cluster # 9878

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Schistosoma mansoni
cluster # 9878 cluster # 9878 Sequences # 12 consensus # 2

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consensus_9878#0 length = 696 sequences # 11

consensus_9878#1 length = 412 sequences # 1

consensusID : consensus_9878#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 11
consensus length = 696
fasta sequence

                              [CTCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAACATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTTTTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT-CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA]

[+] EMBL CD081103             [CTCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAACATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTTTTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGNGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTNTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA]
[+] EMBL CD081080             [cccgAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGGCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAACATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTTTTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGNGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACC ]
[-] EMBL CD074902             [                           GCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAACATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTTTTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA]
[-] EMBL CD074926             [                           GCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAACATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTTTTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA]
[+] EMBL SMRAP0205            [                                                                                                        GTCTTTTGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD110904             [                                                                                                              TGCTTTCGGTAGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTTTTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTACGTCATAAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                               ]
[-] EMBL CD073919             [                                                                                                                                                                                           tatttttCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA]
[+] EMBL CD079659             [                                                                                                                                                                                          ttatttttCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCTAGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATATATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACC ]
[-] EMBL CD111294             [                                                                                                                                                                                                                         CACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATTCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGGCATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTGTCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGG                                                                                                            ]
[-] EMBL BG931804             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                CAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAc                                                                                                       ]
[-] EMBL CD135871             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         TGGAAAAATAATTAGCTTCTGT CGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAA                                                                                                                                                                                                ]




>consensus_9878#0
CTCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAAC
ATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGT
AGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTT
TTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGAC
ACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATAT
ACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTA
TTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTCGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACG
GCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGG
GAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAG
TTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCT
AGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATA
TATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA

consensusID : consensus_9878#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 1
consensus length = 412
fasta sequence

                              [TTGGCTGACGGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATTCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTCGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGTTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGG]

[-] EMBL CD111023             [TTGGCTGACGGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATTCCAAGCCCAATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTCGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACGGCGATGATTGCCTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGTTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGG]




>consensus_9878#1
TTGGCTGACGGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGAC
TAGACACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATTCCAAGCCC
AATATACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTA
CGGTATTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTCGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGA
TAACGGCGATGATTGCCTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATC
GAGGGAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGTTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAA
GCAGTTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9878#0      CTCCAGGCCAANAATTTGGCACGAGGGGCTGACGGGTTAGAATGTCTGAATTGTCCGAAC 60
consensus_9878#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9878#0      ATGTTTAAAATTGTAATATGTAGCTTGTTTTATTAGTGGATGTTGTCTTTTGCTTTCGGT 120
consensus_9878#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9878#0      AGTGAATGTAAGTATATTATGTGGGTTTCTGTGTCGTAGTCTCACGTTTTATATCCTTTT 180
consensus_9878#1      -------------------------------------------------------TTGGC 5
                                                                              *   

consensus_9878#0      TTCCAGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGAC 240
consensus_9878#1      TGACGGCCTTCACGCCAATCTGTAGGCTCGCCTAGTACACACAGTACCTTCTGACTAGAC 65
                      *  * *******************************************************

consensus_9878#0      ACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATCCCAAGCCCAATAT 300
consensus_9878#1      ACAAACCGCTACAATTGTATGGTATGGAACCTCCACATATGCTTATTCCAAGCCCAATAT 125
                      ********************************************** *************

consensus_9878#0      ACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTA 360
consensus_9878#1      ACCATAAAAGAAACAGGACCAAGTCCCAGTCAGAAGGTGCCTTTAAAGGAGAGTACGGTA 185
                      ************************************************************

consensus_9878#0      TTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTCGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACG 420
consensus_9878#1      TTGGAAAAATAATTAGCTTCTGTCGTGATAAGGGACATGGTTTTATCAAACCTGATAACG 245
                      ************************************************************

consensus_9878#0      GCGATGATTGCCTTTTTGTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGG 480
consensus_9878#1      GCGATGATTGCCTTTT-GTACATGTTTTTGATATCGATGGTGAATACGTGCCTATCGAGG 304
                      **************** *******************************************

consensus_9878#0      GAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGCTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAG 540
consensus_9878#1      GAGACGTCGTGGAATATCGTAAAATGTTTATCCCTCCCAAAAATGAAAAATACCAAGCAG 364
                      ************************** *********************************

consensus_9878#0      TTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGGATGAGCCAGCCT 600
consensus_9878#1      TTCATGTAAGAATAGTCAACCTTAATTCAGAAAAGCATAAGACCTGGG------------ 412
                      ************************************************            

consensus_9878#0      AGTTCTCAAAATTCAAACAACTGACGTCGTGGTTAATATTTTCAAAAAACCGGTCATATA 660
consensus_9878#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  

consensus_9878#0      TATATACTATTCATATTGTAAATAGTTCAACTACCA 696
consensus_9878#1      ------------------------------------