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Schistosoma mansoni
cluster # 9803 cluster # 9803       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9803#0 length = 905 sequences # 11  

consensusID : consensus_9803#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 905
fasta sequence
                              [TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGCGCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGATTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGCACCAAGAATCTGCGGT-CGATGTGTCCAT-GGACA-TAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGCTTACA]

[-] EMBL BG930584             [TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGCGCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGATTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGCACCAAGAATCTGCGGT CGATGTGTCCAT GGACA TAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGAt                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL CD077750             [                                                                                                                                                                                         gcacgaggGGTCCGATGTGTCCATGGGACATTAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGNGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ]
[+] EMBL CD116001             [                                                                                                                                                                                                                            GTTCAAAAACAATGTGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAA                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD116025             [                                                                                                                                                                                                                            GTTCAAAAACAATGTGACAGTTCTTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAATTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAATCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACCTATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGGTAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTGATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAA                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD134295             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     TGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCANAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAA        ]
[+] EMBL CD195444             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 TGACATGGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATC                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD161349             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                     ATGGTCTATCTGTACCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGG                                                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD120948             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGTGAACATTCCCACTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGCTTACA]
[+] EMBL CD147979             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       GGTCTATCTGTATCAACTTTCACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGATGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCAAGgt                                                                ]
[+] EMBL SMRAP125             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          TCACAACATCTGNTANCTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAANATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTANTTTTCTCAATCCCCAAATTAGACCCTGATCA                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL SMRAP095             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           CACAACATCTGNTAACTATGTTGGGTCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATAACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTANTTTTCTCAANCCCCAAATTAGACCCTGATCA                                                                                                                                                                      ]


>consensus_9803#0 TCAGCCGTTCACGTTCATCCTGTGGTGTTAGCATCAATTGTCGATGCATACGAAAGACGC GCGGAAGGATCAGAGAGAGTTATTGGCACTCTCCTTGGTATGATAACGTTGTTTTCATGA TTACCACAGGGACGTGGGGAAAAAGGATAACCGAAGTTACTCATTGCTACAGTGTTGTGC ACCAAGAATCTGCGGTCGATGTGTCCATGGACATAGAGTTCAAAAACAATATGACAGTTC TTGAGCGCAAAGTGAATCCCTCTCATAACATTGTTGGGTGGTATGCAACGGGGAATGAAA TTCCAGAGACCCTCAAACTTATCCATCAAGATGTTTACATGCAGAAGTCAAAAAATGCAA TCTTTTTAATGGTTGACACAAATATGACTATCGGGGACAAAATGGCCATAAAAGCTTACC TATGTAGAAAGATGGGTATTCCTGGGGGAACACAGGGCTTTATTTTTGTACCGGTGGAGG TAGAAGTCGAGTGTTACGGTGCAGAACGTTGTGCCGTTGAAATGATGGTGTCTTCTATTG ATCCAAGGAGTAAATTAGAGCCTGAACTTGGAGATGACATGGTCTATCTGTATCAACTTT CACAACATCTGCTAACTATGTTGGATCAGGTCATTCGTTATGTTGAAAATGTTATCGATA ACAAATGTCCAGCTGACCCCAAAATTGGGAGGTCCATAGCACAGTTAATTTTCTCAATCC CCAAATTAGACCCTGATCATTTGGAGCAACTGATCAACTCGAGCTATAAAGATTTGCTGA TGATCACTTACCTCACTAATCTTATCCGGACGCATCTAAAGATTTTAAATCTGGCCCAGT GAACATTCCCATTTCAAGTAAATTTTCTCAATGTTGAACAGAGTATCCAGCTGTAAACGC TTACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)