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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2389#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 669 fasta sequence
[CGCGGGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT-AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
[+] EMBL CA588401 [CGTGCGTTAGAGAGTCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGAGGACGTAGAAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAA ]
[+] EMBL CA588680 [ CCGTTTAGAGAATCCGTGACAATGGAGGACAATCGATTCGGACGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGTAGCATGATTAAAAC AAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTT ]
[+] EMBL CA588899 [ TGGAGGACAATCGATTCGGAGGATGGAGCAAAATCATGCAGGCCACTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATAGAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACAAGTCA ]
[+] EMBL FR0058989 [ GCAAAATCATGCAGGCCACTGGGGAAATTCACNCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTGATACAGGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGGTGCAGGATGGTTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTCTGAAAAGCAGATCGGTTAAGGCTAAAATTGAc ]
[+] EMBL CA588484 [ GTCCTTGAAGAAATTCAGGCAAAATGTGATCAGTTGAAACCTGTG CATAGGAAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTGCCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGATCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACTAAAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGG TTAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATTTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAA ]
[+] EMBL CA846243 [ ATGCAGCCGAGAAGAAGGTTTTTAAGGTCTTTAAAGCAGTTCTCTACCGGGATCAAATTGTGTGTGGAATCAACTACATCGTTAAGATTTTTGTGGGGCAGGACCTTTTCTTCCATGTGATGTTTCTGGAAACTCCTTCTGCTGATGGATGGCTGTCGTTGACTAGTGTGACT AAAAAAAAAGACGAGGACCCCCTCGTGCCCGTCTAGTGTGCAGCCACACCTGCAGCTGCAGCATGATTAAAACAAAAAAAATACATTTATTCATTCTTTTTCTTTGAAAAGCAGATCGTTTAAGGCTAAAATTGAACCTTTAATCCTAGATTTCAGTTTTGGGGGCAATTTAGTCTTTGATTAAACTAAATGCGGGTTTTAGTCATCTTAGTGTCCAGAAAAAAAGAAAGCTGTCATCTAGAATAATCACCTCATTTACTAATCATATCTGAGTTGTGTTTTCATTATATTGTTCACGAGTCAACAAAAATTGAACTGTCACTGTCATTAATAAAATGACTTCAAACATAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
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| Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |