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Schistosoma mansoni
cluster # 9822 cluster # 9822       Sequences # 11       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9822#0 length = 1353 sequences # 11  

consensusID : consensus_9822#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 1353
fasta sequence
                              [GTTTCTGCTCACGTTGTTTACAATACATATGTCTGAGTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCTTGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC-TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGAT-GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGTGAAAGATACAGTCGTTTGGGAGAAGATTTGCAATTTATGTGATTTTCAATCCAAACAAAAAACTGCAATTGATACATCAAGAATGCGTGGTATCTTACTCTCTCTTAAACCAAACAATTAATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTACTGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGAAGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACATCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTTTTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGCCAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTATATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGCCTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTTGTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTATGGGGTNTTGNNGTGTTGGACCCTTCATATTTATA-TTTTTTCTTAACAAATTATACTGTGAATAAATAAATGAC]

[+] EMBL CD185482             [GTTTCTGCTCACGTTGTTTACAATACATATGTCTGAGTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCTTGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTACGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGNAAAAAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL AA999639             [                            ATGTCTGANTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCTTGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTCTTTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGATGGCTGAAGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD188247             [                                                                                             TGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGCTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD188303             [                                                                                              GACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGCTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD188290             [                                                                                              GACGATTTCAAGCTAAATGAAGATACCTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          ]
[-] EMBL CD202950             [                                                                                                                                                           TTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGATGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAATTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAATGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD133876             [                                                                                                                                                                                                                                                                         atCAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATCATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTC TTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI977435             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               AAAGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAATCAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGACATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGTGAAAGAT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL AI976821             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AGAATTAAAGCCAAAGAT GCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGAGTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACGTGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGTGAAAGATACAGTCGTTTGGGAGAAGATTTGCAATTTATGTGATTTTCAATCCAAACAAAAAACTGCAATTGATACATCAAGAATGCGTGGTATCTTACTCTCTCTTAAACCAAACAATTAATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTACTGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGAAGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD081835             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            CAAACAATTAATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTACTGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGAAGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACATCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTTTTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGCCAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTATATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGCCTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTTGTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTATGGGGTNTTGNNGTGTTGGACCCTTCATATTTATA TTTTTTCTTAACAAATTATACTGTGAATAAATAAATGA ]
[-] EMBL CD075556             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                               aTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTGACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACATCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTTTTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGCCAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTATATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGCCTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTTGTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTTGTGCGTGTGTGTGTGTGTAT GGGT TTG TGTGTTGTA CCTTCATATTTATATTTTTTTCTTAACAATTTATACTGTGAATAAATAAATGAC]


>consensus_9822#0 GTTTCTGCTCACGTTGTTTACAATACATATGTCTGAGTTTGATCCAGTTTCTGACTTTCT TGCTCGTGAACAGGAAGCCCTTGGGGATTTAGGTGACGATTTCAAGCTAAATGAAGATAC CTCAACTTTCTCACTGAATAATTTAGATACCGAGGTTCGCTCAGGTGAACCAGTCTCTGA TGCTAGTTATGTATTTCTTAATGGACAATCGACAATGAATGACTCTCATTTTGGCCACAA TTTGACTGAACCTGATTGTAGAGCTAACAACTCTGTTCATGATTTCGATACAATTGTATC ATCTGACAGTAATGTTGGTGGGACCGAGTCTTGGCGGGAGGAGTTCGAAAAAAGAATTAA AGCCAAAGATGCTGAAGAAGAAAAAAAATGTGCTGAGTTGATGGAAACAGGAAAAAAGGA GTTAAATGATTGGTACAAAAATTATCACCAAAAATTAGAAACAAGATCCCGTGAATTACG TGAGAAAAAACATGATTCAAATGGTCATTGCATGAATGGTGATGGTAGTAAACCATCTGT GAAAGATACAGTCGTTTGGGAGAAGATTTGCAATTTATGTGATTTTCAATCCAAACAAAA AACTGCAATTGATACATCAAGAATGCGTGGTATCTTACTCTCTCTTAAACCAAACAATTA ATATCAATCATTCATGGAATATCAATGGAAATCAATTTGTGTGCCTATACCTTGTTTTAC TGTCTTCTTTTATCTTTCAACATAATATAAACAAGTATGATTTCTATATTATAAATAGGA AGAAAGTGCCTTGTTAAATGTTTGGAATATGTATTTTTCTTTCACTCAAATTAATTATTG ACCATTGAATAACTCCATTAATTTCAATATTGGTTCTGTTCATAAAAACATGACAGTACA TCTTTTTTTGGTTTTTCTCTCTCTTTTGATAATAAAAAAAAAATGGTTTTTGTCTATTTT TTAAAGTGATAATGATTCTCTATTAGGATTATACATTACGTCATCAATGTTTGGTTGTGC CAGTTATTTTTTTTCTTTTGAGGAAAAAATATAAATGATTTTTCGGGTTTTTACATCGTA TATTTTTTATAAATGATGAACAGTTCTACCATCTATCTGTTCATTTGTTCTTTTTTGTGC CTTAACTTGATATATATTCAAAACCATAGGTGTTTGGAATTACTGTTTGTGTCAGTGTTT GTTACTTTACTCTGTTGGTATGTTTGTTTTAAAAAAAAACGCGAGTGATTTTGTTTGTTT GTGCGTGTGTGTGTGTGTATGGGGTNTTGNNGTGTTGGACCCTTCATATTTATATTTTTT CTTAACAAATTATACTGTGAATAAATAAATGAC



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)