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Schistosoma mansoni
cluster # 9813 cluster # 9813       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9813#0 length = 1008 sequences # 11  

consensusID : consensus_9813#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1008
fasta sequence
                              [ATTTATAAGAAATATTCATGATGTTACTGAGCCAAAAAAAAGAAAAAAAAGAGAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAACATGTTTTCCTTTCATGAACGAATGAAAAAAAAACATGTAACCATTAGGGTATATAAACATGAACGGATATTAGTGTTCCTTTTTGTTTTATTCATTTCAACTACTGATTTTTCTACTGAAATCATAATGATTCAAACAATTAATTGGATCGTTT-GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT-GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA-TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA-GGTTGTTATTATAAT-GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT-TAT--TACTACTT-AAATATAATAATGAGTAGTAACAAAATGTTAATTTTTAATCTTTTGAAGCGAGTTTTTGGATACGCATTGCTGAGAAGTCCCACAATAAGACGAAACGGCCATACAGTACTTCCAGGTTTTCCTTGATGGTCTAGCTTGAATTACCTGACGCTTTCAACTATGAGAATTTCCTTTTGTTTTGTGTTTTTCAAGTACTTAATATATGATATT]

[+] EMBL SMSM25               [ATTTATAAGAAATATTCATGATGTTACTGAGCCAAAAAAAAGAAAAAAAAGAGAAAAAAGAAAAAAAAGAAAAACATGTTTTCCTTTCATGAACGAATGAAAAAAAAACATGTAACCATTAGGGTATATAAACATGAACGGATATTAGTGTTCCTTTTTGTTTTATTCATTTCAACTACTGATTTTTCTACTGAAATCATAATGATTCAAACAATTAATTGGATCGTTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAAT GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT TAT  TACTACTT AAATATAATAATGAGTAGTA                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL CD079050             [                                                                                                                                                                                   TGATTTTTCTACTGAAATCATAATGATTCAAACAATGAATTGGATCGTTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAAT GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT TATTATACTACTT ANATATAATAATGAGT                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL SMAA25585            [                                                                                                                                                                                                                                 GTTTGGGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATTGGGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL SMAA25567            [                                                                                                                                                                                                                                 GTTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATG AAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACC TTGAATCTA TCATATTTATGTAAAAATCTTAATGATAACAATAAC AAAAC AAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAG TTAAATG TTTAA AAAAATTAT AAAAA GGTTG TA TAAAAT GTA CA AAAC TTTCCTG  AATAAAATG ATGAGGTG TTGTAA TTCAA AAA TCAT  CCTTTAAA TAT  AACCTCCT AAATA AATA                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL SMAA28927            [                                                                                                                                                                                                                                  TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGTATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGTATT AGTAGAAGAATAAGGGCCACT CTAATTCAGCAAAT TATTTATG AAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACAGTTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGGTAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAAT AAATTTATCAAAAAGGGTGGTTATTATAAT GTATCTGATACTTTT CTGTGATT AAGTG ATGAGGTGTTTGT ATTTC ATAAATTCATTACTTTTTATATA   TAC ACTTAAAATATA                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL SMAA25572            [                                                                                                                                                                                                                                  TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAATGGTA CCTA AC  TTCC G TAT   AATG ATG AGT A TGTA  TTC ATAA  TCATCA TTTATATacctctaa                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL SMAA28922            [                                                                                                                                                                                                                                  TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGC ACTCCAAATTCAGCAAATATATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTACTCATATTTATGTATAAATCTTAATGAT ACAATTAC AAAACAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL SMAA25594            [                                                                                                                                                                                                                                  TTT GG AACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGC ACTCCAAATTCAGCAAAT AATATATGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL SMAA25628            [                                                                                                                                                                                                                                  TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTG AGAGAAAAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAATACGAATTCTTGAATG AACATCTATTGAATTCAAAG AGAATTAGGCCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL SMAA25543            [                                                                                                                                                                                                                                  TTT GGAAACTATTCATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATT GGTAAATTCTGAAGAGAACAGCAACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAATAATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD073503             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       AACATCTATTGGAATTAAAGGAGAATTAGGCCAAGAACTTCATCAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCAAATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACA TTGAATCTATTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTCTTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAA GGTTGTTATTATAAT GTATCATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACTTTTTAT TATTATACTACTT AAATATAATAATGAGTAGTAACAAAATGTTAATTTTTAATCTTTTGAAGCGAGTTTTTGGATACGCATTGCTGAGAAGTCCCACAATAAGACGAAACGGCCATACAGTACTTCCAGGTTTTCCTTGATGGTCTAGCTTGAATTACCTGACGCTTTCAACTATGAGAATTTCCTTTTGTTTTGTGTTTTTCAAGTACTTAATATATGATATT]


>consensus_9813#0 ATTTATAAGAAATATTCATGATGTTACTGAGCCAAAAAAAAGAAAAAAAAGAGAAAAAAG AAAAAAAAGAAAAACATGTTTTCCTTTCATGAACGAATGAAAAAAAAACATGTAACCATT AGGGTATATAAACATGAACGGATATTAGTGTTCCTTTTTGTTTTATTCATTTCAACTACT GATTTTTCTACTGAAATCATAATGATTCAAACAATTAATTGGATCGTTTGGAAACTATTC ATTATTTATATTAGTTTAGATTTATTCTCTTTAAAATTGGTAAATTCTGAAGAGAACAGC AACAGTATCATTACCGATGAAGATTATGATCATTATAATAGCTCTCTTGATTCATCTAAT AATGTCAAGCATTCCCAAGAAGCATTCCATAGAAACTCGGATCCTGATGGATTTCCGGAA TACGAATTCTTGAATGAAACATCTATTGAAATTAAAGAAGAATTAGGCCAAGAACTTCAT CAATTACAACTTATATTAGATGAATTAAGTAGAAGAATAAGGGCAACTCCAAATTCAGCA AATAAATATATGAAAAATGAATTCTTAATGAGTAGTTGTATTGTGATTACATTGAATCTA TTCATATTTATGTATAAATCTTAATGATAACAATAACAAAAACAAAACTACTTATTATTC TTAAAAGTAGTTTATATGTTTTAATAAAATTTATCAAAAAGGTTGTTATTATAATGTATC ATATACTTTTCCTGTTATTAAAATGAATGAAGTGATTGTAATTTCAATAAATTCATTACT TTTTATTATTACTACTTAAATATAATAATGAGTAGTAACAAAATGTTAATTTTTAATCTT TTGAAGCGAGTTTTTGGATACGCATTGCTGAGAAGTCCCACAATAAGACGAAACGGCCAT ACAGTACTTCCAGGTTTTCCTTGATGGTCTAGCTTGAATTACCTGACGCTTTCAACTATG AGAATTTCCTTTTGTTTTGTGTTTTTCAAGTACTTAATATATGATATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)