These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9866#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 497 fasta sequence [ATCCACTAACTAGGACTAAATGACGGTTACAAATCAATATGAGGAATTAGAATTGTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT-TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTTGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTGTAAATGTATTTTGTAATTGTTGTTG] [+] EMBL CD128317 [ATCCACTAACTAGGACTAAATGACGGTTACAAATCAATATGAGGAATTAGAATTGTGATTAATTGGTGGTGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTTGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTGTAAAT ] [+] EMBL CD070049 [ GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAG AAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCT ] [+] EMBL CD070084 [ GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAGATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGAT ] [+] EMBL CD070142 [ GTGATTAGTTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGATTTCA ] [+] EMBL CD070123 [ GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAACCAGATT TAGAGTTTTCATCACGGATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTT AAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTC ] [+] EMBL CD070115 [ GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTT AAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATG ] [+] EMBL CD070114 [ GTGATCAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAGTGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAA TATTCATTTACTTCTTCTT ] [+] EMBL CD070150 [ GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTCCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAAAAAATATTCATTTACTT ] [+] EMBL CD070062 [ GTGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAGAGTTTTCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAG AAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTANAAA TATTCATTac ] [-] EMBL CD143348 [ TGATTAATTGGTGATGTTTAGGTTTAGGAATCAGATT TAAAGTTCTCATCACGAATGGACATAAGCTAAAATGCCAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTATGAATGGTAG AAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCCTTTTTT AAAATTATTCATTTACTTCTTCTTACGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTCGATATGATTGTCTTGATTCACGATTATATGTATTATATCCATGTGTAAATGTATTTTGTAATTGTTGTTG] [+] EMBL CD065633 [ TTTAGGAATCAGATTGTAGAGTTTGCATCACGAATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCGAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTGCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTCTTTTAAAAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATGCTACACGAGCTGCACGTTGTTGGTATGATTGTCTTGATTCACGATTATATATATCATATCCCTGTG ] [-] EMBL CD167096 [ GATT TAGAGTTTTCTTCACGGATAGACATAAGCTAAAATGCTAAAAATTCTATTTGGCCAAATAGATGAATGAATTTTGCGCCAAAAATTCAAGACCTATTATCCTAAATCTGATTAGTTTGTTCATGAATTATAGTCTCACCTTCATATTTCTTTCTTTTCTGTTTCTTAATTCAACAAAATTTATATACAATTTTCTGCTAATTTAATGATGTTTCTGAATGGTAGAAAAAAAAGCGATAGGTGATTTGTTTCCCTTTTTTTAACAATTATTCATTTACTTCTTCTTGCGATATAAATTTGTCAATGGTTTCAATG ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||