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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9789#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1144 fasta sequence
[AGGCCAANAATTTGGCACGAGGACCATTTTCATTTCAACATTATTGTGATACAGTTTTTTTGACTTTCGGATAGAAACAAAAACAAAACAAATCATAATCGAATTTCATATATGATGAATCCATCAAGTAAAAAAAGAAAAATATGTCTTCCTATAGATGGAAGTGATCATTCAAAACGTGCAGTTCAATGGTTTATTAAAGATGTTTATAGACATGGTGATGAAGTATTATTTGTACATTGTATAGAATTACCTAATTTACCAGCAATTAGTTTTACATCTGGTTTAAAAGTACCTATTGATGATTGGACTAAAGCATTACAAGAAAATATCGCTCGATCAACTAAATTGAACAATGAATATGGTTTTATGTGTGAAAGTAAAAAGATACCATATGATTTTGTAATAAAAAATGGTGTATCTCCAGGTGTTGGAATAGTTCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTTTCTTAACATCATA-TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA-TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACACCAATTCTTACACCTATATGCAAAAAGTTCAAAATCTACATTCTCTTCAGTAACCTTCAATGTTTCCATATTAAATCATTAACCTTGTGTTATACAGTTTTTAAGATCATATATGAAGTA]
[+] EMBL CD081398 [AGGCCAANAATTTGGCACGAGGACCATTTTCATTTCAACATTATTGTGATACAGTTTTTTTGACTTTCGGATAGAAACAAAAACAAAACAAATCATAATCGAATTTCATATATGATGAATCCATCAAGTAAAAAAAGAAAAATATGTCTTCCTATAGATGGAAGTGATCATTCAAAACGTGCAGTTCAATGGTTTATTAAAGATGTTTATAGACATGGTGATGAAGTATTATTTGTACATTGTATAGAATTACCTAATTTACCAGCAATTAGTTTTACATCTGGTTTAAAAGTACCTATTGATGATTGGACTAAAGCATTACAAGAAAATATCGCTCGATCAACTAAATTGAACAATGAATATGGTTTTATGTGTGAAAGTAAAAAGATACCATATGATTTTGTAATAAAAAATGGTGTATCTCCAGGTGTTGGAATAGTTCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTNTCTTAACATCATA TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTNTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATT ]
[+] EMBL CD070527 [ TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGNGTTTATGANACTTTCTTAACATCATA TTTTTTTATACTTACTGGATTACTGGTCTTCCTTGACA ]
[+] EMBL CD070505 [ TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGA ]
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[+] EMBL CD070555 [ TCAAGCTGTAGAAGAGCATCATGTTGATCTAATTGTCATTGGTAACCGTGGACTAAGTAGACTAAAACGTACACTTCTTGGCAGTGTAAGTAGTTATGTAGTACACAATGCATATGTACCATGTATTATGGTGCCACCAGTTTGAAGAAAAGAACAATGACTGTTTATATTTATATATATGAAGTGTTTATGAAACTTTCTTAACATCATATTTTTTTTATACTTACTGGATTACTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCA ]
[-] EMBL CD075229 [ ACTGGATANCTGTTCTTCCTTGACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACACCAATTCTTACACCTATATGCAAAAAGTTCAAAATCTACATTCTCTTCAGTAACCTTCAATGTTTCCATATTAAATCATTAACCTTGTGTTATACAGTTTTTAAGATCATATATGAAGTA]
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[+] EMBL CD199697 [ GACACTTTTCTCTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAA ]
[+] EMBL CD169417 [ CTATTCA TTATGTAGTACGTTATTACTGTCATTTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACAGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTACCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTA TTTTTTTTGTAGAATTCAGATCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACACCA ]
[-] EMBL CD070472 [ GTTATTACTGTCA TTTAGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATTTCACAATGTTTTTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCACTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTTTATAACA ]
[-] EMBL CD070574 [ AGAAAAGGAACACGTCTACTAATCATTTGTTGTCTTATGTCACAATGTTTCTAAAGTGTCTATATGATGTTGACGGTTGAAACTATATAAGAAAGCTGTATCTTCCCTTATTTTTCAATTTATAAGAAGTTGGGAATGATTACTTTTGTTTATAATCGATATCAATGGTGTAAATTCGATTGCTCAGTATTTTTTTTTGTAGAATTCAGGTCTATTACTACATCTTCTGCTTACTATTTTGGTGTCAAGCTCTGGTTTGGATGATCTTTAAATATCTGTTTCATTATATAACA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||