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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9860#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 2428 fasta sequence
[ATTAAACATGCCCACTATGATGATCATAGCTCACCATTCGTTTATTAATGGGAGTGGATAGTTATGGGAAATTCTAATTCGTCTAATAATGATCAAAACAGTTGGATCACGGTTACTCCTAATGACGCTTCTGCGCCTATGTTTGAACCATCACTTCGGTCTGTAGTAG-AAAGACGAC-CTATTTTCCCCTCTAAAAATTCGCTCAATAATGGTCAAGCATCCAATTCTATGCTTCCAGCAGCGATAGCACCAGATTCTTCACAAAGCTTTGATCAGATACGCTACCAACCCTGTAATGCTAATTATGTTTCCGATGTAGTTCAGCAGATCAAGGGAGCGAAACGGACAAATGATTTCGTAGGTGTTCCAGTGACTATTGGAGATAAATCGTCTATTGGAAATTCATCATGTCTACCTAACACTCATCAGTCAACGAACTTCTCACCAACTCAACAGCCTGCTAACTTCCTAAACAATTCAGTTGCACATATGCGAAATAATCCATCACATAATTCACCCCAGATACCTACAGAAGGGCAGTTTGTTGCTTTACATGATTATGTTAAACGTGTAGATGATGATTTGAATATGACCAAAGGACAAATATTCAATATACTCGATAATTCACACTGTGATTGGTGGTATGCGGAATGTGTATCTACTGGTAATCGAGGATATGTACCCAAAAATCATTTAGCAGCTGTTACCAGTTTGGAATCCAATGAATGGTATTTTGGAGAATTGAAACGTATTGAAGCTGAACATTATCTTCAACTCCCGGGAAATGATCATGGCTCTTTTTTGGTTCGAATCAGTGAATCTCAATCCAGTGAATATTCTTTATCAGTACGAGAAGAGAATACTGTCAAGCATTATCGTATTCGATCAAGATATTCACGAACTGATCCTACATTAAAACGTTTCTACATTTCAAGACAATTGCCTTTTGTGAATATTCAACAGCTAGTCAATCATTATTTAGAGAATCAATCTGGTTTATGTTGTCGATTGGGAAAACCGTGTATTCGACCAACTCATCCAGAACCTGTGGGTCTTTCACACAAACTCATTGATAAATGGGAAATTCCAAAATCTTCAATTATTTTGAAAGAAAAAATTGGACAAGGTCAATTCGGCGAAGTATTTAAAGCTGTATGGAATAAAACAACCATTGTTGCTGTGAAAACGCTTAAGCCAAGTTCTTGTGATGCTGCTGATTTTCTTCGTGAAGCTCAAACAATGAAACGTTTACATCATCCCAATCTGATACAATTGTACGCTGTTTGTACACAGACAGAACCTTTCTATATTGTTACAGAATATATGTCAAAAGGTTCTTTATTAAACTACTTACAATCTCCCGAAGGTAATGCACTAAATATGCAATGTTTAATTATGATGGCTGCTAAAATAGCTCCTGGTATGGCATATCTTGAATCCAGGCGTCACATCCATCGAGATTTAGCTGCTAGAAATGTTCTAGTTGGTGAACAACATGCTGTGAAAATAGCAGATTTCGGTCTTGCTCGTATGATTCATAACAGAGAATATGTAGCACATGCAGGAGCTAGATTCCCTATAAAGTGGACATCGCCTGAAGCAGCTAATTATTCACGTTTTACCATAAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGTATTCTGTTGACTGAAATAGTCACATATGGTCGTTCCCCTTACCCAGGAATGCATAATGCAGAAGTGCTCAGACAAGTGGATGCTGGATACCGCATGTCGAAACCACCCGGTTGCCCACCAGAACTATACGATCTTATGCTAGAATGTTGGGCAGCTGATGAAAATAAACGACCATCTTTTGCAACAATTCACTTTCGTTTGGAACAGTTCTGTGAAGATGAGCAACCAGCTTACAG-AAATGCAAATACCAACATCCATAGTCATCCTAATGGAAGTTCAATGGTAGTTTTGCAGAATAAACAAAATCCCTCCTCTGGAGCCTACCACAACCACATCGAGATTTCCGTATCACCATAACTTTTAGATTCTTGGTATAGTGACAAGTCAATTTCTGATTTTAATGATAATGACCGCGGTGATTCGGCACCT-ACAACTTTGTTTCCATCAAATCATGTAAATTCAATTCCATCTACCTGTAAATATGAATACAAAATATTGAT-TTTCAAGTATAGGGACTATAATGTATGACAGACTAGTCATGAAAATCGGAACCAACGTAACAGCTTCCGCTCAAACCAATATGTACTTCTATTTGTTGATAGTTCTTTCTAATTATTGTAGAAATTATTTTGTACCACTTTATCTTTATCCTTCCCTGATCTAACGAATTGTCAACTTTTTCTTTGGCCATTTGCTTGTTCTCTATGCTAAAGCCTAGGTTTTTTTACTCAGTCTCTTCTATGAATAAATCAATATTACGATCCAAAAAAAAAAAAAA]
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[+] EMBL CD061016 [ GGTCTGTAGTAGTAAAGACGACACTATTTTCCCCTCTAAAAATTCGCTCAATAATGGTCAAGCATGCAATTCTATGCTTCCAGCAGCGATAGCACCAGATTCTTCACAAAGCTTTGATCAGATACGCTACCAACCCTGTAATGCTAATTATGTTTCCGATGTAGTTCAGCAGATCAAGGGAGCGAAACGGACAAATGATTTCGTATGTGTTGCAGCGACTATTGGAGATAAATCGTCTATCGGAAATTCATCATGTCTACCTAACACTCATTAGTCAACGAACTTCTCACC ]
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[+] EMBL CD182583 [ CTATAAAGTGGACATCGCCTGAAGCAGCTAATTATTCACGTTTTACCATAAAGTCTGACGTGTGGTCTTTTGGTATTCTGTTGACTGAAATAGTCACATATGGTCGTTCCCCTTACCCAGGAATGCATAATGCAGAAGTGCTCAGACAAGTGGATGCTGGATACCGCATGTCGAAA ]
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[-] EMBL CD193293 [ CCACCAGAACTATACGATCTTATGCTAGAATGTTGGGCAGCTGATGAAAATAAACGACCATCTTTTGCAACAATTCACTTTCGTTTGGAACAGTTCTGTGAAGATGAGCAACCAGCTTACAG AGATGCAAATACCAACATCCATAGTCATCCTAATGGAAGTTCAATGGTAGTTTTGCAGAATAA ]
[-] EMBL CD076913 [ GGCACGT ACAACTTTGTTTCCATCAAATCATGTAAATTCAATTCCATCTACCTGTAAATATGAATACAAAATATT ATCTTTCAAGTATAGGGACTATAATGTATGACAGACTAGTCATGAAAATCGGAACCAACGTAACAGCTTCCGCTCAAACCAATATGTACTTCTATTTGTTGATAGTTCTTTCTAATTATTGTAGAAATTATTTTGTACCACTTTATCTTTATCCTTCCCTGATCTAACGAATTGTCAACTTTTTCTTTGGCCATTTGATTGTTCTTTATGCTAAAGCCCAGGTTTTTTTACTCAGTCTGTTATATAAATAAATC ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||