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Schistosoma mansoni
cluster # 9877 cluster # 9877       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9877#0 length = 667 sequences # 12  

consensusID : consensus_9877#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 667
fasta sequence
                              [CCAGCCAANATTTGGCACGAGGCCATTGACTAATTGTTATCCAGTATAAATATATATATCACTTAAAGCCTTCATATCTCTTTCAATATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT-ATTGTTGTTGATTAGG-TTTTTTTTCTTTTACTGTAC-AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA-TAAAAGGAGAT--AATCTCTCAAAG-ACTTTGAAAGGGCTTATTCAGTNNNCTGACTGTAAAGAATAACCCAATATCTATTTATATAGATNNGTATATGTATCAATTTTTTAAACAANTATTAACCATTGAAAATT]

[+] EMBL CD079658             [CCAGCCAANATTTGGCACGAGGCCATTGACTAATTGTTATCCAGTATAAATATATATATCACTTAAAGCCTTCATATCTCTTTCAATATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTATTAAAAGGAGATNNAATCTCTCAAAGAACTTTGAAAGGGCTTATTCAGTNNNCTGACTGTAAAGAATAACCCAATATCTATTTATATAGATNNGTATATGTATCAATTTTTTAAACAANTATTAACCATTGAAAATT]
[-] EMBL CD073918             [                       gATTGACTAATTGTTATCCAGTATAAATATATATATCACTTAAAGCCTTCATATCTCTTTCAATATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCTCTCAAAG ACTTTGAAA GGC TATTCAGT   CTGACTGTAAAG ATAA  CAATATCTA  TATATAGAT  GTATATGTATC ATTTTTTAAACAA TATTAACCATTGAAAt  ]
[-] EMBL CD136832             [                                                                                      TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCTCTCAAAG ACTATGAAGGG                                                                                                   ]
[-] EMBL CD137030             [                                                                                      TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCCTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD136970             [                                                                                      TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD136828             [                                                                                      TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD136849             [                                                                                      TATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG  TTTTATTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD136973             [                                                                                       ATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTT ATTGTTGTTGATTAGG TTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD136661             [                                                                                      atTAGATTTCCACGCTTCTGA ACTGTTAATTGTTGTTGAATAGG TTTTTTTTCTTTTACTG ACAAGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCCTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD136657             [                                                                                         AGATTTCCATGCTTCTGATCCTGTT ATTGTTGTTGATTAGGTTTTTTTTTCTTTTACTGTAC AGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD136749             [                                                                                                                                                                                  AATTTCAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGTGTCTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTAAATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAATCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAATACCACAAAATATTTATCCGTAAATTC TTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATC                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD136733             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      TTCTTAACCCCTA  TTC TCTTATTGGGCCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTA TAAAAGGAGAT  AATCT                                                                                                                      ]


>consensus_9877#0 CCAGCCAANATTTGGCACGAGGCCATTGACTAATTGTTATCCAGTATAAATATATATATC ACTTAAAGCCTTCATATCTCTTTCAATATAGATTTCCATGCTTCTGATACTGTTATTGTT GTTGATTAGGTTTTTTTTCTTTTACTGTACAGCTGCTTTCTTCATAAGCATATTGAATTT CAGTGCCGTTTACCTAGATTGGCTTATTATTATCCGGGAAAAAACATGTATCTCCTTTGT GTTTGTGTATGTGTGCGTGCATGCAAATTTATGCATTTTGTTTTTCTTCCCTTATGTCTA AATCTTGCTTGTTATCATATGAATGTTCATTAAAAGAAATCTTCAATCACTTTCATCTAA TCTATTCCTCATTTACATCCAGACATTACAGACACATACACAAGCACATGATCAAAGAAT ACCACAAAATATTTATCCGTAAATTCTTTTTTTTTTAACTCCTATTTTCTTCTTATTGGG CCTCAAAAAGACAATTGTTCTTGTTTTTTCCCCATTTTAATTGCTTAATGTGTATAAAAG GAGATAATCTCTCAAAGACTTTGAAAGGGCTTATTCAGTNNNCTGACTGTAAAGAATAAC CCAATATCTATTTATATAGATNNGTATATGTATCAATTTTTTAAACAANTATTAACCATT GAAAATT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)