These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_9962#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 12 consensus length = 544 fasta sequence [TCTCTGAGACGAAATCGTCGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT-GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA] [+] EMBL CD149537 [TCTCTGAGACGAAATCGTCGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGA ] [+] EMBL CD149477 [caTCTGAGACGAAACCGTCGAACCGAGCAACGGATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAATGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGT GAA CGAAGTTTTGGTTATCTGTTCt ] [+] EMBL CD149321 [ CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCACACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGGTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGATCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTATTCTCATACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCANATTATCGTATACCCAGCCGACAACCATTCGCGATTACCTTAAAACACTTATAATCAAGAAACACCCCACANTTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTC AAATCTACTTCCAGGATTTAAAGTTTGTTTATTGACGAc] [+] EMBL CD149306 [ CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCCAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCTCGT AAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATCCTCAAATTATCGGAAACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTAC TTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACATTTGAT AATCCTGATAAAAACAAG TCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAG TTGGTTATTGACa ] [+] EMBL CD149669 [ CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGT GAA CGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGGGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTGTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAGAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATG AAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGGTTATTGACGA ] [+] EMBL CD149259 [ CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCAT ] [+] EMBL CD149416 [ CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCATACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTATAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTT ] [+] EMBL CD149204 [ CGAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTATAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCC ] [-] EMBL CD149335 [ GAACCGAGCAACATATTACCNATTCACCAGTATGAACTGCTAAGGAGAACTCAGACTGCGTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTC TTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAGTTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTGAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGTAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA] [-] EMBL CD149133 [ GAACCGAGCAACATATTACCAATTCACCAGTATGAACTGNTAAGGAGAACTCAGACTGCCTAATTTTTTGTAATTACATGTTATTTCTTTTTCTTAGAGAATAATCTCGATAGCACTTTTCCAAACTATATTTCAGTAATTACCTATACTGTTATTTGATCAATTGTTTTTAATTACAGTTTGACAGTTGTGTTAAGCATCCCAACATCACTGGGTCTTACTTTGT GAA CGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAGGATAAAGTTGTTCTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGGGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA] [-] EMBL CD149227 [ CATCACTGGGTCTTGCTTTGCAAACGAAGTTGTCGAAGTTTTGGTTATCTGTTCGAAAGATAAAGTTGTTNTAAGAAGTCCCTTCACCAATTGGCGTGTGGATTACTAACGTCGAAGTGTTTTTCTTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAGAGTTTGTTTATTGACGAA] [-] EMBL CD149288 [ TTAAACGTCCGGTCT GTCAAGTTCCCATTAGTCTTTTTAGTATTAAAAGATTCTCAAATTATCGTAGACCCAGCCGAAAACCAATCGCGATTACATTAAAAAACTTAAAATAAAGAAACAACCCACAATTGATAAATCCTGATGAAAACAAGTTCAAAATCTACTTCCAGGTTTTAAAGTTTGTTTATTGACGAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||