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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2406#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 6 consensus length = 931 fasta sequence
[GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGGATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC-TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTCTGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCCTTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTCTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTGGACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCGGTAAATAAAGGTGGTCGATAAATGTTAAAAA]
[+] EMBL CA333451 [GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGGATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGT ]
[+] EMBL CA333500 [GCACGAGCTCTGGAGCAACTTATTGGTAGAGGTTTTGTACTTGGAAACAAAGTAGCAGGGATGTTTTCATACAGTATTTTTTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTGTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAATACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACGCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGA ]
[+] EMBL FR0061457 [ AGCTGGGATGGTTTCATACAGTATGGGGTTCAGAGGTTATGCACCGTGCGTCGCTCTATTTGCTGCTTGAAAATATGCATTTTGAGATGTTAGCTTAAGGAGAGCGTCTTTAGCTTGGTGTGAGCCATCGCCTGCTCGCTTTAAAAAACACTGCACTGTGGGGCTCCGACCCAAGCTCATAAGCACTGCCACTCTAGGTTGTTCCTGATGACGTAATCACTCCACTATTTGAGATTTTCCAGAACCGGTTTAGTTTCTTTTATCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTCTTTCTATGATa ]
[-] EMBL CA332544 [ CGTTTTAGTTTCTTTTAGCACTGGGATATCGTCTTGGAGGTCTATTC TTCTATGATCAGCCTCTTATCTATTTTCATAAATTCTTTCATAGACTGTATTTCACATGGTGCAACTAGGACATGCCTTATTCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCACCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTCTGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCCTTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTCTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTGGACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCGGTAAATAAAGGT ]
[+] EMBL BU808468 [ TCTTTGAACTGAGGATGCCGTCTACATTTGAATGCATATATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCACCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCA ]
[-] EMBL CA332504 [ ATAAAACGGCGCTTAAATCTATTTTATGGTTCTTTTTGTACTAAGCTGAGACATGAGGTCCCCCTTGAGGAACACGGACTCTCGACGTGCCGGTCATAGGACGTCAGGGAGATAAATTTGGAGGAATAACCGCGTGATGTTTTTGGGATGCTGTTCATCCTCGCCTGTTTTGTCTTTGATTACCGTGTGCAGGATTATCAACGCCTTTGCTTTCAAGAGTGACGGGAGGGTGGGGGAATGTCTCCCCCACAAGTCTGTTCCTGCACTCTTCTGTGCTCATCCTTTCCTCAAGTGTTGACTTGACCTGTAGCATCCTTCCTTCCACGGTGGCACCACTGCATAATTGCTTTGAAAGAAATACAGTTCATTGTGTTGGACAACTGAAGTGCTTTAGGAATGTGTGAAATCCAGCCCTGCTATTGGAGACCTCTGTCGGTAAATAAAGGTGGTCGATAAATGTTAAAAA]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
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| Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |