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Schistosoma mansoni
cluster # 9945 cluster # 9945       Sequences # 12       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9945#0 length = 285 sequences # 12  
consensusID : consensus_9945#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 285
fasta sequence 
                              [CCTACCGTCCTCCCTCACCCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG--A-GGCA-TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]

[+] EMBL CD071046             [CCTACCGTCCTCCCTCACCCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTTACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071025             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAACTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACA T TGTTNNAAGNNAGGGCATTGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAATATGAAACGTATTGTC ATTACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071047             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071061             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071107             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071130             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071135             [                  CCTTGTGTCCACAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071153             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071165             [                  CCTTGTGCCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071201             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071070             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAGGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]
[+] EMBL CD071209             [                  CCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATTAATATATCACATACAG   TAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATG  A GGCA TGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGATTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGTATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG]




>consensus_9945#0
CCTACCGTCCTCCCTCACCCTTGTGTCCATAAAAAATTAAACGTATAAATTCTGGTTATT
AATATATCACATACAGTAATAATAATAATAAACTCTCAAATAACAGTCTGTTACATGAGG
CATGCCAGTTTACGGGAAAGATCAGATTGTTACAGAAGTTACAATTTTCACTGTAGTAGA
TTACTCAGCTTGGTTAATACTTTATAAGATATGAATTTAGATGGTATTAGTATGAAACGT
ATTGTCAATAACACAATTGACGCACTTTATGCAGGTTGTGTTGCG

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)