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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9871#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 637 fasta sequence
[CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT-GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAACTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTTGGACTCGGAT]
[+] EMBL AI067314 [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTT ]
[+] EMBL AI067197 [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAACTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTT ]
[+] EMBL AI067504 [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCATTGCGGAA CTAAGTGTCCTCTGATAACGGAAAAA CTCTCGA ]
[+] EMBL AI068222 [ TATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAACTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTTGGACTCGGAT]
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[+] EMBL AI067447 [ TATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAAGAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCAGCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCAGTAGAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTT ]
[+] EMBL AI976959 [ TCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAATAGCCG CCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTTTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAAATGGAGTGGCTTATATTAACAA ]
[+] EMBL CD068184 [ tTCTTTTGTGTCAACACATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTT ]
[+] EMBL AI067977 [ GGGATTCTATTGAGGTCAAGGGCGTAAAATTGAGGAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACGAGAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGCTACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTAGACTGCAATACCAGCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTAT ]
[+] EMBL AI067101 [ ACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAG ]
[+] EMBL AI067032 [ ACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCAGCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||