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Schistosoma mansoni
cluster # 9871 cluster # 9871       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9871#0 length = 637 sequences # 12  

consensusID : consensus_9871#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 637
fasta sequence
                              [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT-GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAACTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTTGGACTCGGAT]

[+] EMBL AI067314             [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTT                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI067197             [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAACTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTT          ]
[+] EMBL AI067504             [CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCATTGCGGAA CTAAGTGTCCTCTGATAACGGAAAAA CTCTCGA                                                                                                                                                                                                   ]
[+] EMBL AI068222             [      TATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAACTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTTGGACTCGGAT]
[+] EMBL AI068053             [      TATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTC                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL AI067802             [      TATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCC                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AI067447             [      TATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAAGAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCAGCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCAGTAGAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTT                                                                                                                                                                                                                          ]
[+] EMBL AI976959             [                 TCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAATAGCCG CCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTTTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAAATGGAGTGGCTTATATTAACAA                                                                                                                                           ]
[+] EMBL CD068184             [                                    tTCTTTTGTGTCAACACATGAAGCAGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAAGGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL AI067977             [                                                                                                     GGGATTCTATTGAGGTCAAGGGCGTAAAATTGAGGAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACGAGAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTCTGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGCTACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGGAGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTAGACTGCAATACCAGCAAACTGATGATGGTCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTAT                                                       ]
[+] EMBL AI067101             [                                                                                                                                     ACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGAAGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAAT GCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTTGAACCAG                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[+] EMBL AI067032             [                                                                                                                                     ACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATTTTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCAGCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGGTGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_9871#0 CGAAGCTATGTTGGCGTTCGGCCTTCTCATTTTCATCTCTTTTGTGTCAACAAATGAAGC AGTAAGTGTTCCTGGAGTAACGCCGAATGAGTTTAATAAGGGGGATTCTATTGAGGTCAA GGCCGTAAAATTGACCAGCTACTTAACTCAACTGCCTTTTGAGTATTATAAACTCCCATT TTGTCGTCCAAAGCAGTTAGTTGAGTACCCACCGGAGAATATAGGTGAGATACTTCGCGG TGATCGTGTCGTCAATACTCCATACTTGATAAAAATGGCTGAAAATACAGCTTGTTCCGA AGTCTGTCCACCTTTCACTATAAGTGGTGCTAATGCCGTCCTCCTGAGGCATTTTATTTT GAACCAGTATTCTGTTCATCTGTCTATCGATAACCTTCCTTGCGGAACCAAAGTGTCTTC TGATAACGGAAAAACCTCTCGATATGAGCACGGATACAGACTTGGGTCAGTTGTAGATGG AGTGGCTTATATTAACAACCATCTAAAGTTTATACTGCAATACCACCAAACTGATGATGG TCACTACCGTTTTGTCGGCTTTGAAATCGAACCTATGAGTATCTCTGAGAAAAACCTGAA CTTGGAGAATGGGGTGTGCAAAAATTTGGACTCGGAT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)