cluster # 9897

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Schistosoma mansoni
cluster # 9897 cluster # 9897 Sequences # 12 consensus # 3

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consensus_9897#0 length = 874 sequences # 6

consensus_9897#1 length = 675 sequences # 4
consensus_9897#2 length = 609 sequences # 2

consensusID : consensus_9897#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 874
fasta sequence

                              [CCTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAACTCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGGATGGGGTCCACAATCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTCTCAAAATCAGATCCCACCGACAGCAATAAAATGTTTTCGCAGATTTCAGTATCGAATTCTTCCGATGTTGGTTACATTTTGCTCGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCTTCGTACTGCTCTTCTTAGCTTATTTAGCAAAATACGTGCACGTTTTCCTAATCTTGTTGTTGCTGATATAACCCGTGACTCAGTTCGGGAAGCATTAATTCGTGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTTAACAGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAACCGATCAAATACGACTATGGGAATTAGAGCGAGATAGATTTCTATTTCAAGAAGGCTGTCTGTATGAACAATTCTCTCGGAATACAGATTTTGAAATGGTTCGGGATTATGC-TAAAAGTATTGGTGTTTTACTCTGGGAAAATCCTGAACGAAGACT-TATGGTTGTGTCTAAAGCAGGTCATGAAGATGTACGGAAATTTTGGAAACACAAACGTCCGTCCTAAAACTTTGTCACCGTTCACTTTTCCTTTCCTACTCCAGATTATATGTACGTAAATAGTTACATTTTCACTTTTATTCAAACAGTATTTGTTGAAGAAAGATTTTACAGCAAAACTCCGTGATTTGTTATTTTTCATATTATATTAAAATAAAATTGCCTTAAGTATTTATCTTCC]

[+] EMBL CD080185             [CCTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAACTCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGGATGGGGTCCACAATCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTCTCAAAATCAGATCCCACCGACAGCAATAAAATGTTTTCGCAGATTTCAGTATCGAATTCTTCCGATGTTGGTTACATTTTGCTCGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCTTCGTACTGCTCTTCTTAGCTTATTTAGCAAAATACGTGCACGTTTTCCTAATCTTGTTGTTGCTGATATAACCCGTGACTCAGTTCGGGAAGCATTAATTCGTGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTTAACAGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAACCGATCAAATACGACTATGGGAATTAGAGCGAGATAGATTTCTATTTCAAGAAGGCTGTCTGTATGAACAATTCTCTCGGAATACAGATTTTGAAATGGTTCGGGATTATGCNTAAAAGTATTGGTGTTTTACTCTGGGAAAATCCTGAACGAAGACTNNATGGTTGTGTCTAAAGCAGGTCATGAAGATGTACGGAAATTTTGGAAACACAAACGTCCGTCCTAAAACTNTGTCACCGTTCACTTTTCCTTTCCTACTCCAGATTATATGTACGTAAATAGTTACATTNTCACTTTTATTC AACAGTATTTGTTGAAGAAAGA TTTACAGC AAACTCCGGGATTTGTTA TTTTCATA TATATT AAATAAAATTGCCTT AGT TTTAT     ]
[+] EMBL AW587546             [                                                                                                                                                      TGGTGTCTCAAAATCAGATCCCACCGACAGCAATAAAATGTTTTCGCAGATTTCAGTATCGAATTCTTCCGATGTTGGTTACATTTTGCTCGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCTTCGTACTGCTCTTCTTAGCTTATTTAGCAAAATACGTGCACGTTTTCCTAATCTTGTTGTTGCTGATATAACCCGTGACTCAGTTCGGGAAGCATTAATTCGGGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTTAACAGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAACCGATCAAATACGACTATGGGAATTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[-] EMBL CD181984             [                                                                                                                                                                                    CAATAAAATGTTTTCGCAGA TTCAGTATCGAATTCTTCCGATGTTGGTTACATTTTGCTCGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL BG930646             [                                                                                                                                                                                                                                 TGGTTACATTTTGCTCGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCTTCGTACTGCTCTTCTTAGCTTATTTAGCAAAATACGTGCACGTTTTCCTAATCTTGTTGTTGCTGATATAACCCGTGACTCAGTTCGGGAAGCATTAATTCGTGGAATAACTGCAAATCAGAa                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[-] EMBL CD073409             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            GTTCGGGAAGCATTAATTCGTGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTTAACAGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAACCGATCAAATACGACTATGGGAATTAGAGCGAGATAGATTTCTATTTCAAGAAGGCTGTCTGTATGAACAATTCTCTCGGAATACAGATTTTGAAATGGTTCGGGATTATGC TAAAAGTATTGGTGTTTTACTCTGGGAAAATCCTGAACGAAGACT TATGGTTGTGTCTAAAGCAGGTCATGAAGATGTACGGAAATTTTGGAAACACAAACGTCCGTCCTAAAACTTTGTCACCGTTCACTTTTCCTTTCCTACTCCAGATTATATGTACGTAAATAGTTACATTTTCACTTTTATTCAAACAGTATTTGTTGAAGAAAGATTTTACAGCAAAACTCCGTGATTTGTTATTTTTCATATTATATTAAAATAAAATTGCCTTAAGTATTTATCTT  ]
[+] EMBL CD132795             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            TTCGTGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTTAACAGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAACCGATCAAATACGACTATGGGAATTAGAGCGAGATAGATTTCTATTTCAAGAAGGCTGTCTGTATGAACAATTCTCTCGGAATACAGATTTTGAAATGGTTCGGGATTATGC TAAAAGTATTGGTGTTTTACTCTGGGAAAATCCTGAACGAAGACT TATGGTTGTGTCTAAAGCAGGTCATGAAGATGTACGGAAATTTTGGAAACACAAACGTCCGTCCTAAAACTTTGTCACCGTTCACTTTTCCTTTCCTACTCCAGATTATATGTACGTAAATAGTTACATTTTCACTTTTATTCAAACAGTATTTGTTGAAGAAAGATTTTACAGCAAAACTCCGTGAATTGTTATTTTTCATATTATATTAAAATAAAATTGCCTTAAGTATTTATCTTCC]




>consensus_9897#0
CCTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAAC
TCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGG
ATGGGGTCCACAATCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTCTCAAAATCAGATCCCACCGACAG
CAATAAAATGTTTTCGCAGATTTCAGTATCGAATTCTTCCGATGTTGGTTACATTTTGCT
CGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCTTCGTACTGCTCTTCTTAG
CTTATTTAGCAAAATACGTGCACGTTTTCCTAATCTTGTTGTTGCTGATATAACCCGTGA
CTCAGTTCGGGAAGCATTAATTCGTGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTTAAC
AGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAACCGA
TCAAATACGACTATGGGAATTAGAGCGAGATAGATTTCTATTTCAAGAAGGCTGTCTGTA
TGAACAATTCTCTCGGAATACAGATTTTGAAATGGTTCGGGATTATGCTAAAAGTATTGG
TGTTTTACTCTGGGAAAATCCTGAACGAAGACTTATGGTTGTGTCTAAAGCAGGTCATGA
AGATGTACGGAAATTTTGGAAACACAAACGTCCGTCCTAAAACTTTGTCACCGTTCACTT
TTCCTTTCCTACTCCAGATTATATGTACGTAAATAGTTACATTTTCACTTTTATTCAAAC
AGTATTTGTTGAAGAAAGATTTTACAGCAAAACTCCGTGATTTGTTATTTTTCATATTAT
ATTAAAATAAAATTGCCTTAAGTATTTATCTTCC

consensusID : consensus_9897#1
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 4
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fasta sequence

                              [GTTTATATGTGAATTAATTTCCTTTCTCGCAGGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGGTATGTTCAAATTACTAACTGTAGATTTATTTTCACATATACTAACTATCAGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTAACTGTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAGCTTAAGTGCATTTGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGACTGTGCACACTTTTCTGTCTTAGGTTGTAGGTCACACTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGGTTTATATTTCACAACTCCAACTTCAATACAGTGAATAAGACTACTGCTATCCTCTTCTTCCTTGCCCCTTAT-AGTAGAGTAAGAAACCTGGTTTTTAATAGAAGCTTTGTTGATAATGACCCCCATTGTAACTAAAAGTACGTGTAAGT]

[+] EMBL CD168971             [GTTTATATGTGAATTAATTTCCTTTCTCGCAGGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGGTATGTTCAAATTACTAACTGTAGATTTATTTTCACATATACTAACTATCAGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTAACTGTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAGCTTAAGTGCATTTGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGACTGTGCACACTTTTCTGTCTTAGGTTGTAGGTCACACTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGGTTTATATTTCACAACTCCAACTTCAATACAGTGAATAAGACTACTGCTATCCTCTTCTTCCTTGCCCCTTAT AGTAGAGTAAGAAACCTGGTTTTTAATAGAAGCTTTGTTGATAATGACCCCCATTGTAACTAAAAGTACGTGTAAGT]
[+] EMBL CD169090             [GTTTATATGTGAATTAATTTCCTTTCTCGCAGGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGGTATGTTCAAATTACTAACCGTAGATTTATTTTCACATATACTAACTATCAGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTAACTGTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAGCTTAAGTGCATTTGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGACTGTGCACACTTTTCTGTCTTAGGTTGTAGGTCACACTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGGTTTATATTTCACAACTCCAACTTCAATACAGTGAATAAGACTACTGCTATCCTCTTCTTCCTTG CCCTTATAAGTAGAGTAAGA                                                                 ]
[+] EMBL CD168980             [GTTTATATGTGAATTAATTTCCTTTCTCGCAGGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGGTATGTTCAAATTACTAACTGTAGATTTATTTTCACATATACTAACTATCAGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTAACTGTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAGAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAGCTTAAGTGCATTTGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGACTGTGCACACTTTTCTGTCTTAGGTTGTAGGTCACACTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGGTTTATATTTCACAACTCCAACTTCAATACAGTGAATAAGACTACTGCTATCCTCTTCTTCCTTGC                                                                                     ]
[+] EMBL CD169036             [GTTTATATGTGAATTAATTTCCTTTCTCGCAGGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGGTATGTTCAAATTACTAACTGTAGATTTATTTTCACATATACTAACTATCAGTGAAGGTAATGGTTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTAACTGTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAGCTTAAGTGCATTTGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGACTGTGCACACTTTTCTGTCTTAGGTTGTAGGTCACACTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGGTTTATATTTCACAACTCCAACTTCAATACAGTGAATAAGACTACTGCT                                                                                                      ]




>consensus_9897#1
GTTTATATGTGAATTAATTTCCTTTCTCGCAGGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTG
AATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAAT
GGTATGTTCAAATTACTAACTGTAGATTTATTTTCACATATACTAACTATCAGTGAAGGT
AATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAG
TTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTA
ACTGTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGC
CCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAGCTTAAGTGCATT
TGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGACTGTGCACACTTTTCTGTCTTAGGT
TGTAGGTCACACTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGGTTTATATTTCACAA
CTCCAACTTCAATACAGTGAATAAGACTACTGCTATCCTCTTCTTCCTTGCCCCTTATAG
TAGAGTAAGAAACCTGGTTTTTAATAGAAGCTTTGTTGATAATGACCCCCATTGTAACTA
AAAGTACGTGTAAGT

consensusID : consensus_9897#2
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 2
consensus length = 609
fasta sequence

                              [TCTATTCGGATATCACTATTCGGAGGTGGAAAACCCTTACTTGGAGATTTAGGCGTTGTGACAAACGATAAGTACTCAAAAAGCGTTGACTTTTTAAAATCTTATGCAGCTGAACGATGGGATGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGAGCTATCCAGTAGAGGCACTGAGTACTGCCCAACAGGAAGTATTACAACATATGCGCGAACTCGGTTTAGCTTATCAACGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAACTCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGGATGGGGTCCACAATCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTCTCAAATCAG]

[+] EMBL CD192427             [TCTATTCGGATATCACTATTCGGAGGTGGAAAACCCTTACTTGGAGATTTAGGCGTTGTGACAAACGATAAGTACTCAAAAAGCGTTGACTTTTTAAAATCTTATGCAGCTGAACGATGGGATGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD078955             [      CGGATATCACTATTCGGAGGTGGAAAACCCTTACTTGGAGATTTAGGCGTTGTGACAAACGATAAGTACTCAAAAAGCGTTGACTTTTTAAAATCTTATGCAGCTGAACGATGGGATGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATCTTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTCGTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGAGCTATCCAGTAGAGGCACTGAGTACTGCCCAACAGGAAGTATTACAACATATGCGCGAACTCGGTTTAGCTTATCAACGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAACTCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGGATGGGGTCCACAATCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTCTCAAATCAG]




>consensus_9897#2
TCTATTCGGATATCACTATTCGGAGGTGGAAAACCCTTACTTGGAGATTTAGGCGTTGTG
ACAAACGATAAGTACTCAAAAAGCGTTGACTTTTTAAAATCTTATGCAGCTGAACGATGG
GATGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTGTTGTGAAG
GATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGTGAAGGTAATGATTGTCCAATCGGTATC
ACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGAGTCGACAGTTCCAGGTGCTAGTTTTCATC
TTGCACTACTTTGACTACTTGAAGGAAAATAGTAAAAATTTAGTTGGAGCCCTACAGTTC
GTCTTCCAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGAGCTATCCAGTAGAGGCACTGAGTACT
GCCCAACAGGAAGTATTACAACATATGCGCGAACTCGGTTTAGCTTATCAACGAAAACGT
ACAGCGCCTCGTTTCTATGTAACTCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACT
TTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGGATGGGGTCCACAATCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTC
TCAAATCAG

consensus multiple alignement with clustalw

CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment


consensus_9897#1      ------------------------------------------------------------
consensus_9897#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9897#0      CCTCCAGGCCAANAATTCGGCACGAGGGCGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAAC 60
                                                                                  

consensus_9897#1      ---------------------------------------GTTTATATGTGAATTAATTTC 21
consensus_9897#2      -----TCTATTCGGATATCACTATTCGGAGGTGGAAAACCCTTACTTGGAGATTTAGGCG 55
consensus_9897#0      TCCTCTTGCTTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGG 120
                                                               *     *   **       

consensus_9897#1      CTTTCTCGCAGGCTATAC-TTCACTTTATGGTAGGTTCT--GAATCAGCGGAAGTTGG-- 76
consensus_9897#2      TTGTGACAAACGATAAGTACTCAAAAAGCGTTGACTTTTTAAAATCTTATGCAGCTGA-- 113
consensus_9897#0      ATGGGGTCCACAATCGGGGGTTA-TTCCTACTGGTGTCTCAAAATCAGATCCCACCGACA 179
                       *       *   *      * *        *    * *   ****          *   

consensus_9897#1      AAG-TGTTGTGAAGGATGTCCTTTTATTGTCCAATTTAATGAAATGGTATGTTCAAAT-- 133
consensus_9897#2      ACGATGGGATGCTATACTTCACTTTATGGTAGGTTCTGAATCAGCGGAAGTTGGAAGTG- 172
consensus_9897#0      GCAATAAAATGTTTTCGCAGATTTCAGTATCGAATTCT-TCCGATGTTGGTTACATTTTG 238
                          *    **           ** *   *    *          *     *  *  *  

consensus_9897#1      -TACTAACTGTAGATTTATTTT-CACATATACTAACTATCAGTGAAGGTAATGATTGTCC 191
consensus_9897#2      -TTGTGAAGGATGTCCTTTTAT-TGTCCAATTTAATGAAATGTGAAGGTAATGATTGTCC 230
consensus_9897#0      CTCGAAACCAATTTTCGACTATACGCCTATACAGATTCACCGCTTCG-TACTGCTCTTCT 297
                       *    *            * *      *     *      *    * ** ** *  ** 

consensus_9897#1      -AATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGA-GTCGACAGTTCCAGGTG 249
consensus_9897#2      -AATCGGTATCACAAAGCACGGGTTCCATTTCTTGCTTATGA-GTCGACAGTTCCAGGTG 288
consensus_9897#0      TAGCTTATTTAGCAAAATACGTGCACGTTTTCCTAATCTTGTTGTTGCTGATATAACCCG 357
                       *     * *  ****  *** *  *  **** *  *  **  ** *    *   *   *

consensus_9897#1      CTAGTT--TTCATCTTGCACTACTTTG----ACTACTTGAAGGTAATTCAGCTACTAACT 303
consensus_9897#2      CTAGTT--TTCATCTTGCACTACTTTG----ACTACTTGAAGG----------------- 325
consensus_9897#0      TGACTCAGTTCGGGAAGCATTAATTCGTGGAATAACTGCAAATCAGATCCTATCTTTCTT 417
                        * *   ***     *** ** ** *    *  ***  **                   

consensus_9897#1      GTGATCTACTGTTGTTTTTTTATCTTAACAGGAAAATAGTAAAA----ATTTAGTTGGAG 359
consensus_9897#2      --------------------------------AAAATAGTAAAA----ATTTAGTTGGAG 349
consensus_9897#0      AACAGCCAATGCACATCCAGATATGTTACTACAGAATCCTATATTACCGCCTACTTTAAC 477
                                                      * ***  ** *        ** **  * 

consensus_9897#1      CCCTACAGTTCGTCTTC-----------CAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGGTGAG 408
consensus_9897#2      CCCTACAGTTCGTCTTC-----------CAACTTAGTTTTTTGTGTCCGACAAAGA-GCT 397
consensus_9897#0      CGATCAAATACGACTATGGGAATTAGAGCGAGATAGATTTCTAT-TTCAAGAAGGCTGTC 536
                      *  *  * * ** **             * *  *** *** * * * * * ** *  *  

consensus_9897#1      CTTAAGTGCATTTGTTTTATAAGGTTAAAATGCACTGGACCCAGTGA-CTGTGCACACTT 467
consensus_9897#2      ATCCAGTAGAGGCACTGAGTACTGCCCAACAGGAAGTATTACAACAT-ATGCGCGAACTC 456
consensus_9897#0      TGTATGAACAATTCTCTCGGAATACAGATTTTGAAATGGTTCGGGATTATGCTAAAAGTA 596
                           *   *          *      *     *       *       **     * * 

consensus_9897#1      TTCTGTCTTAGGTTGTAGGTCACA-CTTGTTATGGGTTCTCGTTATGTTCATGTACTAGG 526
consensus_9897#2      ----GGTTTAGCTTATCAACGAAAACGTACAGCGCCTCGTTTCTATGTAACTCCTCTTGC 512
consensus_9897#0      TTGGTGTTTTACTCTGGGAAAATCCTGAACGAAGACTTATGGTTGTGTCTAAAGCAGGTC 656
                             **   *        *           *  *  *   * ***            

consensus_9897#1      TTTATATTTCAC---AACTCCAACTTCAAT-----ACAGTGAATAAGACTACTGCTATCC 578
consensus_9897#2      TTTGGATTTCGCTGGAGGTCATACTACTTTCTTGGAAAGTAAATCAGGTGGATGGGGTCC 572
consensus_9897#0      ATGAAGATGTACGGAAATTTTGGAAACACAAACGTCCGTCCTAAAACTTTGTCACCGTTC 716
                       *     *   *   *  *       *               *  *           * *

consensus_9897#1      TCTTCTTCCTTGCCCCTTATAGTAGAGTAAGAAACCTGGTTTTTAATAGAAGCTTTGTTG 638
consensus_9897#2      ACAA-TCGGGGGTTATTCCTACTGGTGTCTCAAATCAG---------------------- 609
consensus_9897#0      ACTTTTCCTTTCCTACTCCAGATTATATGT-ACGTAAATAGTTACATTTTCACTTTTATT 775
                       *   *          *     *    *   *                            

consensus_9897#1      ATAATGACCCCCATTGTAACTAAAAGTACGTGTAAGT----------------------- 675
consensus_9897#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9897#0      CAAACAGTATTTGTTGAAGAAAGATTTTACAGCAAAACTCCGTGATTTGTTATTTTTCAT 835
                                                                                  

consensus_9897#1      ---------------------------------------
consensus_9897#2      ---------------------------------------
consensus_9897#0      ATTATATTAAAATAAAATTGCCTTAAGTATTTATCTTCC 874