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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2304#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 5 consensus length = 629 fasta sequence
[TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAAGGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA]
[+] EMBL CA332001 [TGAAAGGCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTT ]
[+] EMBL CA331707 [ GCCCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACA ]
[+] EMBL CA329207 [ CCATTAAGATTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATCATGAATCATGTAAAGCCTCTTAGCTCTAGAATTCTATTTTTTTTAAAGCATGAACATGCCACCGTGGAAACTGTTATTCACTTTATATCTAACTACATTCATGGCTGGATCGACAGTTCACTACTAAAAGGCTGCAAGGCGGGACAAAAACTTTAGCACTTTGCATGGTAAGATCGTAAAAACGAGTACTGCATTGCTTCCGATATCAACTCTCTTCATTGCATCACTTTGGTATTGCATTTATACTTCACAATATTCTGCAAAGAAACAAAATGTACAACTGCATAAATATAAAATTCTTCCACTATGTTTAATGGTCAAAACATTCAGAGAGTTACACTAAAATGCTGTGATGAATTCAGCAAAACAAAAACCAAAAATAATAAAACTTAAGTTAGCACCGTTGCCAGTGTCAACTAACAGGCTGGTCACATTTCTACTACATTCAAGACAAAATCAATCAAAAGGCATGGAAAATAATAAAACCCCTTCACA]
[-] EMBL CA847218 [ TTTTATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGGTAAATATATATCTATCTTTTACATCAACATGAGCTCCTTTGAGTATTAGAGCCAATATTATGAATCATGTTATACGTCTTAGCTCTAGAAGTCTATTTTTTTTAAAGCA ]
[-] EMBL CA846774 [ TATTTGTTTCCGCTTTTAACTGGATGACAAATTTGATGGAAAGGTAGCATATGGTTAA ]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
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| Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |