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Schistosoma mansoni
cluster # 9789 cluster # 9789       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9789#0 length = 1144 sequences # 11  

consensusID : consensus_9789#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1144
fasta sequence
                              [AGGCCAANAATTTGGCACGAGGACCATTTTCATTTCAACATTATTGTGATACAGTTTTTTTGACTTTCGGATAGAAACAAAAACAAAACAAATCATAATCGAATTTCATATATGATGAATCCATCAAGTAAAAAAAGAAAAATATGTCTTCCTATAGATGGAAGTGATCATTCAAAACGTGCAGTTCAATGGTTTATTAAAGATGTTTATAGACATGGTGATGAAGTATTATTTGTACATTGTATAGAATTACCTAATTTACCAGCAATTAGTTTTACATCTGGTTTAAAAGTACCTATTGATGATTGGACTAAAGCATTACAAGAAAATATCGCTCGATCAACTAAATTGAACAATGAATATGGTTTTATGTGTGAAAGTAAAAAGATACCATATGATTTTGTAATAAAAAATGGTGTATCTCCAGGTGTTGGAATAGTTCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTTTCTTAACATCATA-TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA-TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACACCAATTCTTACACCTATATGCAAAAAGTTCAAAATCTACATTCTCTTCAGTAACCTTCAATGTTTCCATATTAAATCATTAACCTTGTGTTATACAGTTTTTAAGATCATATATGAAGTA]

[+] EMBL CD081398             [AGGCCAANAATTTGGCACGAGGACCATTTTCATTTCAACATTATTGTGATACAGTTTTTTTGACTTTCGGATAGAAACAAAAACAAAACAAATCATAATCGAATTTCATATATGATGAATCCATCAAGTAAAAAAAGAAAAATATGTCTTCCTATAGATGGAAGTGATCATTCAAAACGTGCAGTTCAATGGTTTATTAAAGATGTTTATAGACATGGTGATGAAGTATTATTTGTACATTGTATAGAATTACCTAATTTACCAGCAATTAGTTTTACATCTGGTTTAAAAGTACCTATTGATGATTGGACTAAAGCATTACAAGAAAATATCGCTCGATCAACTAAATTGAACAATGAATATGGTTTTATGTGTGAAAGTAAAAAGATACCATATGATTTTGTAATAAAAAATGGTGTATCTCCAGGTGTTGGAATAGTTCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTNTCTTAACATCATA TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTNTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD070527             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGNGTTTATGANACTTTCTTAACATCATA TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGGTCTTCCTTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD070505             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD070526             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCACGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGANACTTTCTTAACATCATA TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGNTATTACTGTC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD070555             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTTTCTTAACATCATATTTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD075229             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ACTGGATANCTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACACCAATTCTTACACCTATATGCAAAAAGTTCAAAATCTACATTCTCTTCAGTAACCTTCAATGTTTCCATATTAAATCATTAACCTTGTGTTATACAGTTTTTAAGATCATATATGAAGTA]
[-] EMBL CD070515             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTGACACTTTTCTCTA TCATTTATGTAGTACGTTATTACTGTCA TTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTNTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTCGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACA                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD199697             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAA                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD169417             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         CTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACAGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTACCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTA TTTTTTTTGTAGAATTCAGATCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACACCA                                                                                                                     ]
[-] EMBL CD070472             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTATTACTGTCA TTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACA                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD070574             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             AGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATGTCACAATGTTTCTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCTCTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTATATAACA                                                                                                                        ]


>consensus_9789#0 AGGCCAANAATTTGGCACGAGGACCATTTTCATTTCAACATTATTGTGATACAGTTTTTT TGACTTTCGGATAGAAACAAAAACAAAACAAATCATAATCGAATTTCATATATGATGAAT CCATCAAGTAAAAAAAGAAAAATATGTCTTCCTATAGATGGAAGTGATCATTCAAAACGT GCAGTTCAATGGTTTATTAAAGATGTTTATAGACATGGTGATGAAGTATTATTTGTACAT TGTATAGAATTACCTAATTTACCAGCAATTAGTTTTACATCTGGTTTAAAAGTACCTATT GATGATTGGACTAAAGCATTACAAGAAAATATCGCTCGATCAACTAAATTGAACAATGAA TATGGTTTTATGTGTGAAAGTAAAAAGATACCATATGATTTTGTAATAAAAAATGGTGTA TCTCCAGGTGTTGGAATAGTTCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATT GGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTA GTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGA CTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTTTCTTAACATCATATTTTTTTAT ACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCATTATGTAGTACGTTATT ACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTT TTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTT ATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGT GTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTG CTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTAT AACACCAATTCTTACACCTATATGCAAAAAGTTCAAAATCTACATTCTCTTCAGTAACCT TCAATGTTTCCATATTAAATCATTAACCTTGTGTTATACAGTTTTTAAGATCATATATGA AGTA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)