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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9880#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 1269 fasta sequence
[TATGCGATTGAAACCACATGAATTACGTTGTCGTTTGTTCATTTCATTTACTGGTGAAGAAGGTTTAGACTATGGCGGGTTATCACGAGAGTGGTTTTTCAAACTATCTACAGAATTATTAAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAATCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTATCGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAAACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTTTGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT-ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC-ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA-GTTT-AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC-GTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATC-TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG-AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA-GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACAATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAACCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCA-TATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGTTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAGC]
[+] EMBL CD134565 [TATGCGATTGAAACCACATGAATTACGTTGTCGTTTGTTCATTTCATTTACTGGTGAAGAAGGTTTAGACTATGGCGGGTTATCACGAGAGTGGTTTTTCAAACTATCTACAGAATTATTAAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAATCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTATCGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAAACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTTTGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGAACAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTTCATGGTTACA ]
[-] EMBL CD166493 [ ccctacacAATCCAATGTATTGCTTATTTGAATACGCCAGTGGTAATAATTATGCATTACAAATTAATCCTGCATCATCGGTTAATCCGGAACATTTGGAATATTTTCGATTTGTTGGACGATTTATCGCTTTAGCATTATATCATTCTAGATTTATTGATAATGGTTTCACTTTACCATTTTATAAACGTATGTTAAATAAAAATATCACTTTAGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACTATTCATTGTAATTTATTCAAGAG ATAATATCGATG ]
[+] EMBL AI977236 [ AGCTGATATTGAAACAGTCGATGTGGAATATTACAATTCATTGAAATTTATTCAAGAGAATAATATCGATGAATGCGCATTAGATGTTTACTTTGCTATGGATTATGAAGTGTTGGGTGAACTACGAACGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA GTTT AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC GTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAag ]
[-] EMBL CD194091 [ ATGGATTATGAAGTGTTGGGTGANCTACGACNGCATGAATTGAAACCAGGCGGTAAAGATATTCTAGTGACTGATGCAAATAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTCCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA GTTT AACT ]
[+] EMBL CD158101 [ gaAAAGCTGAGTATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAAGGTTT AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTCGGTGTCCCTGTTGGTGGATTT AAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTGAAATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAAGGTCATACATGTTTTAATCGATTAGATC ]
[+] EMBL CD158235 [ TATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCATTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGAAATTTGTTCGAA GTTTAAACTC ACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC GTGTCCCTGTTGGTGGATTT AAAATCTTTATGGGT AT ATGGTCCACACCNATTTTGTATTG ATATATTGGT AAGA TCATGGCTACCTCG A GTCATA ATGTTTT ATCGA TAGA ]
[+] EMBL CD158096 [ TATATTGATCTAATGGTTAATTGGAGATTTTCTCGTGGAGTAGAAGATCAGACAAATGCACTCCTCACTGGTTTCGAAGATGTTTTCCCTCTTCAATGGTTACAATATTTCGATGAACGTGAATTAGAAGTTTTATTATGTGGTATGCAACAGATCGATGTAGATGATTGGCAATTGCATACAACTT ATAAAAAATACGATGCTCGTTCTCC ACAAGTTTTATGGTTTTGGA ]
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[+] EMBL CD152645 [ T AACTCAACAAAGACGTATTCGATTACTTCAATTTGTCACTGGCACATGTC GTGTCCCTGTTGGTGGATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACAATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAACCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCA TATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGGTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAG ]
[-] EMBL CD152921 [ GGTGCATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCGTATGAACAATTGGCTGAGAAATTATCTTATGCAATTGATGAAACAGAAGGTTTTGGACAAGAATAGAACCCCTCTTTTCTGACAAAAACAAATAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCAGTATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTAGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATGCCAAAAAGTTGTTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAGC]
[+] EMBL CD077518 [ GTGGATTTAAAAATC TTATGGGTAATAATGGTCCACAACCATTTTGTATTG AATATATTGGTAAAGATTCATGGCTACCTCGAA GTCATACATGTTTTAATCGATTAGATCTACCACCATATCGATCATATGAACAATTGGCTGAGAAA TATCTTATGC ATTGATG AACAGAGGGTTTGGGACAg ]
[-] EMBL CD152757 [ TTTTTTGACAAAAACAAAGAAACTTACAAATTATGGTGCCTTTTTTCA TATGTATATCTTGTAGAGAAGAGAATTGAAAAGAGGGATGAAAGAAGAAAAATAGTTGGATGATCATTATTTGATTACATAATTGTTTCACTTAATTGTGTTGTATTTGATACCAAAAAGTTGTTTTTCTTTTTTATCCTCTATGTCGACTTCGACTGTTTTTTTTCCTATCCAGATGATGTAAACTTTGTAAGC]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||