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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9859#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 11 consensus length = 907 fasta sequence
[CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATATAATTCGCATTGTTACGCTTATCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATG-AAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTC]
[+] EMBL CD115846 [CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATATAATTCGCATTGTTACGCTTATCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATG AAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTGACCTATCGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTCGATTGACAGAGAATGCAC AAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGATTAACTGATATTTGAGATATATGCCTCCATGACTGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATATTGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGCGTATAGCTGGAGTGTTTGAccatg ]
[+] EMBL CD194886 [ gTAACAGGAAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGT ]
[-] EMBL CD164643 [ GTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTA ]
[-] EMBL CD164747 [ GTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTA ]
[-] EMBL CD164693 [ GTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGATGGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGCAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGGGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTAAGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTA ]
[+] EMBL CD153924 [ CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTAT ]
[+] EMBL CD154129 [ CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACA ]
[+] EMBL CD154069 [ CAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACA ]
[+] EMBL CD085587 [ TGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGACGATTGATTTTGTAGTTCAGGTATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACAT ]
[+] EMBL CD116837 [ ATTTGACTTACCTATTGGATTGGTGGATGGGGTGTAGCTCGTCACTTCTATTAAAATGAGGATAATAAACGAGATTGTTGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTATAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGCATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCGATAATGGATGACATGTAAGAATGTGGTTATGGACGACATGATGAAAGTAGATGTTGCATTGCAGAATGTTACGAATGCATTGTGTGGAGTATTAGTGTGAGCCTATTGTGAGTAGACAGTGAATGTATGATGATTGATTTTGTAGTTC]
[+] EMBL CD152131 [ AGGAT ATAAACGAGATTGTCGATTGACAGTGAATGCACAAAATCGATATTGATAAATGGGAGATGTGAGAATAACTGAGATTAGAGAAATATGCCTCAATGAATGTGCACATTTGCATGGAGATATTCAGCATAATGGAGAATGTATTTTGTCAAGTATTCCGAATGAACATCTACTGTGTACAGTTGGAGTGTATGAGAGTGTGGTATAGAATTCGCATTGTTACGCTTAGCTATTGGATTAGTGAAGCTGTCGTCTGTGACATGTGTTAACATGAAGGAAATCAGAGGAGTATTGAATGCGTGTTGATTGTTTTGACGTTGGAGTTAATCAAACCG ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||