These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2389#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 669 fasta sequence [CGCGGGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT-AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] [+] EMBL CA588401 [CGTGCGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGACGTAGAAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAA ] [+] EMBL CA588680 [ CCGTTTAGAGAATCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGACGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGTAGCATGATTAAAAC AAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTT ] [+] EMBL CA588899 [ TGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCA ] [+] EMBL FR0058989 [ GCAAAATCATGCAGGCCACTGGGGAAATTCACNCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATACAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGGTGCAGGATGGTTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTCTGAAAAGCAGATCGGTTAAGGCTAAAATTGAc ] [+] EMBL CA588484 [ GTCCTTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTG CATAGGAAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACTAAAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGG TTAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAA ] [+] EMBL CA846243 [ ATGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTCTCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGACCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATCTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACGAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA] clustalw multiple alignements is not computed in this case |
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |