAAAGTGCAATCTTCACGTAAATCTCGTTCTTTAAGTGAATATATATCAGACAGTGATGAAACAGAGAGTGCAGGCAGTGACGTGTATACTGACAATGAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATNTATTAAAAGATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATNTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGT ] [+] EMBL CD117588 [ GAATGCTACTTAGAAGTAGGTAAAAGTCAATACTATTTTGATCGTAAACGTTCTCTGAAAAATTATCGTTCCAAACGATCAACAAAATTGGAACGTGAAGCTAGACGTAATATGGGGTTATATAAAACTGGGAGTCAAGACTCAGTAAGCAGCAGTATTTCGTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCAAGTACAATTCAGCTGTACGTCAATCCTGTTTCATAAGACTTGAGTTTAAGACCT] [-] EMBL CD066474 [ GTCGCTTAAACCAACTGATCGTAAAATGACCCCGAAATATAGAAAACGTCCAAGTGCTAAAAAGGAAGAAGTTTCATCTTGGTTGAACAGCTCTAATTCACCCTATAATCCAATCCGTGTAGATGGGAATATATATCCAAGTTATACATCAAATGTTTATGCTGCAGCTCCTATAATTCAAAAATCTTTAATTCAAAACTATTTATTAAAAAATATTATTCAGTCAATAAAATGTGATACCACCATGGATTTACCATATCCTCTAACAATTGGACGAAGTGCACTAGTTTATGGTCATTTCGAGTACAATTCAGCT ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||