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Takifugu rubripes
cluster # 2389 cluster # 2389       Sequences # 6       consensus # 1


see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2389#0 length = 669 sequences # 6  

consensusID : consensus_2389#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 6
consensus length = 669
fasta sequence
                              [CGCGGGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT-AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]

[+] EMBL CA588401             [CGTGCGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGACGTAGAAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAA                              ]
[+] EMBL CA588680             [  CCGTTTAGAGAATCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGACGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGTAGCATGATTAAAAC AAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTT                                                                                                                                                                                                            ]
[+] EMBL CA588899             [                        TGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCA                                                                               ]
[+] EMBL FR0058989            [                                                   GCAAAATCATGCAGGCCACTGGGGAAATTCACNCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATACAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT  AAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGGTGCAGGATGGTTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTCTGAAAAGCAGATCGGTTAAGGCTAAAATTGAc                                                                                                                                                                                                                                                      ]
[+] EMBL CA588484             [                                                                 GTCCTTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTG CATAGGAAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACTAAAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGG TTAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAA                                                                                                                                                         ]
[+] EMBL CA846243             [                                                                                                                  ATGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTCTCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGACCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATCTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACGAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]


>consensus_2389#0 CGCGGGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCA TGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAG CCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTG GAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTC TGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACTAAAAAAAAAGACG AGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAAC AAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATT GAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGC GGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTC ATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTG AACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA AAAAAAAAA



clustalw multiple alignements is not computed in this case


Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)