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These datas are free for academic use only, please contact me for any other use. Takifugu rubripes see consensus multiple alignment with clustalw Direct access to contigs :
consensusID : consensus_2597#0 NCBI blastX ! send the sequence to the NCBI site ! NCBI blastN ! send the sequence to the NCBI site ! Sequences nbr = 8 consensus length = 578 fasta sequence
[GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAATAAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG]
[-] EMBL FR0056683 [GCCAAAAATTGGGTTCCGGGCCCCCCCCGGGGTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTTGCATTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGG ]
[+] EMBL CA332534 [ TTTTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAATGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCGTCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAA ]
[+] EMBL CA332177 [ TTTTTGTTGTTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAA TTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACA ]
[+] EMBL CA331906 [ TTGGTGGTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAA ]
[+] EMBL CA333003 [ TTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTCAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTG ]
[+] EMBL CA331946 [ gTTTTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAG ]
[+] EMBL CA332602 [ TTTTATTTAAAAGCCATTTGTGTGAGATTTTCAGGCGGCACAACTGGCATAGTACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAATGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAATTTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCGTCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCT ]
[-] EMBL CA845395 [ TACAGTTTGAATGAATGCAGGCATGATAGAAACCTAAAGATGGAGTGTACGGGCGTAAAATATAGTCGTTGTGAACAAAAACGAGACACACTAACGCAACAGTAGAACGTTAAACTGTCTAATGTTGGTGCTGACAAATGGCTTCATTTCCTAATTTATCGACTTAAATCAAAAATATAAAGGCAACATTAGCTAAAACTAATTAA TTTTTTTTAAAAACCCAAGTCCATCAATTAAAAATCTACAGGAACTATTTGGCTACAGATTGCTGGGCCCAGCTGTGACTGCCATTCAGACGGGTAACCATGGCAACCTTGTGGGGGATAATTTTGTTTTTTGGCACTGAAGTTAAAAGTCTTAAAACAAAAACAGGAAGTGCTTTGCAGGTAAGAAAGAGTCACACAGGTAGAAATAAAGCCTGGGGCCGGCGTTTGCTCAGAAACGTTTTCGG]
clustalw multiple alignements is not computed in this case |
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| Data build on Sat Aug 9 00:50:02 CEST 2003 by Hubert Wassner (hubert.wassner@noos.fr) |