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Schistosoma mansoni
cluster # 9971 cluster # 9971       Sequences # 12       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9971#0 length = 1995 sequences # 12  

consensusID : consensus_9971#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 1995
fasta sequence
                              [CTTACCATTTCTAGTGCGCCCAGAGTACCAGCAAATCAACATGATAGGGATTTCTGGTCAGCTTTGATAGGATCTCTGTTTGGATCCCATAAGTTTTCATCTGCAAAGAATACTTTAGCAGCTGTTGACTCAACTTCTAGAAGTCAGGATGCAGAATTACCTGACAGGCAACGCCCTTTAAATGATTGGACTGAAGTCGATGGTTTCTGGGAGTCTAACAACGTATCTGCTTCCTCTTCACTATCAAATTCTAACGTTAATTCCCAAAATACTCAAATTGACGTGTCATTACCACCAGGTTGGGAAAGACGTTTTGACAAGTCAACTCAGAAATATTATTTTATCAACCATAAATGTAAAATCACTCAATGGGAGGATCCACGTGAACGTGGAATGGATGAAACACAACCTCTCCCGCCTGGATGGGAGAAACGTTATACGGCCCAGGGACAAAGGTTTTTCATTGATCATAATACCCATGCT-ACTACCCTTGTTGATCCACGTACTGGACAACATGCTGGTTCACTAGGTAGTATGGGAGTCCCATTGCACTATGAAAGGAATTTCCGATCCAAAGTGAATTATTTTCGTGCTTGTTGTACAAATGCCATGTTAAATGGGCAAACTAAACTTCTTATATCAAGAGACAATTTATTAGAGGACTCGTTCCAACTGGTATCTCAAATGTCTTCATCTGGTTTAAGAAGACGTTTATCAATTACATTTCTACATGAAGAAGGTTTGGATTACGGTGGAGTAGCCAGAGAATGGTTCTATCGTCTTTCAAGAGAAATTTTAAACCCAATGTTTGGCTTGTTTGAGTATACTGGAACAGATTATGCCTTACAAGTAAATCCAGCCTCTCATGTTAATCCAAATCATATGGCGTATTTTCGATTTGTTGGACGCTTTATTGGTATGGCACTTTTTCATGGTCGCTGTATTGACGGCGGGCTTACTCTTGCTTTTTATAAACAAATTTTGAAGCGGAAATTAACATTAGAAGATCTTGGTCATACGGATCACAGTTATTATCAATCGTTAATTTATGTCAGAGACAATCCAGTTGATGAGTGTGA-TTGGACTTGTACTTTATTGGAACCTATGACCTTTTAGGCGTTTTGCATGAAGACGAACTTATTGAAGGTGGCAAAGATATTAAAGTGACTGAAGAAAATAAATCCGATTATATCAGACTGATGGTTGATTGGCGGTTCAACAGAGGAGTAAAAAAAC-AACAGAAGAAATT-ACAAAGGTATTTTTGAAGTACTAAATCCCGAATGGCTGGAATTATTCGATGAGCGTGAACTTGAACTCCTATTATCCGGTATGCCAGAGATTGATGTTGATGATTGGGAAAAGAACACGGTCTACATAAAGTACACACGATCAAGTAAACAGATTATTTGGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACAATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAATTCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGACAAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTTATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTGAAACGTTTTGTGGAGGTTTGGGTGGACGGTTAATTGATAAAATCAGTGGCATACTGTGTTTTGAATAAACTGTGATCTATTATCAATTAGTAACCTTTTTTAGCATATAATTTCCTTTTCCATTTTCTCTTTTCTATTATCATTATTATTATTATTATTGTCTCTGGGTAATGAAAATTATTTTATTATATAAAAGGTAAAAAAAANAA]

[+] EMBL CD118431             [CTTACCATTTCTAGTGCGCCCAGAGTACCAGCAAATCAACATGATAGGGATTTCTGGTCAGCTTTGATAGGATCTCTGTTTGGATCCCATAAGTTTTCATCTGCAAAGAATACTTTAGCAGCTGTTGACTCAACTTCTAGAAGTCAGGATGCAGAATTACCTGACAGGCAACGCCCTTTAAATGATTGGACTGAAGTCGATGGTTTCTGGGAGTCTAACAACGTATCTGCTTCCTCTTCACTATCAAATTCTAACGTTAATTCCCAAAATACTCAAATTGACGTGTCATTACCACCAGGTTGGGAAAGACGTTTTGACAAGTCAACTCAGAAATATTATTTTATCAACCATAAATGTAAAATCACTCAATGGGAGGATCCACGTGAACGTGGAATGGATGAAACACAACCTCTCCCGCCTGGATGGGAGAAACGTTATACGGCCCAGGGACAAAGGTTTTTCATTGATCATAATACCCATGCTGACTACCCTTGTTGATCCACGTACTGGACAACATGCTGGTTCACTAGGTAGTATGGGAGTCCCATTGCACTATGAAAGGAATTTCCGATCCAAAGTGAATTATTTTCGTGC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[+] EMBL CD078376             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATACCCATACT ACTACCCTTGTTGATCCACGTACTGGACAACATGCTGGTTCACTAGGTAGTATGGGAGTCCCATTGCAATATGAAAGGAATTTCCGATCCAAAGTGAATTATTTTCGTGCTTGTTGTACAAATGCCATGTTAAATGGGCAAACTAAACTTCTTATATCAAGAGACAATTTATTAGAGGACTCGTTCCAACTGGTATCTCAAATGTCTTCATCTGGTTTAAGAAGACGTTTATCAATTACATTTCTACATGAAGAAGGTTTGGATTACGGTGGAGTAGCCAGAGAATGGTTCTATCGTCTTTCAAGAGAAATTTTAAACCCAATGTTTGGCTTGTTTGAGTATACTGGAACAGATTATGCCTTACAAGTAAATCCAGCCTCTCATGTTAATCCAAATCATATGGCGTATTTTCGATTTGTTGGACGCTTTATTGGTATGGCACTTTTTCATGGTCGCTGTATTGACGGCGGGCTTACTCTTGCTTTTTATAAACAAATTTTGAAGCGGAAATTAACATTAGAAGATCTTGGTCATACGGATCACAGNTATTATCAATCGTTAATTTATGTCAGAGACAATCC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CD152991             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGGATTACGGTGGAGTAGCCAGAGAATGGTTCTATCGTCTTTCAAGAGAAATTTTAAACCCAATGTTTGGCTTGTTTGAGTATACTGGAACAGATTATGCCTTACAAGTAAATCCAGCCTCTCATGTTAATCCAAATCATATGGCGTATTTTCGATTTGTTGGACGCTTTATTGGTATGGCACTTTTTCATGGTCGCTGTATTGACGGCGGGCTTACTCTTGCTTTTTATAAACAAATTTTGAAGCGGAAATTAACATTAGAAGATCTTGGTCATACGGATCACAGTTATTATCAATCGTTAATTTATGTCAGAGACAATCCAGTTGATGAGTGTGATTTGGACTTGTACTTTATTGGAACCTATGACCCTTTAGGCGTTTTGCATGAAGACGAACTTATTGAAGGTGGCAAAGATATTAAAGTGACTGAAGAAAATAAATCCGATTATATCAGACTGATGGTTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]
[+] EMBL CD184251             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        TTTATAAACAAATTTTGAAGCGGAAATTAACATTAGAAGATCTTGGTCATACGGATCACAGTTATTATCAATCGTTAATTTATGTCAGAGACAATCCAGTTGATGAGTGTGATTTGGACTTGTACTTTATTGGAACCTATGACCTTTTAGGCGTTTTGCATGAAGACGAACTTATTGAAGGTGGCAAAGATATTAAAGTGACTGAAGAAAATAAATCCGATTATATCAGACTGATGGTTGATTGGCGGTTCAACAGAGGAGTAAAAAAACAAACAGAAGAAATTCACAAAGGTATTTTTGAAGTACTAAATCCCGAATGGCTGGAATTATTCGATGAGCGTGAACTTGAACTCCTATTATCCGGTATGCCAGAGATTGATGgtttgg                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD084338             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            cgAGGGACAATCCAGTTGATGAGTGTGA TTGGACTTGTACTTTATTGGAACCTATGACCTTTTAGGCGTTTTGCATGAAGACGAACTTATTGAAGGTGGCAAAGATATTAAAGTGACTGAAGAAAATAAATCCGATTATATCAGACTGATGGTTGATTGGCGGTTCAACAGAGGAGTAAAAAAACAAACAGAAGAAATTCACAAAGGTATTTTTGAAGTACTAAATCCCGAATGGCTGGAATTATTCGATGAGCGTGAACTTGAACTCCTATTATCCGGTATGCCAGAGATTGATGTTGATGATTGGGAAAAGAACACGGTCTACATAAAGTACACACGATCAAGTAAACAGATTATTTGGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACAATGGCTTCCACG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                  ]
[+] EMBL CD077821             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          gcTGATGAGTGCGATTTGGACTTGTACTTTATTGGAACCTATGACCTTTTAGGCGTTTTGCATGAAGACGAACTTATTGAAGGTGGCAAAGATATTAAAGTGACTGATGAAAATAAATCCGATTATATCAGACTGATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CD077660             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 AAAACAAACAGAAGAAATTCACAAAGGTATTTTTGAAGTACTAAATCCCGAATGGCTGGAATTATTCGATGAGCGTGAACTTGAACTCCTATTATCCGGTATGCCAGAGATTGATGTTGATGATTGGGAAAAGAACACGGTCTACATAAAGTACACACGATCAAGTAAACAGATTATTTGGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD079597             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       gcacGAGGAACTT ACAAAGGTATTTTTGAAGTACTAAATCCCGTATGGCTGGAATTATTCGATGAGCGTGAACTTGAACTCCTATTATCCGGTATGCCAGAGATTGATGTTGATGATTGGGAAAAGAACACGGTCTACATAAAGTACACACGATCAAGTAAACAGATTATTTGGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACAATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAATTCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGACAAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTTATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTGAAACGTTTTGTGGAGGTTTGGGTGGACGGTTAATTGATAAAATCAGTGGCATACTGTGTTTTGAATAAACTGTGATCTATTATCAATTAGTAACCTTTTTTAGCATATAATTTCCTTTTCCATTNTCTCTTTTCTATTATCATTATTATTATTAATATTGGCTCTGGGTAATGAAAA                                ]
[-] EMBL CD073859             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ATGATTGGGAAAAGAACACGGTCTACATAAAGTACACACGATCAAGTAAACAGATTATTTGGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACAATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAATTCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGACAAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTTATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTGAAACGTTTTGTGGAGGTTTGGGTGGACGGTTAATTGATAAAATCAGTGGCATACTGTGTTTTGAATAAACTGTGATCTATTATCAATTAGTAACCTTTTTTAGCATATAATTTCCTTTTCCATTTTCTCTTTTCTATTATCATTGTTATTATTATTATTGTCACTGGGTAATGAAAATTATTTTATTAAAAAAAAGGTAAAAAAAANAA]
[-] EMBL CD076990             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    GGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACAATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAATTCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGACAAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTTATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTGAAACGTTTTGTGGAGGTTTGGGTGGACGGTTAATTGATAAAATCAGTGGCATACTGTGTTTTGAATAAACTGTGATCTATTATCAATTAGTAACCTTTTTTAGCATATAATTTCCTTTTCCATTTTCTCTTTTCTATTATCATTATTATTATTATTATTGTCTCTGGGTAATGAAAATTATTTTATTATATA                 ]
[-] EMBL CD072937             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              GATAATGAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACAATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAATTCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGACAAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTTATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTGAAACGTTTTGTGGAGGTTTGGGTGGACGGTTAATTGATAAAATCAGTGGCATACTGTGTTTTGAATAAACTGTGATCTATTATCAATTAGTAACCTTTTTTAGCATATAATTTCCTTTTCCATTTTCTCTTTTCTATTATCATTATTATTATTATTATTGTCTCTGGGTAATGAAAATTATTTTATTATATA                 ]
[-] EMBL CD119906             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   CTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGCTTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGATGAACGATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAATTCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGACGAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTTATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTG                                                                                                                                                                                                                 ]


>consensus_9971#0 CTTACCATTTCTAGTGCGCCCAGAGTACCAGCAAATCAACATGATAGGGATTTCTGGTCA GCTTTGATAGGATCTCTGTTTGGATCCCATAAGTTTTCATCTGCAAAGAATACTTTAGCA GCTGTTGACTCAACTTCTAGAAGTCAGGATGCAGAATTACCTGACAGGCAACGCCCTTTA AATGATTGGACTGAAGTCGATGGTTTCTGGGAGTCTAACAACGTATCTGCTTCCTCTTCA CTATCAAATTCTAACGTTAATTCCCAAAATACTCAAATTGACGTGTCATTACCACCAGGT TGGGAAAGACGTTTTGACAAGTCAACTCAGAAATATTATTTTATCAACCATAAATGTAAA ATCACTCAATGGGAGGATCCACGTGAACGTGGAATGGATGAAACACAACCTCTCCCGCCT GGATGGGAGAAACGTTATACGGCCCAGGGACAAAGGTTTTTCATTGATCATAATACCCAT GCTACTACCCTTGTTGATCCACGTACTGGACAACATGCTGGTTCACTAGGTAGTATGGGA GTCCCATTGCACTATGAAAGGAATTTCCGATCCAAAGTGAATTATTTTCGTGCTTGTTGT ACAAATGCCATGTTAAATGGGCAAACTAAACTTCTTATATCAAGAGACAATTTATTAGAG GACTCGTTCCAACTGGTATCTCAAATGTCTTCATCTGGTTTAAGAAGACGTTTATCAATT ACATTTCTACATGAAGAAGGTTTGGATTACGGTGGAGTAGCCAGAGAATGGTTCTATCGT CTTTCAAGAGAAATTTTAAACCCAATGTTTGGCTTGTTTGAGTATACTGGAACAGATTAT GCCTTACAAGTAAATCCAGCCTCTCATGTTAATCCAAATCATATGGCGTATTTTCGATTT GTTGGACGCTTTATTGGTATGGCACTTTTTCATGGTCGCTGTATTGACGGCGGGCTTACT CTTGCTTTTTATAAACAAATTTTGAAGCGGAAATTAACATTAGAAGATCTTGGTCATACG GATCACAGTTATTATCAATCGTTAATTTATGTCAGAGACAATCCAGTTGATGAGTGTGAT TGGACTTGTACTTTATTGGAACCTATGACCTTTTAGGCGTTTTGCATGAAGACGAACTTA TTGAAGGTGGCAAAGATATTAAAGTGACTGAAGAAAATAAATCCGATTATATCAGACTGA TGGTTGATTGGCGGTTCAACAGAGGAGTAAAAAAACAACAGAAGAAATTACAAAGGTATT TTTGAAGTACTAAATCCCGAATGGCTGGAATTATTCGATGAGCGTGAACTTGAACTCCTA TTATCCGGTATGCCAGAGATTGATGTTGATGATTGGGAAAAGAACACGGTCTACATAAAG TACACACGATCAAGTAAACAGATTATTTGGTTTTGGAAGTTGATTCAAAAACTTGATAAT GAACATCGTGCTCGTCTTCTTCAATTCGTCACTGGTACCTGTCATTTACCATTAGGAGGC TTCTCTGAATTGACTGGCAGCGGTGGTCGTCAATTATTTTGTATTGAGCGTACAGGTGAT GAACAATGGCTTCCACGTAGTCACACATGTTTCAACCGGTTAGATTTACCGCCATACAAT TCGTACGATCAATTGTGCGAAAAACTGCAAATGGCAATTGAAGAAACTAAGGGATTTGGA CAAGAATAAATCTAACCACCTCTATGACACCCTTAAAAACACTTAAATTATGTTATTTTT ATTGTGTATATTCCAGTAATCACCTGTCACAGTAATGATTGATGTGAAACGTTTTGTGGA GGTTTGGGTGGACGGTTAATTGATAAAATCAGTGGCATACTGTGTTTTGAATAAACTGTG ATCTATTATCAATTAGTAACCTTTTTTAGCATATAATTTCCTTTTCCATTTTCTCTTTTC TATTATCATTATTATTATTATTATTGTCTCTGGGTAATGAAAATTATTTTATTATATAAA AGGTAAAAAAAANAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)