These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_1528#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 3 consensus length = 810 fasta sequence [TTGCTGAGTTATTTGTGCAAGCTGTCTTGTTTGTGCCTTTTTTGATAGTCTTGATATCCAAGATTTGATGTGCAGCTTACGTTTAAATCCATTGTAATTGCAGTATATGCTCTTATAAATGAACACAATCAAATATGGGGGATCGGGGGTTGGCGTCCTTATCTTTCAGATATGTAAATTTTAAGGATAACTGTTGCCACCGCTGTGTGATTTGTGACTGTATTGAAAAGATGAACAGCATTCTTTCGTTGCCCTATATTTTCCCTTTTTTTTTCTAATGTTTTGTGCAGATATTTTTATTGTAAAATGAATGTTTTGTTTCTATCGGACACTAATCGGTCTCCAGTGGAACTACTTCATTCTGTATGTTTTGATCAGTATAAACCTTTAATTGTGTAGTTAAATTTCTGAAAGAGGAAAAAAAAAACCTTAGTTGTGTTTTAAAGGTTCCTGTTTGGCCTGCCATGGAAATTGTTTGGTCAGTTTTCTGTTGCTGTCGTGAAGGATTTGACTTGAACGAGACGTTTCATTGCTATTATGAAAGACTGACTGCCACTTTCAAACAATGTTTTCTTATATTCTTTATTTTTCTGCAGTAACATTTTAGTAGGTTCATTAAAAACACTATCCTTCATCGACATCTCTGAAGTCTCTGTAAAAAAGGAAAAAGCGGATTTCTTGAGTGTTGGACGACATCTTAACTGCTGTCAACAGCTTTCTTTGCAAATGGACGTTTCTTGGAGCATCACAATATCCACTTCTGTGTTTATTGAGAAGAATGAGTATTCTTAATAAAAAAAAAGTTCATTT] [+] EMBL CA588905 [TTGCTGAGTTATTTGTGCAAGCTGTCTTGTTTGTGCCTTTTTTGATAGTCTTGATATCCAAGATTTGATGTGCAGCTTATGTTTAAATCCATTGTAATTGCAGTATATGCTCTTATAAATGAACACAATCAAATATGGGGGATCGGGGGTTGGCGTCCTTATCTTTCAGATATGTAAATTTTAAGGATAACTGTTGCCACCGCTGTGTGATTTGTGACTGTATTGAAAAGATGAACAGCATTCTTTCGTTGCCCTATATTTTCCCTTTTTTTTTCTAATGTTTTGTGCAGATATTTTTATTGTAAAATGAATGTTTTGTTTCTATCGGACACTAATCGGTCTCCAGTGGAACTACTTCATTCTGTATGTTTTGATCAGTATAAACCTTTAATTGTGTAGTTAAATTTCTGAAAGAGGAAAAAAAAAACCTTAGTTGTGTTTTAAAGGTTCCTGTTTGGCCTGCCATGGAAATTGTTTGGTCAGTTTTCTGTTGCTGTCGTGAAGGATTTGACTTGAACGAGACGTTTCATTGCTATTATGAAAGACTGACTGCCACTTTCAAACAATGTTTTCTTATATTCTTTATTTTTC ] [+] EMBL CA333468 [ CTTGTTTGTGCCTTTTTTGATAGTCTTGATATCCAAGATTTGATGTGCAGCTTACGTTTAAATCCATTGTAATTGCAGTATATGCTCTTATAAATGAACACAATCAAATATGGGGGATCGGGGGTTGGCGTCCTTATCTTTCAGATATGTAAATTTTAAGGATAACTGTTGCCACCGCTGTGTGATTTGTGACTGTATTGAAAAGATGAACAGCATTCTTTCGTTGCCCTATATTTTCCCTTTTTTTTTCTAATGTTTTGTGCAGATATTTTTATTGTAAAATGAATGTTTTGTTTCTATCGGACACTAATCGGTCTCCAGTGGAACTACTTCATTCTGTATGTTTTGATCAGTATAAACCTTTAATTGTGTAGTTAAATT ] [-] EMBL CA332162 [ CTGTATTGAAAAGATGAACAGCATTCTTTCGTTGCCCTATATTTTCCCTTTTTTTTTCTAATGTTTTGTGCAGATATTTTTATTGTAAAATGAATGTTTTGTTTCTATCGGACACTAATCGGTCTCCAGTGGAACTACTTCATTCTGTATGTTTTGATCAGTATAAACCTTTAATTGTGTAGTTAAATTTCTGAAAGAGGAAAAAAAAAACCTTAGTTGTGTTTTAAAGGTTCCTGTTTGGCCTGCCATGGAAATTGTTTGGTCAGTTTTCTGTTGCTGTCGTGAAGGATTTGACTTGAACGAGACGTTTCATTGCTATTATGAAAGACTGACTGCCACTTTCAAACAATGTTTTCTTATATTCTTTATTTTTCTGCAGTAACATTTTAGTAGGTTCATTAAAAACACTATCCTTCATCGACATCTCTGAAGTCTCTGTAAAAAAGGAAAAAGCGGATTTCTTGAGTGTTGGACGACATCTTAACTGCTGTCAACAGCTTTCTTTGCAAATGGACGTTTCTTGGAGCATCACAATATCCACTTCTGTGTTTATTGAGAAGAATGAGTATTCTTAATAAAAAAAAAGTTCATTT] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |