These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9888#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 472 fasta sequence [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG-ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG-T-AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA-AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT] [+] EMBL CD179844 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAAATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTNCTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCT ] [+] EMBL CD179712 [GAAGAAGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTGNACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACT ] [+] EMBL CD184685 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTTACGCACGTCTTCATCGTACA ] [+] EMBL CD179788 [GAAGACGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATA ] [+] EMBL CD179754 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTT ] [+] EMBL CD179752 [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCGAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTAG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAGATGAAATATGG ATTG ] [+] EMBL CD179775 [tAAGAGGATAATGATGATGATGAGGAGGAGGATGAATATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTGCAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCATAGTATATTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTGTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATGCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACC ] [+] EMBL CD179793 [cAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTTTGGTTG ACTGGACTGAAg ] [-] EMBL CD184839 [ AAGAACATGGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT] [+] EMBL CD179672 [ AGTACAACACATTGAAAATGTCTGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTACAACCATTATT ] [-] EMBL CD179679 [ agAACACATTGAAAATGTCGGTTTG TCTGTACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAANAATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACGTTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT] [+] EMBL CD179830 [ AGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGA ] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||