| These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Schistosoma mansoni see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs : 
 consensusID : consensus_9981#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 1026 fasta sequence 
                              [ATTCGCACCGGTGCACGTTGTGTATTAACTGGTACAATAAGAGTTAAAAGTTTTGGTTATGAGAAACATGTTACTATTCGCATTACATATAACAACTGGATTACGTTTTTCGATACATCTGCATCATACATTCAAGGATCATATGATGGTGTAACGGATAAATTTTCATTTAGTTTAATCTTTCCTGATACAATGGTACCAGGTGATAAAGCACAATTTGCTATACGATATGAAACACATACTGGTGAACAATTTTGGGATAATAATCATGGTCAAAATTATTGTGTAACATGTTATGCGAAAGCCACGGATCTAGCTGGTGATGGATCATGGATGCATTATCTTTGATTTTCGTGTTTTCAAATTGTGATGAACACTGTTAAAATTATTTATCCAATTTTGATTGTTCCACATTCAAACTATCATTTAATAACTTTAGTTTGTCTTAACCTTTTTTTCATGCATACATACATACACGCATGTGGACAAAAAATTGGTCCTTTAAAAAACCATATATCATCGCGCCAATCATTCATTACTCAAGAAACTCCAGTTAGCTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATTAATTATTATAATAATTAATTAAACTGCCTTACATTCAAGATTCATCTTCATATTAGTCAGTGCACACAATTAGTCTTTCATCGGGATTTTTTTTTTTCACTATATTTCTTTTGAAATTTTCATTCTTAAATTTAGAATTTCAAGTTAACAATAAAATATTCCCTTATCATCCCCGATTTAATATGTATTTACAGAACCTTAAAATAAAAAAAAAGTGATTTTCCCCTATACAGAACACGTTCANGTGAGGTGTAATGTTTTTGATCGGAAGTGAGATATTTATGGTGATCAACTGCCTTTGAATCCTATGTATTACGANTATAATAATAATCATTACTATTAACTATTATTAACANGAGAAACATTGNTATCGATAATGTTTGTCTAATTTGCTG-NAATAGCTGATAGATCGACC-AAAAAGAAAT-AACTTG]
[+] EMBL CD081517             [ATTCGCACCGGTGCACGTTGTGTATTAACTGGTACAATAAGAGTTAAAAGTTTTGGTTATGAGAAACATGTTACTATTCGCATTACATATAACAACTGGATTACGTTTTTCGATACATCTGCATCATACATTCAAGGATCATATGATGGTGTAACGGATAAATTTTCATTTAGTTTAATCTTTCCTGATACAATGGTACCAGGTGATAAAGCACAATTTGCTATACGATATGAAACACATACTGGTGAACAATTTTGGGATAATAATCATGGTCAAAATTATTGTGTAACATGTTATGCGAAAGCCACGGATCTAGCTGGTGATGGATCATGGATGCATTATCTTTGATTTTCGTGTTTTCAAATTGTGATGAACACTGTTAAAATTATTTATCCAATTTTGATTGTTCCACATTCAAACTATCATTTAATAACTTTAGTTTGTCTTAACCTTTTTTTCATGCATACATACATACACGCATGTGGACAAAAAATTGGTCCTTTAAAAAACCATATATCATCGCGCCAATCATTCATTACTCAAGAAACTCCAGTTAGCTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATTAATTATTATAATAATTAATTAAACTGCCTTACATTCAAGATTCATCTTCATATTAGTCAGTGCACACAATTAGTCTTTCATCGGGATTTTTTTTTTTCACTATATTTCTTTTGAAATTTTCATTCTTAAATTTAGAATTTCAAGTTAACAATAAAATATTCCCTTATCATCCCCGATTTAATATGTATTTACAGAACCTTAAAATAAAAAAAAAGTGATTTTCCCCTATACAGAACACGTTCANGTGAGGTGTAATGTTTTTGATCGGAAGTGAGATATTTATGGTGATCAACTGCCTTTGAATCCTATGTATTACGANTATAATAATAATCATTACTATTAACTATTATTAACANGAGAAACATTGNTATCGATAATGTTTGTCTAATTTGCTG NAATAGCTGATAGATCGACC AAAAAGAAAT AACT  ]
[+] EMBL CD197396             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                    ATCTTTGATTTTCGTGTTTTCAAATTGTGATGAACACTGTTAAAATTATTTATCCAATTTTGATTGTTCCACATTCAAACTATCATTTAATAACTTTAGTTTGTCTTAACCTTTTTTTCATGCATACATACATACACGCATGTGGACAAAAAATTGGTCCTTTAAAAAACCATATATCATCGCGCCAATCATTCATTACTCAAGAAACTCCAGTTAGCTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATAAATTATTATAATAATAAATc                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                              ]
[-] EMBL CD075340             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                          AAACCATATATCATCGCGCCAATCATTCATTACTCAAGAAACTCCAGTTAGCTTTCATATATATATATATATATATATATATATATATTAATTATTATAATAATTAATTAAACTGCCTTACATTCAAGATTCATCTTCATATTAGTCAGTGCACACAATTAGTCTTTCATCGGGATTTTTTTTTTTCACTATATTTCTTTTGAAATTTTCATTCTTAAATTTAGAATTTCAAGTTAACAATAAAATATTCCCTTATCATCCCCGATTTAATATGTATTTACAGAACCTTAAAATAAAAAAAAAGTGATTTTCCCCTATACAGAACACGTTCAGGTGAGGTGTAATGTTTTTGATCGGAAGTGAGATATTTATGGTGATCAACTGCCTTTGAATCCTATGTATTACGATAATAATAATAATCATTACTATTAACTATTATTAACAAGAGAAACATTGTTATCGATAATGTTTGTCTAATTTGCTGTAAATAGCTGATAGATCGACCAAAAAAGAAATAAACTTG]
consensusID : consensus_9981#1 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 923 fasta sequence 
                              [AAAACGAACAGCTTTTGGTACATATGTGTCTGAAAGGCTTCTATTGGATTTTAGTGAACTACTACGTTTTGGTTTAGTAGTTTCAGGGGTTTCAACTATATCTTTTACTGAGAATGCTTGATTACCTTCATATGGTAAGAAGGTTGATAAATCTGCTGAATTCTTTTTTCGATTGTTGTTAATATTTGTATGACAGAC-AGGGCTACGATCTCTGCTAGGTCGTTGTAAGGAATTCGGCACAGGAGGTCGAGATGATATATTGGAACTTTTATCTACTTTTTCAATGGAGCTAGCTGTTTCACTGGAGGGTGATAGGTCTTCCGTATGCTTATTTGATAAAATCTCACTTGAATCAGTATC-TATT-TCATTAGTTGTATT-ATCAATACAGAGATTAGACATTGCCCATGCCAATGTCTGATCTGATC-GACTAACATCTGGTAAATTCAAATCTATTTCAGGTGATTTATCAAAACATTCAGCTTGTAAACTATCGTCTTCCAGTGTATTAGGACTCA-AAAGTGGGTAAGAATGATCGGATGAATTAAGTTGTCCAGGTGATGCATTTATATCATCTGATAATATTGATCCTACTTCGAAATTATATTCAGTTACATGATTGTCAATGGGTGTTTCTGACTTAATTGGTGTTGGCTTATTCCATGCGTACATTTTACGTACTTCAACTGGTACACTTATATCACTTGAATTAGATAAATTACGTGGTAATACAGAGTTTAATAAATTATGAACATAATTATCACGAGTTACCTTATCAATAAAACCGTTCACTGAATCCGACTGATATGAATCCAATAAGGTAAATGTTACAGGACTAGATTCGGTACATAAATATCCAGGATCAGTAAATAATGCTGTAGAAATTGGAATTACTTCCGTATCAGTTAAAGGTTTACAATTTAATG]
[+] EMBL CD189431             [AAAACGAACAGCTTTTGGTACATATGTGTCTGAAAGGCTTCTATTGGATTTTAGTGAACTACTACGTTTTGGTTTAGTAGTTTCAGGGGTTTCAACTATATCTTTTACTGAGAATGCTTGATTACCTTCATATGGTAAGAAGGTTGATAAATCTGCTGAATTCTTTTTTCGATTGTTGTTAATATTTGTATGACAGAC AGGGCTACGATCTCTGCTAGGTCGTTGTAAGGAATTCGGCACAGGAGGTCGAGATGATATATTGGAACTTTTATCTACTTTTTCAATGGAGCTAGCTGTTTCACTGGAGGGTGATAGGTCTTCCGTATGCTTATTTGATAAAATCTCACTTGAATCAGTATC TATT TCATTAGTTGTATT ATCAATACAGAGATTAGACATTGCCCATGCCAATGTCTGATCTGATC GACTAACATCTGGTAAATTCAAATCTATTTCAGG                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                 ]
[+] EMBL CD133630             [AAAACGAACAGCTTTTGGTACATATGTGTCTGAAAGGCTTCTATTGGATTTTAGTGAACTACTACGTTTTGGTTTAGTAGTTTCAGGGGTTTCAACTATATCTTTTACTGAGAATGCTTGATTACCTTCATATGGTAAGAAGGTTGATAAATCTGCTGAATTCTTTTTTCGATTGTTGCTAATATTTGTATGACAGAC AGGGCTACGATCTCT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                           ]
[-] EMBL CD124252             [                                                                                                                                                                              GTTGTTAATATTTGTATGACAGACAAGGGCTACGATCTCTGTAAGGTCG TGTAAGGAATTCGGCACAGGAGGTCGAGATGATATATTGGAACTTTTATCTACTTTTTCAATGGAGCTA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD066742             [                                                                                                                                                                                                                                                              GATATATTGGAACTTTCATCTACTTTTTCAATGGAGCTAGCTGTTTCACTGGAGGGTGATAGGTCTTCCGTATGCTTATTTGATAAAATCTCACTTGAATCAGTATC TATT TCATTAGTTGTATT ATCAATACAGAGATTAGACATTGCCCATGCCAATGTCTGATCTGATCAGACTAACATCTGGTAAATTCAAATCTATCTCAGGTGATTTATCACAACATTCAGCTTGTAGACTATCGTCTTCCAGTGTATTACGACTCA TAAGTGGGTAAGAATGATCGGATGAATTAAGTTGTCCAGGTGATGCATTTATATCATCTGATAATATTGATCCTACTTCGAAATTATATTCAGTTACATGATTGTCAATGGGTGTTACTGACTTAATTGGTGTTGGCTTATTCCATGC                                                                                                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CD167516             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CTCACTTGAATCAGTATCGTATTGTCATTAGTTGTATTGATCAATACAGAGATTAGACATTGCCCATGCCAATGTCTGATCTGATC GACTAACATCTGGTAAATTCAAATCTATTTCAGGTGATTTATCTAAACATTCAGCTTGTAAACTATCGTCTTCCAGTGTATTAGGACTCA AAAGTGGGTAAGAATGATCGGATGAATTAAGTTGTCCAGGTGATGCATTTATATCATCTGATAATATTGATCCTACTTCGAAATTATATTCAGTTACATGATTGTCAATGGGTGTTTCTGACTTAATTGGTGTTGGCTTATTCCATGCGTACATTTTACGTACTTCAACTGGTACACTTATATCACTTGAATTAGATAAATTACGTGGTAATACAGAGTTTAATAAATTATGAACATAATTATCACGAGTTACCTTATCAATAAAACCGTTC                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CD167502             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       TGTATT ATCAATACAGAGATTAGACATTGCCCATGCCGATGTCTGATCTGATC GACTAACATCTGGTAAATTCAAATCTATTTCAGGTGATTTATCGAAACATTCAGCTTGTAAACTATCGTCTTCCAGTGTATTAGGACTCA AAAGTGGGTAAGAATGATCGGATGAATTAAGTTGTCCAGGTGATGCATTTATATCATCTGATAATATTGATCCTACTTCGAAATTATATTCAGTTACATGATTGTCAATGGGTGTTTCTGACTTAATTGGTGTTGGCTTACTCCAGGCGTACATCAGACGTACCTCTACTGG                                                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CD167604             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                            catacaGATTCATAAAGTGGGTAAGAATGATCGGATGAATTAAGTTGTCCAGGTGATGCATTTATATCATCTGATAATATTGATCCTACTTCGAAATTATATTCAGTTACATGATTGTCAATGGGTGTTTCTGACTTAATTGGTGTTGGCTTATTCCATGCGTACATTTTACGTACTTCAACTGGTACACTTATATC                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL CD199282             [                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       CCATGCGTACATTTTACGTACTTCAACTGGTACACTTATATCACTTGAATTAGATAAATTACGTGGTAATACAGAGTTTAATAAATTATGAACATAATTGTCACGAGTTACCTTATCAATAGAACCGTTCACTGAATCCGACTGATATGAATCCAATAAGGTAAATGTTACAGGACTAGATTCGGTACATAAATATCCAGGATCAGTAAATAATGCTGTAGAAATTGGAATTACTTCCGTATCAGTTAAAGGTTTACAATTTAATG]
consensusID : consensus_9981#2 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 1 consensus length = 539 fasta sequence 
                              [AGCCTTTCAGANCACATATGTACCAAAAGCTGTTCGTTTTGCTGATGCTCTAGGACTTGATTTAGCAACTGAACGACATGTATATGATTCTGAAGCTCCACCAAAAATACCAGCTTCTGCTATATCACATTTACAATTAGATTCTGATGAATCCATTGCAAAAATTGGTGCAAAACAATTTGGTTTATGTTTCTCACAACCAGGTTTAGCATCTAATTTTATTCGTCGAGTACTTTCCAGTAATGTATGCCTAGAAGATTGTCATATTGATATGCAACGTTGTATATTAACTGGTACAATAAGAGTTAAAAGTTTTGGTTATGAGAAACATGTTACTATTCGCATTACATATAACAACTGGATTACGTTTTTCGATACATCTGCATCATACATTCAAGGATCATATGATGGTGTAACGGATAAATTTTCATTTAGTTTAATCTTTCCTGATACAATGGTACCAGGTGATAAAGCACAATTTGCTATACGATATGAAACACATACTGGTGATGGTCACAAGATACTTTGGGGTACCGGAG]
[-] EMBL CD066029             [AGCCTTTCAGANCACATATGTACCAAAAGCTGTTCGTTTTGCTGATGCTCTAGGACTTGATTTAGCAACTGAACGACATGTATATGATTCTGAAGCTCCACCAAAAATACCAGCTTCTGCTATATCACATTTACAATTAGATTCTGATGAATCCATTGCAAAAATTGGTGCAAAACAATTTGGTTTATGTTTCTCACAACCAGGTTTAGCATCTAATTTTATTCGTCGAGTACTTTCCAGTAATGTATGCCTAGAAGATTGTCATATTGATATGCAACGTTGTATATTAACTGGTACAATAAGAGTTAAAAGTTTTGGTTATGAGAAACATGTTACTATTCGCATTACATATAACAACTGGATTACGTTTTTCGATACATCTGCATCATACATTCAAGGATCATATGATGGTGTAACGGATAAATTTTCATTTAGTTTAATCTTTCCTGATACAATGGTACCAGGTGATAAAGCACAATTTGCTATACGATATGAAACACATACTGGTGATGGTCACAAGATACTTTGGGGTACCGGAG]
consensus multiple alignement with clustalw CLUSTAL W (1.82) multiple sequence alignment
consensus_9981#0      ATTCGCACCGGTGCACGTTGTGTATTAACTGGTACAATAAGAGTTAAAAGTTTTGGTTAT 60
consensus_9981#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9981#1      ------------------------------------------------------------
                                                                                  
consensus_9981#0      GAGAAACATGTTACTATTCGCATTACATATAACAACTGGATTACGTTTTTCGATACATCT 120
consensus_9981#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9981#1      -----------------------------------AAAACGAACAGCTTTTGGTACATAT 25
                                                                                  
consensus_9981#0      GCATCATACATTCAAGGATCATATGATGGTGTAACGGATAAATTTTCATTTAGTTTAATC 180
consensus_9981#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9981#1      GTGTCTGAAAGGCTTCTATTGGATTTTAGTG-AACTACTACGTTTTGGTTTAGT--AGTT 82
                                                                                  
consensus_9981#0      TTTCCTGATACAATGGTACCAGGTGATAAAGCACAATTTGCTATACGATATGAAACACAT 240
consensus_9981#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9981#1      TCAGGGGTTTCAACTATATCTTTTACTGAGAATGCTTGATTACCTTCATATGGTAAGAAG 142
                                                                                  
consensus_9981#0      ACTGGTGAACAATTTTGGGATAATAATCA--TGGTCAAAATTATTGTGTAACATGTTATG 298
consensus_9981#2      -------------------------------------AGCCTTTCAGANCACATATGTAC 23
consensus_9981#1      GTTGATAAATCTGCTGAATTCTTTTTTCGATTGTTGTTAATATTTGTATGACAGACAGGG 202
                                                                 *      ***       
consensus_9981#0      CGAAAGCCACGGATCTAGCTGGTGATGGATCA-TGGATGCATTATCTTTGATTTTCGTGT 357
consensus_9981#2      CAAAAGCTGTTCGTTTTGCTGATGCTCTAGGACTTGATTTAGCAACT--GAACGACATGT 81
consensus_9981#1      CTACGATCTCTG--CTAGGTCGTTGTAAGGAATTCGGCACAGGAGGTCGAGATG--ATAT 258
                      * *            * * *  *  *     * * *    *  *  *          * *
consensus_9981#0      TTTCAAATTGTGATGAACACTGTTAA---AATTATTTAT-CCAATTTTGATTGTTCCACA 413
consensus_9981#2      ATATGA-TTCTGA--AGCTCCACCAA---AAATA------CCAGCTTCTGCTATATCACA 129
consensus_9981#1      ATTGGAACTTTTATCTACTTTTTCAATGGAGCTAGCTGTTTCACTGGAGGGTGATAGGTC 318
                       *   *  * * *    *      **   *  **       **        *        
consensus_9981#0      TTCA-AACTATCATTTAATAACTTTAGTTTGTCTTAACCTTTTTTTCATGCATACATACA 472
consensus_9981#2      TTTACAATTAGATTCTGATGAATCCA--TTGCAAAAA-------TTGGTGCAAA-ACAAT 179
consensus_9981#1      TTCCGTATGCTTATTTGATAAAATC---TCACTTGAATCAGTATCTATTTCAT---TAGT 372
                      **    *      * * ** *       *      **        *  * **     *  
consensus_9981#0      TACACGCATGTGGACAAAAAATTGGTCCTTTAAAAAACCATATATCATCGCGCCAATCAT 532
consensus_9981#2      TTGGTTTATGTTTCTCACAACCAGGTTT-----AGCATCTAATTTTATT-CGTCGAGTAC 233
consensus_9981#1      TGTAT-TATCAATACAGAGATTAGACATTGCCCATGCCAATGTCTGATCTGATCGACTAA 431
                      *      **          *   *         *        * * **     * *  * 
consensus_9981#0      TCATTACTCAAGA-AACTCCAGTT-AGCTTTCATATATATATATATATATATATATATAT 590
consensus_9981#2      TTTCCAGTAATGT-ATGCCTAGAA-GATTGTCATATTGATATGCA-ACGT-------TGT 283
consensus_9981#1      CATCTGGTAAATTCAAATCTATTTCAGGTGATTTATCAAAACATTCAGCTTGTAAACTAT 491
                             * *    *   * *       *    ***  * *     *  *       * *
consensus_9981#0      ATATTAATTATTATAATAATTAATTAAACTGCCTTACATTCAAGATTCATCTTCATATTA 650
consensus_9981#2      ATATTAACTGGTACAATAAG-AGTTAAAA-GTTTTGGTTATGAGAAACATGTTACTATTC 341
consensus_9981#1      -CGTCTTCCAGTGTATTAGGACTCAAAAGTGGGTAAGAATGATCGGATGAATTAA-GTTG 549
                         *       *  * **       ***  *  *                 **    ** 
consensus_9981#0      GTCAGTGCACACAATTAGTCTTTCATCGGG--ATTTTTTTTTTTCACTATATTTCTTTTG 708
consensus_9981#2      G-CATTACATATAA---------CAACTGG--ATTACGTTTTTCGA------TACATCTG 383
consensus_9981#1      TCCAGGTGATGCATTTA---TATCATCTGATAATATTGATCCTACTTCGAAATTATATTC 606
                        **    *   *          ** * *   **     *  *         *     * 
consensus_9981#0      AAATTTTCATTCTTAAATTTAGAATTTCAAGTTAACAATAAAATATTCCCTTATCATCCC 768
consensus_9981#2      CATCATACATTCAAGGATC--ATATGATGGTGTAACGGATAAATTTTCATTTAGTTT--- 438
consensus_9981#1      AGTTACATGATTGTCAATGGGTGTTTCTGACTTAATTGGTGTTGGCTTATTCCATGCGTA 666
                                *     **      *       ***           *   *         
consensus_9981#0      CGATTTAATATGTATTTACAGAACCTTAAAATAAAAAAAAAGTGATTTTCCCCTATAC-A 827
consensus_9981#2      -AATCTTTCCTGATACAATGGTACCAGGTGATAAAGCACAATTTGCTATACGATATGA-A 496
consensus_9981#1      -CATTTTACGTACTTCAACTGGTACACTTATATCACTTGAATTAGATAAATTACGTGGTA 725
                        ** *    *      *  *   *         *    ** *   *        *   *
consensus_9981#0      GAACACGTTCANGTGAGGTGTAATGTTTTTGATCGGAAGTGAGATATTTATGGTGATCAA 887
consensus_9981#2      ACACATACTGGTGATGGTCACAAGATACTTTGGGGTACCGGAG----------------- 539
consensus_9981#1      ATACAGAGTTTAATAAATTATGAACATAATTATCAC----GAGTTACCTTATCAATAAAA 781
                        ***   *             *      *          ***                 
consensus_9981#0      CTGCCTTTGAATCCTATGTATTACGANTATAATAATAATCATTACTATTAACTATTATTA 947
consensus_9981#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9981#1      CCGTTCACTGAATCCGACTGATATGAATCCAATAAGGTAAATGTTACAGGACTAGATTCG 841
                                                                                  
consensus_9981#0      ACANGAGAAACATTGNTATCGATAATGTTTGTCTAATTTGCTGNAATAGCTGATAGATCG 1007
consensus_9981#2      ------------------------------------------------------------
consensus_9981#1      GTACATAAATATCCAGGATCAGTAAATAATGCTGTAGAAATTGGAATTACTTCCGTATCA 901
                                                                                  
consensus_9981#0      ACCAAAAAGAAATAACTTG--- 1026
consensus_9981#2      ----------------------
consensus_9981#1      GTTAAAGGTTTACAATTTAATG 923
                                            
 | 
| Copyright Thu Nov 6 12:32:27 CET 2003 Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) | ||||