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Takifugu rubripes
cluster # 2386 cluster # 2386       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2386#0 length = 813 sequences # 6  

consensusID : consensus_2386#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 813
fasta sequence
                              [AGGAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG-CTCC--CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGGTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG]

[+] EMBL CA589861             [AGAAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG CTCC  CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTG                                                                                                                                                                                    ]
[+] EMBL CA588156             [ GGTGATGCCCGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATCG  TAC  AGGACCTGAAGNAGAGNCTGGCTCCCCCGCCGCTCTCAGGGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCCCCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGGTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGAACGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGGCCACGACTTCCTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGGAGTCTTAACAAGTTCACCCAGGTCCTGATTACCGCCTTCAACATCCAGAGGGGGGAGGAAGGCCCGGACCGGCTGAACGTCATCACGGGACCCCTCACCGACTCTATC                                       ]
[+] EMBL CA588286             [ ccATCAAATTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG NCCCTTTCGAACTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCCACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGGTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG]
[+] EMBL CA588344             [   ATCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGGCCTCC  CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGATGTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACCATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCGACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCTACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGCGAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAGTTGGAT                           ]
[+] EMBL CA589871             [             CGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGG CTCC  CCGACCTGAAGCAGAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCT CATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTGCAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGT                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                ]
[+] EMBL FR0059893            [                                                                     GTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCTCGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGACACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGTATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATTCTCAGCTCTGCACTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAATGCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGTTGGGCTGGTGA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                   ]


>consensus_2386#0 AGGAGCTTCTTGCCGACGGCTTCTCCGCTACAGACGATCATGGCTCCCCGACCTGAAGCA GAGTCTGTCTCCCCCGCCGCTCTCAGTGAGAAGAGCTCCATTAAGGATGTGGTTCCGGCT CGCTCCACCATGGATCTCGTGGACGCGGACGATCCCTGGGACCTCCCAGATCTTATAGAC ACTGGGATCAAGTGGTCAGACCTGGACACCCGCGGGAAGATTCTGCGAGTTCTTACGGGT ATCGGGAAGGGAATTCTGCTGCTTGGATTTCTCTACGTGTTCATTTGCTCGCTGGATATT CTCAGCTCTGCATTCCAGTTAGTGGGAGGCAAAGCTGCTGGTGACATCTTCCAGGGCAAT GCGGTGTTGGCCAACCCTGTGGCTGGGCTGGTGATCGGGGTGTTAGTCACCGTGCTCGTG CAGAGCTCCAGCACTTCCTCCTCTATTGTGGTCAGCATGGTGTCCTCTGGAATACTGGAT GTCCAGACCGCGGTGCCGATTATCATGGGCGCCAACATCGGGACCTCTGTCACCAACACC ATCGTGGCCATGATGCAGGCGGGGGATCGAAACGAGTTCCGCAGGGCCTTTGCTGGGGCG ACCGTCCACGACTTCTTTAACTGGCTGTCGGTGTTGATCCTTCTGCCTCTGGAGGTGGCT ACAGGAGTTCTTTACAAGTTCACCCAGTTCCTGATTACGTCCTTCAACATCCAGAGTGGC GAGGATGCCCCGGACCTGCTGAACGTCATCACGGACCCTCTCACCGACTCTATCATTCAG GTGGATAAATCGGTCATCAATGACCTCGCTACG



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)