cluster # 9797

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Schistosoma mansoni
cluster # 9797 cluster # 9797 Sequences # 11 consensus # 2

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consensus_9797#0 length = 602 sequences # 7

consensus_9797#1 length = 512 sequences # 4

consensusID : consensus_9797#0
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Sequences nbr = 7
consensus length = 602
fasta sequence

                              [CGAATGAATTAGCGGCGTAAATCGCTTGAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGTTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTAGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGGCATTCAGTCAAGTTAGTGGTCTACCCATATGGATATCCATATTATCTACTGGTCTGGTGGCTACATTTTATACAGCTTTTGGTGGTATTCGTGCAGTTGTATGGGTTGATCTTTTTCAACTGATTGTTCTCATCAGTGGATTATGTTTAATCACATTATTAATTACTTTAAAAGTCGGTGGATTCCCACGTCTATGGGGTATAGTACTAGACGGCAGCG]

[+] EMBL CD113813             [CGAATGAATTAGCGGCGTAAATCGCTTGAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGGCATTCAGTCAAGTTAGTGGTCTACCCATATGGATATCCATATTATCTACTGGTCTGGTGGCTACATTTTATACAGCTTTTGGTGGTATTCGTGCAGTTGTATGGGTTGATCTTTTTCAACTGATTGTTCTCATCAGTGGATTATGTTTAATCACATTATTAATTACTTTAAAAGTCGGTGGATTCCCACGTC                           ]
[-] EMBL CD165799             [                                                                                                             ATGGCCAGTTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTAGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGATAGTTTACTTTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGG                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD165765             [                                                                                                             ATGGCCAGTTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTAGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGATAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGG                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD165778             [                                                                                                             ATGGCCAGTTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTAGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGATAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGG                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD113770             [                                                                                                                                                                                                            TATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGGCATTCAGTCAAGTTAGTGGTCTACCCATATGGATATCCATATTATCTACTGGTCTGGTGGCTACATTTTATACAGCTTTTGGTGGTATTCGTGCAGTTGTATGGGTTGATCTTTTTCAACTGATTGTTCTCATCAGTGGATTATGTTTAATCACATTATTAATTACTTTAAAAGTCGGTGGA TCCAACGTCTATGGGGTATAGTACTAGACGGCAGCG]
[+] EMBL CD113773             [                                                                                                                                                                                                                                                         TAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGGGATTCAGTCCAG                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD120011             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TATTATCTACTGGTCTGGTGGCTACATTATATACAGCTTTTGGTGGTATTCGTGCAGTTGTATGGGTTGATCTTTTTCAACTGATTGTTCTCATCAGTGGATTATGTTTAATCACATTATTAATTACTTTAAAAGTCGGTGGAT                                    ]




>consensus_9797#0
CGAATGAATTAGCGGCGTAAATCGCTTGAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATT
ATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGTTT
TTTATCAGCTGTCGCTATATTAGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATT
CATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCC
AGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAA
ACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCT
TGCATTGTATGCGCCTGCTTTGGCATTCAGTCAAGTTAGTGGTCTACCCATATGGATATC
CATATTATCTACTGGTCTGGTGGCTACATTTTATACAGCTTTTGGTGGTATTCGTGCAGT
TGTATGGGTTGATCTTTTTCAACTGATTGTTCTCATCAGTGGATTATGTTTAATCACATT
ATTAATTACTTTAAAAGTCGGTGGATTCCCACGTCTATGGGGTATAGTACTAGACGGCAG
CG

consensusID : consensus_9797#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
consensus length = 512
fasta sequence

                              [CTATGTGAGATCTGTATTAGCTGCAATATGT-GTCACCTGTGCAATGGTCAGATTATTTGATTTTCGCTATTTCACTTATTTGTTACTCCCTGATTGGGATTTATCATCGATATCATAATGTAATTTTTGAGAAATTAACTAGTTGTTTTCCTGGTATCAACTTTAAACCAAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTAT]

[+] EMBL CD113840             [CTATGTGAGATCTGTATTAGCTGCAATATGTCGTCAACTGTCCAATGGTCAGATTATTTGATTTTCGCTATTTCACTTATTTGTTACTCCCTGATTGGGATTTATCATCGATATCATAATGTAATTTTTGAGAAATTAACTAGTTGTTTTCCTGGTATCAACTTTAAACCAAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTG   ]
[+] EMBL CD113748             [                          TATGT GTCACCTGTGTAATGGTCAGATTATTTGATTTTCGCTATTTCACTTATTTGTTACTCCCTGATTGGGATTTATCATCGATATCATAATGTAATTTTTGAGAAATTAACTAGTTGTTTTCCTGGTATCAACTTTAAACCAAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTACAAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTAT]
[+] EMBL CD113758             [                          TATGT GTCACCTGTGCAATGGTCAGATTATTTGATTTTCGCTATTTCACTTATTTGTTACTCCCTGATTGGGATTTATCATCGATATCATAATGTAATTTTTGAGAAATTAACTAGTTGTTTTCCTGGTATCAACTTTAAACCAAAAGTGAGAAAGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTGTTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTT                                     ]
[+] EMBL CD113888             [                                                                                                                                                                                                                                                                  AGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAGCTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCATTAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAATATATAG                                                                                      ]




>consensus_9797#1
CTATGTGAGATCTGTATTAGCTGCAATATGTGTCACCTGTGCAATGGTCAGATTATTTGA
TTTTCGCTATTTCACTTATTTGTTACTCCCTGATTGGGATTTATCATCGATATCATAATG
TAATTTTTGAGAAATTAACTAGTTGTTTTCCTGGTATCAACTTTAAACCAAAAGTGAGAA
AGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTG
TTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAG
CTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCAT
TAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAAT
ATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTAC
AAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTAT

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9797#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9797#1      CTATGTGAGATCTGTATTAGCTGCAATATGTGTCACCTGTGCAATGGTCAGATTATTTGA 60
                                                                                  

consensus_9797#0      ------------------------------------------------------------
consensus_9797#1      TTTTCGCTATTTCACTTATTTGTTACTCCCTGATTGGGATTTATCATCGATATCATAATG 120
                                                                                  

consensus_9797#0      -------------------CGAATGAATTAGCGGCGTAAATCGC---TTGAAAGTGAGAA 38
consensus_9797#1      TAATTTTTGAGAAATTAACTAGTTGTTTTCCTGGTATCAACTTTAAACCAAAAGTGAGAA 180
                                             **  **   **  * **          **********

consensus_9797#0      AGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTG 98
consensus_9797#1      AGAAAATGAACGTAGAAGAATTATTCTTAGGTGATCGTAATTTAACTTTGTTACCTATTG 240
                      ************************************************************

consensus_9797#0      TTGGAAGTGTAATGGCCAGTTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTAGGCACTGCATCTGAAG 158
consensus_9797#1      TTGGAAGTGTAATGGCCAGCTTTTTATCAGCTGTCGCTATATTGGGCACTGCATCTGAAG 300
                      ******************* *********************** ****************

consensus_9797#0      CTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCAT 218
consensus_9797#1      CTTATCAATGTGGTATTCAATTCATATTATTGGTTGGGGGTTATTGTATTGCATTTCCAT 360
                      ************************************************************

consensus_9797#0      TAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAAT 278
consensus_9797#1      TAGCTGCATATGTTTACATGCCAGTATTTTATAAACTTAGATTGAACAGTGCTCATGAAT 420
                      ************************************************************

consensus_9797#0      ATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTAC 338
consensus_9797#1      ATTTAGAAATGCGATTTGGAAAACTTGTTCGATGGACAACTTCACTTGTATTCTTATTAC 480
                      ************************************************************

consensus_9797#0      AAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTATGCGCCTGCTTTGGCATTCAGTCAAGTTA 398
consensus_9797#1      AAATGACAGTTTACATTGCTCTTGCATTGTAT---------------------------- 512
                      ********************************                            

consensus_9797#0      GTGGTCTACCCATATGGATATCCATATTATCTACTGGTCTGGTGGCTACATTTTATACAG 458
consensus_9797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9797#0      CTTTTGGTGGTATTCGTGCAGTTGTATGGGTTGATCTTTTTCAACTGATTGTTCTCATCA 518
consensus_9797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9797#0      GTGGATTATGTTTAATCACATTATTAATTACTTTAAAAGTCGGTGGATTCCCACGTCTAT 578
consensus_9797#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9797#0      GGGGTATAGTACTAGACGGCAGCG 602
consensus_9797#1      ------------------------