Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9866 cluster # 9866       Sequences # 12       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9866#0 length = 497 sequences # 12  
consensusID : consensus_9866#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 497
fasta sequence 
                              [ATCCACTAACTAGGACTAAATGACGGTTACAAATCAATATGAGGAATTAGAATTGTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT-TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTTGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTGTAAATGTATTTTGTAATTGTTGTTG]

[+] EMBL CD128317             [ATCCACTAACTAGGACTAAATGACGGTTACAAATCAATATGAGGAATTAGAATTGTGATTAATTGGTGGTGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTTGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTGTAAAT                    ]
[+] EMBL CD070049             [                                                      GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAG AAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCT                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD070084             [                                                      GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAGATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGAT                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD070142             [                                                      GTGATTAGTTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGATTTCA                                                                                              ]
[+] EMBL CD070123             [                                                      GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAACCAGATT TAGAGTTTTCATCACGGATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTT AAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTC                                                                                               ]
[+] EMBL CD070115             [                                                      GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTT AAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATG                                                                                                    ]
[+] EMBL CD070114             [                                                      GTGATCAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAGTGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAA TATTCATTTACTTCTTCTT                                                                                                                        ]
[+] EMBL CD070150             [                                                      GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTCCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAAATATTCATTTACTT                                                                                                                              ]
[+] EMBL CD070062             [                                                      GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAG AAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTANAAA TATTCATTac                                                                                                                                 ]
[-] EMBL CD143348             [                                                       TGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAAAGTTCTCATCACGAATGGACATAAGCTAAAATGCCAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTATGAATGGTAG AAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCCTTTTTT AAAATTATTCATTTACTTCTTCTTACGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTCGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATGTATTATATCCATGTGTAAATGTATTTTGTAATTGTTGTTG]
[+] EMBL CD065633             [                                                                             TTTAGGAATCAGATTGTAGAGTTTGCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCGAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTGCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTCTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTTGGTATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTG                         ]
[-] EMBL CD167096             [                                                                                        GATT TAGAGTTTTCTTCACGGATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAACAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATG                                                                                           ]




>consensus_9866#0
ATCCACTAACTAGGACTAAATGACGGTTACAAATCAATATGAGGAATTAGAATTGTGATT
AATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATTTAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAG
CTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCA
AGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTT
CTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGA
TGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTA
TTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCA
CGTTGTTGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTGTAAATGTA
TTTTGTAATTGTTGTTG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)