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consensusID : consensus_9783#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 1125 fasta sequence
[GAGCCTTATTCGGCACGACGCAAAGGCCCACCGGATACTCCTTATACTGGCGCTGAATTCAATTTAGACATTATAATCCCTGAAAATTACCCATTTGTTCCCCCAAAGGTTAAATTTATCACAAAAATTTGGCATCCTAATATTAGTAGTGCTACTGGTGTAATTTGCCTTGATGTACTGAAAGATCAGTGGGCTGCTGCTATGTCATTACGTACTATACTTCTGTCTATTCAAGCATTATTAGCTTCTCCAGAACCAGATGATCCACAAGATGCAGTTGTTGCTAATCAATACAAAAGTAGTATAGATGCTTTTAATCGAACTGCACGTCATTGGGATTTAGCAATGGCAACAGAACATTTAATAAAATGATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTATATATACACATAGAAATGTATCGATAATTTCATTAGTTCTATTTATAAACTTATGATGTAATTAACGATTTGTTCATAATTAAGCGTGTATCACTTTGGTGTTTTCCACCCTATATTGCTCTCTTTCCTCCCTGGACCCTTCTTCCTTCCCCTACCCCTTTTACAACTTTCTCCCCCCCTTTTCCTAATGAGTTTTTCTATACTCACGTATGTATACTTTATTTCTGCCTTGTTGCTTGCCCTACCTGCGTGCCGGTTTTTTTGGATTCCTTCAATTTCCAACGTTTCAAAACTTTTGTGGCTAATTTTTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCTTGACAACAACTTGACAACAACAACAACCATATTTACTATTTTCATTATTTGAAATAGTAGGTACATTGTTCATTCCAAATCCTTGTTGCTATCCATGGTCTTTATATGATGCCTTCTTGTTACCATATTGTATGTATGATTACATAANTGAA--CCATATCCATGTAATCACTATGACGTNATC-ACTAATCTATTCTTATGCATATTATNGNNTG-ATAAATGATATTAGAGAAGTGAAT-AATTANGGTTTTATAGAGAGTATTCATGTATTTACTTTTGAAATGTTCAATCTTGTTGAGTGCGTTATGTTACAACTTAATCTCTGTGCTAATGCTGTAGTATGACAACTTGAACTGATGTACGTAAGTAT]
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[+] EMBL CD169784 [ ATGGCAACAGAACATTTAATAAAATGATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTATATATACACATAGAAATGTATCGATAATTTCATTAGTTCTATTTATAAACTTATGATGTAATTAACGATTTGTTCATAATTAAGCGTGTATCACTTTGGTGTTTTCCACCCTATATTGCTCTCTTTCCTCCCTGGACCCTTCTTCCTTCCCCTACCCCTTTTACAACTTTCTCCCCCCCTTTTCCTAATGAGTTTTTCTATACTCACGTATGTATACTTTATTTCTGCCTTGTTGCTTGCCCTACCTGCGTGCCGGTTTTTTTGGATTCCTTCAATTTCCAACGTTTCAAAACTTTTGTGGCTAATTTTTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCTTGACAACAACTTGACAACAACAACAACCATATTTACTATTTTCATTATTTGAAATAGTAGGTACATTGTT ]
[+] EMBL CD137076 [ TCATTAGTTCTATTTATAAACTTATGATGTAATTAACGATTTGTTCATAATTAAGCGTGTATCACTTTGGTGTTTTCCACCCTATATTGCTCTCTTTCCTCCCTGGACCCTTCTTCCTTCCCCTACCCCTTTTACAACTTTCTCCCCCCCTTTTCCTAATGAGTTTTTCTATACTCACGTATGTATACTTTATTTCTGCCTTGTTGCTTGCCCTACCTGCGTGCCGGTTTTTTTGGATTCCTTCAATTTCCAACGTTTCAAAACTTTTGTGGCTAATTTTTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCTTGACAACAACTTGACAACAACAA ]
[+] EMBL CD115944 [ ctggcacgTTTCCTCCCTGGACCCTTCTTCCTTCCCCTACCCCTTTTACAACTTTCTCCCCCCCTTTTCCTAATGAGTTTTTCTATACTCACGTATGTATACTTTATTTCTGCCTTGTTGCTTGCCCTACCTGCGTGCCGGTTTTTTTGGATTCCTTCAATTTCCAACGTTTCAAAACTTTTGTGGCTAATTTTTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCTTGACAACAACTTGACAACAACAACAACCATATTTACTATTTTCATTATTTGAAATAGTAGGTACATTGTTCATTCCAAATCCTTGTTGCTATCCATGGTCTTTATATGATGCCTTCTTGTTACCATATTGTATGTATGATTACATAA TGAAACCCATATCAATGTAATCACTATGACGTAATCAACTAATCTATTCTTATGCATATTATTG TTGTATAAATGATATTAGAGAAGTGAATAAATTA GGTTTTATAGAGAGTATTCATGTATTTACTTTTGAAATGTTCAATCTTGTTGAGTGCGTTATGTTACAACTTAATCTCTGTGCTAATGCTGTAGTATGACAACTTGAACTGATGTACGTAAGTAT]
[-] EMBL CD137795 [ TTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCCTGACAACAACTTGACAACAACAACAACCATACTTACTATTTTCATTATTTGAAATAGTAGGTACATTGTTCATTCCAAATCCTTGTTGCTATCCATGGTCTTTATATGATGCCTTCTTGTTACCATATTGTATGTAT ]
consensusID : consensus_9783#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 1022 fasta sequence
[CTGGGGGTGTTTGCCGGTTTCGGAATGGCCAGCATTGCGGGTAAACGTATTCAAAAGGAGTTAGCTGAGCTGATGAAATCAGATGAAGCAGCACAGAATCAGTTGGAAATAAAACCTTGTAATGATGATATGATGCATTTATGTGGTCTCATCAAAG-GCCCACCGGATACTCCTTATACTGGCGCTGAATTCAATTTAGACATTATAATCCCTGAAAATTACCCATTTGTTCCCCCAAAGGTTAAATTTATCACAAAAATTTGGCATCCTAATATTAGTAGTGCTACTGGTGTAATTTGCCTTGATGTACTGAAAGATCAGTGGGCTGCTGCTATGTCATTACGTACTATACTTCTGTCTATTCAAGCATTATTAGCTTCTCCAGAACCAGATGATCCACAAGATGCAGTTGCTGCTAATCAATACACAAGTAGTATAGATGCTCTTAATCGAACTGCACGTCATTGAGCAGGTATTTATGCTAATGGACCTGGATGTGATCCTCATTGTGTCGACTTAGTAGATAAACTTGTTCAAATGGGTTTTGATGAGCATGAAGCTTGTCGTGCATTATCTATGAAGAATCGGGATTTAGCAATGGCAACAGAACATTTAATACAATGATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTATATATACACATAGAAATGTATCGATAATTTCATTAGTTCTATTTATAAACTTATGATGTAATTAACGATTTGTTCATAATTAAGCGTGTATCACTTTGGTGTTTTCCACCCTATATTGCTCTCTTTCCTCCCTGGACCCTTCTTCCTTCCCCTACCCCTTTTACAACTTTCTCCCCCCCTTTTCCTAATGAGTTTTTCTATACTCACGTATGTATACTTTATTTCTGCCTTGTTGCTTGCCCTACCTGCGTGCCGGTTTTTTTGGATTCCTTCAATTTCCAACGTTTCAAAACTTTTGTGGCTAATTTTTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCTTGACAACAACTTG]
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[+] EMBL AI976886 [ TGGGGGTGTTTGCCGGTTTCGGAATGGCCAGCATTGCGGGTAAACGTATTCAAAAGGAGTTAGCTGAGCTGATGAAATCAGATGAAGCAGCACAGAATCAGTTGGAAATAAAACCTTGTAATGATGATATGATGCATTTATGTGGCCTCATCAAAG GCCCACCGGATACTCCTTATACTGGCGCTGAATTCAATTTAGACATTATAATCCCTGAAAATTACCCATTTGTTCCCCCAAAGGTTAAATTTATCACAAAAATTTGGCATCCTAATATTACTAGTGCTACTGGTGTAATTTGCCTTGATGTACTGAAAGATCAGTGGGCTGCTGCTATGTCATTACGTACTATACTTCTGTCTATTCAAGCATTATTAGCTTCTCCAGAACCAGATGATCCACAAGATGCAGTTGCTGCTAATCAATACACAAGTAGTATAGATGCTCTTAATCGAACTGCACGTCATTGAGCAGGTATTTATGCTAATGGACCTGGATGTG ]
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[-] EMBL CD131916 [ CTTGTAATGATGATATGATGCATTTATGTGGTCTCATCAAAG GCCCACCGGATACTCCTTATACTGGCGATGAATTCAATTTAGACATTATAATCCCTGAAAATTACCCATTTGTTCCCCCAAAGGTTAAATTTATCACAAAATTTTGGCATCTTAATATTAGTAGTGCTACTGGTGTAATTTGCCTTGATGTACTGAAAGATCAGTGGGCTGCTGTTATGTCATTACGAACTATACTTCTGTCTATTCAAGCATTATTAGCTTCTCCAGttt ]
[+] EMBL CD125803 [ TCCCATCATAGAGGCCA CGTATA TCCTTATACTGGCGCTGAATTCAATTTAGACATTATAATCCCTGAAAATTACCCATTTGTTCCCCCAAAGGTTAAATTTATCACAAAAATTTGGCATCCTAATATTAGTAGTGCTACTGGTGTAATTTGCCTTGATGTACTGAAAGATCAGTGGGCTGCTGCTATGTCATTACGTACTATACTTCTGTCTATTCAAGCATTATTAGCTTCTCCAGAACCAGATGATCCACAAGATGCAGTTGTTGCTAATCAATACAAAAGTAGTATAGATGCTTTTAATCGAACTGCACGTCATTGGGCAGGTATTTATGCTAATGGACCTGGATGTGATCCTCATTGTGTCGACTTAGTAGATAAACTTGTTCAAATGGGTTTTGATGAGCATGAAGCTTGTCGTGCATTATCTATGAAGAATCGGGATTTAGCAATGGCAACAGAACATTTAATACAATGATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTATATATACACATAGAAATGTATCG ]
[+] EMBL CD083537 [ gaggGTGATCCTCATTGTGTCGACTTAGTAGAT AACTTGTCCAAATGGGTTTTGATGAGCATGAAGCTTGTCGTGCATTATCTATGAAGAATTGGGATTTAGCAATGGCAACAGAACATTTAATAAAATGATTCTTCTTCTTCTTCTTTTTTTATATATACACATAGAAATGTATCGATAATTTCATTAGTTCTATTTATAAACTTATGATGTAATTAACGATTTGTTCATAATTAAGCGTGTATCACTTTGGTGTTTTCCACCCTATATTGCTCTCTTTCCTCCCTGGACCCTTCTTCCTTCCCCTACCCCTTTTACAACTTTCTCCCCCCCTTTTCCTAATGAGTTTTTCTATACTCACGTATGTATACTTTATTTCTGCCTTGTTGCTTGCCCTACCTGCGTGCCGGTTTTTTTGGATTCCTTCAATTTCCAACGTTTCAAAACTTTTGTGGCTAATTTTTATTTCCTTGTCGCTGCTGTTTGTACATTTTGTACATCAAAAAAATGGTCTCTTGACAACAACTTG]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_9783#0 ------------------------------------------------------------
consensus_9783#1 CTGGGGGTGTTTGCCGGTTTCGGAATGGCCAGCATTGCGGGTAAACGTATTCAAAAGGAG 60
consensus_9783#0 ------------------------------------------------------------
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** **** ** * ***************************
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consensus_9783#1 TGGCGCTGAATTCAATTTAGACATTATAATCCCTGAAAATTACCCATTTGTTCCCCCAAA 239
************************************************************
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consensus_9783#1 GGTTAAATTTATCACAAAAATTTGGCATCCTAATATTAGTAGTGCTACTGGTGTAATTTG 299
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consensus_9783#1 CCTTGATGTACTGAAAGATCAGTGGGCTGCTGCTATGTCATTACGTACTATACTTCTGTC 359
************************************************************
consensus_9783#0 TATTCAAGCATTATTAGCTTCTCCAGAACCAGATGATCCACAAGATGCAGTTGTTGCTAA 287
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***************************************************** ******
consensus_9783#0 TCAATACAAAAGTAGTATAGATGCTTTTAATCGAACTGCACGTCATTG------------ 335
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consensus_9783#0 ------------------------------------------------------------
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***
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consensus_9783#1 ------------------------------------------------------------
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consensus_9783#1 ----------------------------------------------------------
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| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||