|
These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9822#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1353 fasta sequence
[GTTTCTGCTCACGTTGTTTACAATACATATGTCTGAGTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCTTGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC-TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGAT-GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGTGAAAGATACAGTCGTTTGGGAGAAGATTTGCAATTTATGTGATTTTCAATCCAAACAAAAAACTGCAATTGATACATCAAGAATGCGTGGTATCTTACTCTCTCTTAAACCAAACAATTAATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTACTGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGAAGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACATCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTTTTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGCCAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTATATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGCCTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTTGTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTATGGGGTNTTGNNGTGTTGGACCCTTCATATTTATA-TTTTTTCTTAACAAATTATACTGTGAATAAATAAATGAC]
[+] EMBL CD185482 [GTTTCTGCTCACGTTGTTTACAATACATATGTCTGAGTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCTTGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTACGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGNAAAAAAG ]
[+] EMBL AA999639 [ ATGTCTGANTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCTTGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTCTTTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGATGGCTGAAGA ]
[+] EMBL CD188247 [ TGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGCTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAA ]
[-] EMBL CD188303 [ GACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGCTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAA ]
[-] EMBL CD188290 [ GACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAA ]
[-] EMBL CD202950 [ TTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAATGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTA ]
[+] EMBL CD133876 [ atCAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAA ]
[+] EMBL AI977435 [ AAAGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAATCAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGACATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGTGAAAGAT ]
[+] EMBL AI976821 [ AGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGTGAAAGATACAGTCGTTTGGGAGAAGATTTGCAATTTATGTGATTTTCAATCCAAACAAAAAACTGCAATTGATACATCAAGAATGCGTGGTATCTTACTCTCTCTTAAACCAAACAATTAATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTACTGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGAAGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGG ]
[+] EMBL CD081835 [ CAAACAATTAATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTACTGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGAAGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACATCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTTTTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGCCAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTATATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGCCTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTTGTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTATGGGGTNTTGNNGTGTTGGACCCTTCATATTTATA TTTTTTCTTAACAAATTATACTGTGAATAAATAAATGA ]
[-] EMBL CD075556 [ aTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACATCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTTTTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGCCAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTATATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGCCTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTTGTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTAT GGGT TTG TGTGTTGTA CCTTCATATTTATATTTTTTTCTTAACAATTTATACTGTGAATAAATAAATGAC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||