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Schistosoma mansoni
cluster # 9821 cluster # 9821       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9821#0 length = 769 sequences # 11  

consensusID : consensus_9821#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 769
fasta sequence
                              [TCTCACATAAAAGAGGATTCTTATCACCGATCAGATTCATTGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCAAGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGTGGGTACCGAGCTTTACCATTCCCACTTACAAAACGCGATGGCCGCATGCATTATGAATGTAATATATGTCGCAAAACTTTTGGACAATTATCTAATTTAAAAGTGCATTTACGTACACATACAGGTGAAAGACCATTCCGTTGTGATACATGTCATAAAGGCTTTACGC]

[+] EMBL AI976541             [TCTCACATAAAAGAGGATTCTTATCACCGATCAGATTCATTGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACAC                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI975968             [TCTCACATAAAAGAGGATTCTTATCACCGATCAGATTCATTGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAAC                                                                                                                                                                                                                                           ]
[+] EMBL AI977755             [                                        TGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCAAGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGTGGGTACCGAGCTTTACCATTCtc                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL AI977761             [                                        TGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI977768             [                                        TGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCAAGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGTGGGTACCGAGCTTTACCATTCCCACTTACAAAACGCCATGGGCGCATGCAATATGAATGTAATATATG                                                                                                     ]
[+] EMBL AI977754             [                                        TGTCTCTAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCAAGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGTGGGTACCGAGCTTTACCATTCCCACTTACAAAACGCGATGGCCGCATGCATTATGAAT                                                                                                               ]
[+] EMBL AI977766             [                                              TAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCAAGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGTGGGTACCGAGCTTTACCATTCCCACTTACANAACGCGATGGCCGCATGCATTATGAATGTAATATATGTCGCAAAACTTTTGGACAATTATCTAATTTAAAAGTGCATTTACGTACACATACAGGTGAAAGACCATTCCGTTGTGATACATGTCATAAAGGCTTTACGC]
[+] EMBL AI067912             [                                              TAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCAAGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGTGGGTACCGAGCTTTACCATTCNCACTTACAAAACGCGATGGACGCATGCATTATGAATGTAATATATGTCGCAAAACTTTTGGACAATTATCTAATTTAAAAGTGCATTTACG                                                        ]
[+] EMBL AI977770             [                                              TAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCAGT                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[+] EMBL AI977758             [                                              TAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTTTCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCTCATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATGACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCTACTTCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI977750             [                                              TAAACACTAATTCTACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAGAACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAAAATG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]


>consensus_9821#0 TCTCACATAAAAGAGGATTCTTATCACCGATCAGATTCATTGTCTCTAAACACTAATTCT ACATTGTCCCCTCAATCATGTTGTATTACAAATGATGTCAGAAACAATAAACGTAATCAG AACGATAACTTGAATGCTGACTCTGAATACAAACAACAACCCTTATACAGAATGTGCGAA AATGGTACAAATCTAAATACAGCACACTTTAGTGATTTAAAAAATATTTCTCAGTCAGTT TCTCAACCTCCTCAATCAAAAACAAGCAACAGTCCAGATAAAAATGAATATGATTATCCT CATAACTTATTTTCATTTCAGATGAATAAAATTACAACTCCTTGTAGTAATCCTTTGATG ACAATATTAACACCATGTACGAAGCAATATAGTGAACACCATTATAATTACACACTACCT ACTTCAAGTCACTCTCTTCCTTCTCAATCCATAACATCAACTGAAAACTCAAAATACTCA GTAAATGTTGTACACAAGTCATCGATTTTATCTAACTATAGATTACATTCAAACTATTCA AGACTACGTGGGAAATCCGTGATTAGTGGTAACATTTCAAGTGATAACTTACAACAACGT GGGTACCGAGCTTTACCATTCCCACTTACAAAACGCGATGGCCGCATGCATTATGAATGT AATATATGTCGCAAAACTTTTGGACAATTATCTAATTTAAAAGTGCATTTACGTACACAT ACAGGTGAAAGACCATTCCGTTGTGATACATGTCATAAAGGCTTTACGC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)