cluster # 9977

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Schistosoma mansoni
cluster # 9977 cluster # 9977 Sequences # 12 consensus # 1
see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_9977#0 length = 479 sequences # 12
consensusID : consensus_9977#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 12
consensus length = 479
fasta sequence
                              [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA]

[+] EMBL CD121046             [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGGACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCATAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ]
[+] EMBL CD121734             [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ]
[+] EMBL CD121026             [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAA TTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC ]
[+] EMBL CD121017             [GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGGTCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGAC                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[-] EMBL CD121049             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD159084             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD159167             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD159424             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD120913             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATCCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGTCCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTCTTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTGGTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA]
[-] EMBL CD159091             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD159410             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACGAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]
[-] EMBL CD120958             [ AGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]




>consensus_9977#0
GAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATTGTCGACT
GTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATTGTGACAA
AAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACAGGTAAAGT
CCAAGCACAGGAGTCAGCTCGGTTTGGGAACTCCTAGTTTGACCCTATCTTTCCTAAGTC
TTATTCCTAAGGCTTCTGTTTCCAGCTTGCCGGCCTTTGTATATAAATCCCATGCTTGTG
GTGAGCTGAGTACTCAGCATATCAACTCAACCGTCACAGTATGCGGATGGCTTGAGCATT
GTCGACTGTCATCTCGTTTTCTCGTTCTTCGTGATGATCGTGGTTTAATACAAATATATT
GTGACAAAAATTCTCTCCAAATTCCGCAATTTAATTCTGAGTCTGTCCTGAGAGTGACA
clustalw multiple alignements is not computed in this case