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Takifugu rubripes
cluster # 2304 cluster # 2304       Sequences # 5       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2304#0 length = 629 sequences # 5  

consensusID : consensus_2304#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 5
consensus length = 629
fasta sequence
                              [TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAAGGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA]

[+] EMBL CA332001             [TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTT                                                                                                   ]
[+] EMBL CA331707             [      GCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACA                                          ]
[+] EMBL CA329207             [        CCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAAGGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA]
[-] EMBL CA847218             [                 TTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGGTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATTATGAATCATGTTATACGTCTTAGCTCTAGAAGTCTATTTTTTTTAAAGCA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                             ]
[-] EMBL CA846774             [                    TATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                       ]


>consensus_2304#0 TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGA AAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTA TTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAA AGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCT GGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCAT GGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCA CTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCAT AAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAAT GCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTG CCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAA GGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)