Home
Who am I
Technology
EST Assembly
Contact

These datas are free for academic use only, please contact me for any other use.

Takifugu rubripes
cluster # 2552 cluster # 2552       Sequences # 7       consensus # 1

see consensus multiple alignment with clustalw

Direct access to contigs :
consensus_2552#0 length = 504 sequences # 7  
consensusID : consensus_2552#0
NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site !
NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site !
Sequences nbr = 7
consensus length = 504
fasta sequence 
                              [TTGGATTTGAAAGTCATTTATTAAGACAATGTACAAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGCGGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTACCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTT]

[+] EMBL CA329586             [TTGGATTTGAAAGTCATTTATTAAGACAATGTACAAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGCGGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTG                                                                                                                                                                                                                                                                                                         ]
[-] EMBL CA846969             [    ATTTGAAAGTCATTTATTAAGACAATGTACAAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGCGGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGC                                                                                                                                                                                                                                        ]
[+] EMBL CA331362             [        GAAAGTCATTTATTAAGACAATGCCCAAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGCGGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTACCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGAAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATG                  ]
[+] EMBL CA331190             [          AAGTCATTTATTAAGACTATGTACCAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGCGGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTACCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGAAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGC                 ]
[-] EMBL CA846667             [             TCATTTATTAAGACAATGTACAAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGCGGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAA                                                                                                                                                                                                                                                                                                                                        ]
[-] EMBL CA329980             [                                                              ttTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGAAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATTCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGATCGCTCATAAAAAAGTGAGTTACTGTAATTATCCTAACTGGGTACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAGCTGGAAATGCTCATCTTTGAGTGAGTT]
[-] EMBL FR0057674            [                                                                          ACTGAAACTACCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGCGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAG                                                 ]




>consensus_2552#0
TTGGATTTGAAAGTCATTTATTAAGACAATGTACAAAAATAGTGGCACGACAGGAAGTGC
GGGATGTCTTAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACT
GTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGG
GAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAG
TGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAACGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTAT
CCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTACCCTAACTGGGAATGCTC
ATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTAC
TGTAACTATCCTAACTGGGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTTACTGTAACTATCCTAACTG
GGAATGCTCATCTTTGAGTGAGTT

clustalw multiple alignements is not computed in this case
Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner    (hubert.wassner@noos.fr)