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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9833#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 1004 fasta sequence
[CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT-CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT-GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT-AGA-ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGTAACAGACTCACCAAAATAAATGGATTAGCGAGTCTTGTTAATCTGGAGCAACTATATCTGAGCGAGAATGGGATAACAGAAATTGAAGGCCTTGAAACATTATCAAAGTTACAAATTTTAGACTTGGCATACAACTTCATATCGCAGATTCAAAACATGTCGAATTTGGTAAATCTAGAAGAATTTTGGGGTGCATGACATAAGATATCTGACTGGGAGCAGCTAGGAAAGTTAAGTGTATTAAAAAAGCTAC]
[-] EMBL CD124119 [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAA ]
[-] EMBL CD124122 [CAAGGTCGCCGAACAGAAAGCGGTAATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAA ]
[+] EMBL CD094497 [ AATTTTATACCGCTGCACCAATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGGCTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCANAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTG ]
[+] EMBL AI740260 [ ATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCAAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAACCGTATCG AAATTTGG ]
[+] EMBL AI764957 [ ATGTTATGTCCTTTTAACGGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTT CACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTAGTACGCACTTGGTGA TTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATC AATGTATCAGTAGACTGGAACGGTTCCCAATTGTTCGCCTATTATGTCTTCG AAT ACTTATTGAAGAAGTTGG AAACTTCGAGCCTATCTCTC AACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATACCCAA CTCCGGGATTG GAATCTGAGAGATG TCAT AAGCTG CCATACTTGGATTGAGCTT ]
[+] EMBL CD063557 [ ctGACTGTTATTGATCAGTTGTTATCTTACACATTGAATACTTAATGTTGCGAGTCATTTACAGGTCATAGAAATTCATTATAACGCACTTGGTGATTTACTGAATCATAGACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTAGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTG ]
[+] EMBL CD116475 [ ATTTTCTGATGGAT GACCAGAGTAAACCTCAGCTTCAAGACGGGGTCGCGGATCAGCAACAGTCAGATGCCTTCGAAATTGATGAGGTTGATGTACCTAACGCAGACGATGAAGAGATATACCTTGAACATTGCCGAATCAAATGTATCAGTAGACTGGACCGGTTCCCAAATGTTCGCCTATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGCAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCANACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTNTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTGGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGT ]
[+] EMBL CD195677 [ TATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTTGGTC AACAAAATAAGAAAG TAGAAAAT ]
[+] EMBL CD137348 [ ATTATGTCTTCGAAATAACTTATTGAAGAAGTTGGAAAACTTCGAGCCTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAAGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCAATTGAAAACTTTGATAACTTGACTAATCTAACAATTCTTAGCATTCAGGGTAACAGACTCACCAAAATAAATGGATTAGCGAGTCTTGTTAATCTGGAGCAACTATATCTGAGCGAGAATGGGATAACAGAAATTGAAGGCCTTGAAACATTATCAAAGTTACAAATTTTAGACTTGGCATACAACTTCATATCGCAGATTCAAAACATGTCGAATTTGGTAAATCTAGAAGAATTTTGGGGTGCATGACATAAGATATCTGACTGGGAGCAGCTAGGAAAGTTAAGTGTATTAAAAAAGCTAC]
[+] EMBL CD195875 [ CTATCTCTCAAACCCTTGAAGATCTGGACGTTTATGATAACCAAATCACCAGGATTGAAAATCT AGA ATGTCTCATAAAGCTGACTAATCTTGATTTGAGCTTTAACCGGATAAAACGTATCGAAAATTTGGAAAATCTAAGTAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATTTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGCTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACT ]
[-] EMBL CD195888 [ tnTGGAAAATCTAAGCAATCTCCGGAAACTCTATTTCGTAAACAATCATATCTCAAAAATAGAGAACCTGAGCAATNTGAAAGACCTAGAAATGTTGGAACTTGGTTCAAACAAAATAAGAAAGTTAGAAAATTTGGATGAATTGGAAAAACTGACTCAACTTTATTGTGGTAAAAACAAAATACCAGCA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||