Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9888 cluster # 9888       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9888#0 length = 472 sequences # 12  

consensusID : consensus_9888#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 472
fasta sequence
                              [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG-ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG-T-AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA-AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT]

[+] EMBL CD179844             [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAAATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTNCTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCT ]
[+] EMBL CD179712             [GAAGAAGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTGNACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACT                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD184685             [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTTACGCACGTCTTCATCGTACA                                                                                     ]
[+] EMBL CD179788             [GAAGACGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATA                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD179754             [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTT                                                                                                          ]
[+] EMBL CD179752             [GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCGAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTAG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAGATGAAATATGG  ATTG                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD179775             [tAAGAGGATAATGATGATGATGAGGAGGAGGATGAATATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTGCAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCATAGTATATTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTGTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATGCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACC                                                                                                       ]
[+] EMBL CD179793             [cAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTGACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTTTGGTTG ACTGGACTGAAg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD184839             [                                                                               AAGAACATGGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATTGAAAATGTCGGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT]
[+] EMBL CD179672             [                                                                                                           AGTACAACACATTGAAAATGTCTGTTTG ACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTACAACCATTATT                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CD179679             [                                                                                                              agAACACATTGAAAATGTCGGTTTG TCTGTACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAATGAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAG T AAAAATCGTTATTGTGATGTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATTTCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAANAATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACGTTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT]
[+] EMBL CD179830             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  AGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAA AATCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTAAAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGA         ]


>consensus_9888#0 GAAGAGGATAATGATGATGAGGAGGAGGAGGATGAAGATGATGACGATAACTTGGAAGTG ACTCAAACAATTATTATGCAAGAACATTGGATGAATCCAAATGAACTAGTACAACACATT GAAAATGTCGGTTTGACTGGACTTAATTCAGAGTATAGTGCACTTGTTCAGTTAAAGAAT GAATATACGCATATTGCTTTTAAGCATATACTTAATCGGAGTAAAAATCGTTATTGTGAT GTGATTTGTCATGATGCAACACGTGTTTATCTCCAACCATTATTATTATCGTCGGATATT TCCAGAATTTCCACTAGTCGTAGTGATGAAGATCCGACAGTATTATGTAATGCTCAAAAA TCCCTTACCGCACGTCTTCATCGTACACATTCAGCACCAATATCAGCGCATACATTAGTA AAAAATTATATTCATGCTAATTGGGTTGATGGTTATCGACAGAAAAACGCTT



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)